More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0470 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0470  ABC transporter related  100 
 
 
228 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0475  ABC transporter-related protein  98.25 
 
 
228 aa  428  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.761135  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0441  ABC transporter, ATPase subunit  95.61 
 
 
228 aa  400  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123309  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2817  ABC transporter related  54.91 
 
 
247 aa  248  5e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3589  ABC transporter related protein  54.71 
 
 
228 aa  247  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3639  ABC transporter related  53.81 
 
 
228 aa  247  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1261  ABC transporter, ATP-binding protein  53.95 
 
 
227 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1841  ABC transporter related  49.32 
 
 
224 aa  230  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0297689  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1471  ABC transporter related  49.15 
 
 
242 aa  226  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.51412  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0681  ABC transporter related  50.9 
 
 
232 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1315  ABC transporter-related protein  40.09 
 
 
222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.26423  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0512  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 
215 aa  188  5e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  44.8 
 
 
233 aa  188  7e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  41.67 
 
 
252 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0833  ABC transporter related  41.71 
 
 
224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  42.34 
 
 
230 aa  182  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  40.99 
 
 
225 aa  182  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  45.61 
 
 
650 aa  182  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  43.24 
 
 
234 aa  180  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  43.24 
 
 
234 aa  180  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  46.15 
 
 
228 aa  180  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  40.72 
 
 
248 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  40.72 
 
 
248 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  38.39 
 
 
241 aa  179  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  41.89 
 
 
225 aa  179  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  38.77 
 
 
642 aa  179  2.9999999999999997e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0269  ABC-type transport system, ATP-binding component  42.53 
 
 
227 aa  179  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2172  ABC transporter related protein  39.19 
 
 
222 aa  179  4e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00192331  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  40.99 
 
 
266 aa  178  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  44.84 
 
 
653 aa  179  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.67 
 
 
648 aa  178  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0776  ABC lipoprotein efflux transporter, ATPase subunit, LolD  46.02 
 
 
224 aa  177  8e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  43.3 
 
 
408 aa  178  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  48.65 
 
 
668 aa  177  8e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  48.65 
 
 
668 aa  177  8e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  43.11 
 
 
246 aa  177  9e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  43.63 
 
 
652 aa  177  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.44 
 
 
648 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.44 
 
 
648 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  40.54 
 
 
230 aa  176  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  37.95 
 
 
241 aa  176  3e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  40.27 
 
 
231 aa  176  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  43.89 
 
 
228 aa  176  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  45.09 
 
 
226 aa  175  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  41.18 
 
 
229 aa  176  4e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.23 
 
 
648 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  41.26 
 
 
256 aa  175  5e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  38.74 
 
 
235 aa  175  6e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  40.99 
 
 
648 aa  174  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  39.82 
 
 
225 aa  174  8e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  39.64 
 
 
223 aa  174  9e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  37.67 
 
 
642 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  38.12 
 
 
234 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  46.15 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2097  ABC transporter related protein  47.77 
 
 
231 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531887  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  37.39 
 
 
648 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  41.23 
 
 
252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  42.17 
 
 
237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  44.8 
 
 
654 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  37.39 
 
 
648 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  39.82 
 
 
246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  46.15 
 
 
253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  43.05 
 
 
654 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0694  ABC transporter related protein  36.99 
 
 
225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  39.91 
 
 
259 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  37.22 
 
 
234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.7 
 
 
238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  40.81 
 
 
242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  38.84 
 
 
227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  36.04 
 
 
249 aa  172  5e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  37.39 
 
 
241 aa  172  5e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1516  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.63 
 
 
230 aa  171  5.999999999999999e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  42.48 
 
 
666 aa  171  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  41.7 
 
 
224 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  42.27 
 
 
220 aa  171  6.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  41.18 
 
 
233 aa  171  6.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  39.9 
 
 
240 aa  171  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0894  ABC transporter related  43.22 
 
 
224 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.552759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  40.81 
 
 
224 aa  171  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  45.5 
 
 
230 aa  171  9e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  37.95 
 
 
234 aa  171  9e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3253  ABC transporter-related protein  53 
 
 
230 aa  171  9e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12235  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  41.7 
 
 
651 aa  170  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  41.67 
 
 
221 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  41.59 
 
 
252 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  42.08 
 
 
220 aa  170  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  42.79 
 
 
687 aa  169  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  36.4 
 
 
236 aa  170  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  42.34 
 
 
227 aa  169  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1838  ABC transporter related protein  41.55 
 
 
230 aa  169  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617058  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  43.56 
 
 
230 aa  169  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1414  ATPase  42.11 
 
 
241 aa  169  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  44.28 
 
 
240 aa  169  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  43.69 
 
 
650 aa  169  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  42.79 
 
 
681 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  41.44 
 
 
224 aa  169  3e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.64 
 
 
233 aa  169  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  42.79 
 
 
681 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3012  ABC transporter related  41.26 
 
 
217 aa  169  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.134737 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  40.36 
 
 
646 aa  169  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>