More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2130 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2130  ABC transporter-like protein  100 
 
 		 207 aa  411  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.167509  normal  0.249428 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2073  ABC transporter related protein  70.39 
 
 		 236 aa  286  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0967  ABC transporter related  47.45 
 
 		 261 aa  174  6e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.205736  normal  0.507807 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0425  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.24 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2202  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.63 
 
 		 227 aa  167  8e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.15426 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2913  ABC transporter related  44.33 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  45.56 
 
 		 224 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.66 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.66 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.66 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.66 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.66 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  40.38 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  41.99 
 
 		 223 aa  158  4e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 228 aa  158  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  40.38 
 
 		 224 aa  158  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1692  ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 		 219 aa  157  8e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.623229 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  46.2 
 
 		 229 aa  157  8e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  46.2 
 
 		 229 aa  157  9e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  44.44 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  43.69 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.69 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  43.69 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  43.68 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.69 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.69 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.69 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.06 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.69 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  43.92 
 
 		 235 aa  155  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.69 
 
 		 233 aa  155  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.79 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0943  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.83 
 
 		 227 aa  155  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.75 
 
 		 234 aa  155  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.75 
 
 		 234 aa  155  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.75 
 
 		 234 aa  155  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.06 
 
 		 235 aa  154  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.28 
 
 		 233 aa  154  7e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02303  putative Lipoprotein releasing system ATP-binding component of ABC transporter  42.41 
 
 		 232 aa  154  7e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0483  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  44.1 
 
 		 231 aa  153  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0642  ABC transporter related  44.1 
 
 		 231 aa  153  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2748  ABC transporter component  44.55 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00767275  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1251  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.5 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.72 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  42.86 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0982  ABC transporter related protein  42.5 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.452379 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1250  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  42.27 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.69 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  40.1 
 
 		 242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1173  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.79 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.659944  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  43.68 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0165  ABC transporter, ATP-binding protein  42.71 
 
 		 281 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3351  ABC transporter related  41.18 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  36.89 
 
 		 225 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.78 
 
 		 225 aa  151  7e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711904  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3231  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 258 aa  151  8e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15277  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2040  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.16 
 
 		 226 aa  150  8.999999999999999e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1598  ABC transporter related  43.22 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3030  ABC transporter related  45.6 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0284091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3012  ABC transporter related  40.1 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.134737 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  44.12 
 
 		 237 aa  149  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  42.86 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  41.46 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0550  ABC transporter related  44.92 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0929666  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  42.02 
 
 		 224 aa  148  5e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3192  ABC transporter related protein  42.44 
 
 		 243 aa  148  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110755  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  42.33 
 
 		 249 aa  148  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2958  ABC transporter ATP-binding protein  41.49 
 
 		 224 aa  148  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0445  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  36.55 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.878124  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.18 
 
 		 231 aa  148  7e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1619  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.44 
 
 		 235 aa  148  7e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.281163  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1796  ABC transporter related protein  44.06 
 
 		 229 aa  147  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1816  ABC transporter, ATP-binding protein  44.62 
 
 		 224 aa  147  9e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932395  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0090  DevA family ABC exporter ATP-binding subunit  37.86 
 
 		 242 aa  147  9e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1123  ABC transporter related  41.95 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0137163  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  38.73 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.2 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  42.93 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1739  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.96 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  40 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0782  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit, LolD  40 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000690329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  42.72 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  42.39 
 
 		 249 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.46 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  42.55 
 
 		 249 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  41.18 
 
 		 230 aa  145  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2206  ABC transporter related  42.63 
 
 		 240 aa  145  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  40.32 
 
 		 240 aa  146  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  44.26 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.49 
 
 		 233 aa  145  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  42.93 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3158  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  42.44 
 
 		 228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.669383  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  42.65 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0455  ABC transporter related  37.31 
 
 		 210 aa  145  4.0000000000000006e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00559773  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1272  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  42.16 
 
 		 228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.708247  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  44.86 
 
 		 239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2735  ABC transporter related  40.39 
 
 		 223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.31749  normal  0.728727 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  44.55 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3020  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  42.44 
 
 		 228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.171468  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2397  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.53 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>