More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1838 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1838  ABC transporter related protein  100 
 
 		 230 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617058  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3012  ABC transporter related  48.18 
 
 		 217 aa  207  9e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.134737 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0481  ABC transporter related  48.51 
 
 		 241 aa  202  4e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0473  ABC transporter related  49.01 
 
 		 238 aa  202  5e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2535  ABC transporter related  47.51 
 
 		 230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.14801  normal  0.635881 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0264  ATPase  48.02 
 
 		 246 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2018  ABC transporter related  47.52 
 
 		 238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0425  ABC transporter related  49.75 
 
 		 234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  46.61 
 
 		 226 aa  195  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.24 
 
 		 233 aa  195  6e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.89 
 
 		 235 aa  194  8.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2979  ABC transporter related  45.78 
 
 		 226 aa  194  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.758866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1649  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.5 
 
 		 235 aa  194  8.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.45 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.89 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  47.03 
 
 		 240 aa  192  5e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.38 
 
 		 238 aa  191  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0833  ABC transporter related  44.2 
 
 		 224 aa  191  8e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.39 
 
 		 236 aa  191  8e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  43.75 
 
 		 388 aa  191  8e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  44.8 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  42.27 
 
 		 225 aa  191  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1692  ABC transporter, ATP-binding protein  46.54 
 
 		 219 aa  190  2e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.623229 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1905  ABC transporter  45.29 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.030671  hitchhiker  0.00477686 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  42.67 
 
 		 388 aa  188  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3937  ABC transporter related  46.85 
 
 		 230 aa  188  5.999999999999999e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.634814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1564  ABC transporter related protein  42.15 
 
 		 226 aa  187  9e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0229  ABC transporter related  43.04 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.772392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.24 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  44.78 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.09 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44 
 
 		 648 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44 
 
 		 648 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  46.23 
 
 		 241 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  44.2 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44 
 
 		 648 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.09 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44 
 
 		 648 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.09 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.09 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.09 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  44.09 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.09 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.09 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.09 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.18 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  46.23 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2233  ABC-type lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.04 
 
 		 201 aa  186  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.991286 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  44.09 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4308  ABC transporter related  46.23 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44 
 
 		 648 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  45.24 
 
 		 234 aa  185  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.79 
 
 		 232 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0461  ABC transporter-related protein  44.55 
 
 		 227 aa  186  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.880159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1696  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.79 
 
 		 232 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0743106 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.09 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.09 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0775  ABC transporter, ATP-binding protein  43.35 
 
 		 243 aa  185  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  44.55 
 
 		 239 aa  185  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.09 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.09 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  44.89 
 
 		 240 aa  185  6e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1619  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.59 
 
 		 235 aa  185  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.281163  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  43.75 
 
 		 224 aa  184  7e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4039  lipoprotein-releasing system ABC transporter ATP-binding protein  45.66 
 
 		 234 aa  184  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592839 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2110  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  44.84 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327519  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  42.99 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0341  ABC transporter related  44.39 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.73 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.73 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3180  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.12 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  40.35 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0276  ABC transporter related protein  43.38 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.27 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3521  ABC transporter related protein  44.86 
 
 		 254 aa  182  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.185776 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  43.44 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1672  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.34 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.50356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  41.15 
 
 		 664 aa  181  6e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3858  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.99 
 
 		 232 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2174  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  42.34 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0982  ABC transporter related protein  44.09 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.452379 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25440  putative lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.34 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  42.79 
 
 		 266 aa  180  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5400  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.24 
 
 		 238 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122098  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  43.69 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.18 
 
 		 236 aa  179  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  42.53 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  41.78 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  42.99 
 
 		 247 aa  179  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  39.74 
 
 		 235 aa  179  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5709  ABC transporter related  41.52 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.18 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  43.87 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0943  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.63 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1034  ABC transporter related  41.78 
 
 		 232 aa  179  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08621  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  43.24 
 
 		 222 aa  179  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0238  ABC transporter related  43.11 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.145385 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  42.59 
 
 		 260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>