More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1471 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1471  ABC transporter related  100 
 
 
242 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.51412  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2817  ABC transporter related  60.59 
 
 
247 aa  290  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3639  ABC transporter related  55.08 
 
 
228 aa  263  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3589  ABC transporter related protein  55.08 
 
 
228 aa  256  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1261  ABC transporter, ATP-binding protein  51.9 
 
 
227 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1841  ABC transporter related  49.36 
 
 
224 aa  233  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0297689  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0681  ABC transporter related  49.15 
 
 
232 aa  228  6e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0441  ABC transporter, ATPase subunit  50.42 
 
 
228 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123309  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0475  ABC transporter-related protein  50 
 
 
228 aa  223  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.761135  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0470  ABC transporter related  49.15 
 
 
228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2172  ABC transporter related protein  42.68 
 
 
222 aa  191  7e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00192331  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1315  ABC transporter-related protein  38.98 
 
 
222 aa  186  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.26423  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0512  ABC transporter, ATP-binding protein  41.3 
 
 
215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  40.08 
 
 
225 aa  168  6e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  38.46 
 
 
408 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  37.87 
 
 
248 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  37.87 
 
 
248 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  37.71 
 
 
642 aa  158  7e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  36.93 
 
 
230 aa  158  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  39.64 
 
 
241 aa  158  8e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  36.86 
 
 
653 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  38.3 
 
 
220 aa  156  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1024  ABC transporter related  38.77 
 
 
234 aa  156  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.306992 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0270  ABC transporter related  34.98 
 
 
228 aa  155  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.72676  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  39.33 
 
 
224 aa  155  4e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  39.15 
 
 
253 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  35.74 
 
 
240 aa  154  9e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  39.15 
 
 
253 aa  154  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0694  ABC transporter related protein  35.19 
 
 
225 aa  154  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  38.14 
 
 
236 aa  153  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4048  ABC transporter-related protein  39.75 
 
 
237 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  38.08 
 
 
225 aa  153  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  38.4 
 
 
228 aa  153  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4081  ABC transporter related  39.75 
 
 
237 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0097  macrolide-specific ABC-type efflux carrier MacB  37.29 
 
 
668 aa  153  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  36.89 
 
 
237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  40.93 
 
 
236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  36.51 
 
 
228 aa  152  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  38.59 
 
 
228 aa  152  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  35.75 
 
 
682 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  35.75 
 
 
682 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  34.71 
 
 
254 aa  152  5.9999999999999996e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  36.17 
 
 
230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  38.91 
 
 
653 aa  151  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  35.75 
 
 
667 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  35.75 
 
 
667 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1881  (3R)-hydroxymyristoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase ((3R)-hydroxymyristoyl ACP dehydrase)  35.17 
 
 
222 aa  151  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.398507  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  36.86 
 
 
642 aa  151  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0229  ABC transporter related  36.89 
 
 
264 aa  151  1e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.772392  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3939  ABC transporter, ATPase subunit  38.91 
 
 
236 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.920707  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  39.17 
 
 
230 aa  150  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  36.02 
 
 
238 aa  150  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  36.63 
 
 
259 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3761  ABC transporter related protein  35.42 
 
 
265 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  36.59 
 
 
252 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  37.66 
 
 
654 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  37.08 
 
 
235 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1516  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.95 
 
 
230 aa  149  3e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  35.17 
 
 
640 aa  149  3e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  35.02 
 
 
653 aa  149  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0366  ABC-type transport system, ATPase component PhnL  37.39 
 
 
245 aa  149  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  37.5 
 
 
235 aa  149  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  35.44 
 
 
648 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  35.29 
 
 
648 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  35.29 
 
 
648 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  33.88 
 
 
252 aa  149  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  34.71 
 
 
652 aa  149  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  35.17 
 
 
648 aa  148  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  35.98 
 
 
226 aa  148  8e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  40 
 
 
707 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  38.02 
 
 
286 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  37.86 
 
 
230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  34.73 
 
 
239 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  34.02 
 
 
648 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1252  ABC transporter related  36.67 
 
 
234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.252759 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  35.71 
 
 
227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1176  ABC transporter related  35.68 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000377551 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  38.24 
 
 
242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  36.78 
 
 
228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  36.1 
 
 
234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  34.02 
 
 
648 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  35.02 
 
 
648 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  35.98 
 
 
246 aa  146  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  36.6 
 
 
655 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  36.02 
 
 
241 aa  146  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  34.87 
 
 
648 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1821  ABC transporter-related protein  36.86 
 
 
223 aa  146  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.373636  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  35 
 
 
654 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  35 
 
 
288 aa  145  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  35.95 
 
 
227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  34.38 
 
 
656 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  36.44 
 
 
241 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  34.47 
 
 
233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  35.86 
 
 
232 aa  145  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  35.42 
 
 
228 aa  145  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0833  ABC transporter related  33.33 
 
 
224 aa  145  5e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  37.39 
 
 
650 aa  145  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  36.6 
 
 
237 aa  145  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  34.73 
 
 
249 aa  145  5e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  38.53 
 
 
220 aa  145  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.271834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>