More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1315 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1315  ABC transporter-related protein  100 
 
 
222 aa  438  9.999999999999999e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.26423  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2172  ABC transporter related protein  56.76 
 
 
222 aa  248  7e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00192331  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0512  ABC transporter, ATP-binding protein  52.91 
 
 
215 aa  205  4e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0694  ABC transporter related protein  48.86 
 
 
225 aa  205  5e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1841  ABC transporter related  47.78 
 
 
224 aa  200  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0297689  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0441  ABC transporter, ATPase subunit  41.44 
 
 
228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3639  ABC transporter related  43.24 
 
 
228 aa  198  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1881  (3R)-hydroxymyristoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase ((3R)-hydroxymyristoyl ACP dehydrase)  45.5 
 
 
222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.398507  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2817  ABC transporter related  40.99 
 
 
247 aa  196  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1261  ABC transporter, ATP-binding protein  42.99 
 
 
227 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3589  ABC transporter related protein  42.34 
 
 
228 aa  195  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0475  ABC transporter-related protein  40.09 
 
 
228 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.761135  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0470  ABC transporter related  40.09 
 
 
228 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0681  ABC transporter related  42.79 
 
 
232 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1471  ABC transporter related  38.98 
 
 
242 aa  186  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.51412  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  44.06 
 
 
234 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  43.84 
 
 
232 aa  179  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  44.55 
 
 
230 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  44.28 
 
 
220 aa  175  5e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  41.44 
 
 
226 aa  174  9e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  40.54 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  44.55 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  44.06 
 
 
642 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  44.69 
 
 
225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  41.87 
 
 
251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  45.37 
 
 
255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  40.09 
 
 
221 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  42.08 
 
 
222 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  41.26 
 
 
653 aa  171  7.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  46.83 
 
 
225 aa  171  7.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  44 
 
 
219 aa  170  2e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  40.09 
 
 
229 aa  170  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  41.38 
 
 
657 aa  170  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1370  ABC transporter related  44.28 
 
 
232 aa  169  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000531133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0083  ABC transporter related  42.05 
 
 
228 aa  169  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  41.58 
 
 
222 aa  168  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  40.89 
 
 
408 aa  168  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  42.15 
 
 
252 aa  168  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  46.34 
 
 
225 aa  167  9e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  40.09 
 
 
225 aa  167  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  39.46 
 
 
238 aa  166  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  41.44 
 
 
642 aa  166  2e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  41.41 
 
 
227 aa  166  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0253  ABC transporter related  40.89 
 
 
229 aa  166  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.588254 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  46.53 
 
 
229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3644  ABC transporter related  40.59 
 
 
221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  40.89 
 
 
229 aa  166  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3711  ABC transporter related  42.57 
 
 
235 aa  165  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.587902 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0917  ABC transporter-related protein  39.13 
 
 
245 aa  165  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  40.18 
 
 
234 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  42.79 
 
 
226 aa  165  5.9999999999999996e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  40.18 
 
 
234 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1647  ABC transporter related  43.07 
 
 
226 aa  164  8e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.204823  hitchhiker  0.000330012 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3482  ABC transporter related protein  43.9 
 
 
237 aa  164  9e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.782021  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  43.78 
 
 
228 aa  164  9e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  43.07 
 
 
235 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  41.26 
 
 
222 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  41.58 
 
 
228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  40.38 
 
 
228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  43.01 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3004  cell division ATP-binding protein FtsE  42.79 
 
 
228 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000252068  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  43.39 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  46.97 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  41.79 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3332  ABC transporter related  42.31 
 
 
259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  39.01 
 
 
235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2021  ABC transporter related  42.08 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4354  ABC transporter related  38.57 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3710  ABC transporter foramino acid ATP-binding protein  43.05 
 
 
229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  41.79 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  40.1 
 
 
228 aa  162  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  40.1 
 
 
241 aa  162  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  40 
 
 
288 aa  162  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  39.64 
 
 
233 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  40.2 
 
 
235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  40.09 
 
 
222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  40.99 
 
 
228 aa  161  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0270  ABC transporter related  37.22 
 
 
228 aa  161  6e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0060  ABC transporter related  43.94 
 
 
232 aa  161  6e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  43.2 
 
 
228 aa  161  7e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0951  ABC transporter related  41.29 
 
 
234 aa  161  7e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  41.96 
 
 
234 aa  160  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0775  ABC transporter, ATP-binding protein  45.32 
 
 
243 aa  160  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3189  cell division ATP-binding protein FtsE  42.79 
 
 
232 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1252  ABC transporter related  42.29 
 
 
234 aa  160  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.252759 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  42.57 
 
 
234 aa  160  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.11 
 
 
233 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.11 
 
 
233 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.11 
 
 
233 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.11 
 
 
233 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  41.38 
 
 
241 aa  160  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.11 
 
 
233 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2439  ABC transporter related  41.87 
 
 
280 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110449  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  40.1 
 
 
226 aa  160  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  39.91 
 
 
648 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0523  ABC transporter related  42.16 
 
 
254 aa  159  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  39.91 
 
 
648 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  44.72 
 
 
225 aa  160  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1657  ABC transporter related  42.57 
 
 
258 aa  159  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>