More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4039 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4039  lipoprotein-releasing system ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 234 aa  460  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592839 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3747  ABC transporter related  67.26 
 
 		 226 aa  275  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2535  ABC transporter related  60.71 
 
 		 230 aa  255  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.14801  normal  0.635881 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0880  hypothetical protein  55.16 
 
 		 225 aa  218  7.999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0473  ABC transporter related  48.58 
 
 		 238 aa  216  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0911  hypothetical protein  54.22 
 
 		 225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2979  ABC transporter related  53.81 
 
 		 226 aa  211  7e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.758866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2018  ABC transporter related  48.11 
 
 		 238 aa  209  4e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  48.11 
 
 		 240 aa  208  7e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.95 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0481  ABC transporter related  47.8 
 
 		 241 aa  207  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0264  ATPase  48.79 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0461  ABC transporter-related protein  46.41 
 
 		 227 aa  204  7e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.880159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0425  ABC transporter related  46.89 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1838  ABC transporter related protein  45.66 
 
 		 230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617058  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  47.96 
 
 		 256 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  45.33 
 
 		 242 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  42.99 
 
 		 227 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  43.78 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.78 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  43.78 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.78 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.78 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.7 
 
 		 233 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.7 
 
 		 233 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.7 
 
 		 233 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.7 
 
 		 233 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.7 
 
 		 233 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.78 
 
 		 233 aa  192  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  43.5 
 
 		 225 aa  192  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.78 
 
 		 233 aa  192  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.78 
 
 		 233 aa  192  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.78 
 
 		 233 aa  192  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2202  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.23 
 
 		 227 aa  192  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.15426 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  44.4 
 
 		 230 aa  191  7e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.89 
 
 		 234 aa  191  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  46.26 
 
 		 388 aa  191  9e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.54 
 
 		 233 aa  190  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  43.61 
 
 		 246 aa  189  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1649  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.85 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.54 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  45.76 
 
 		 653 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.44 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.44 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.36 
 
 		 233 aa  188  7e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.61 
 
 		 238 aa  188  8e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3253  ABC transporter-related protein  48.03 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12235  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  41.07 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  46.58 
 
 		 650 aa  186  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 649 aa  186  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3157  ABC transporter related protein  49.33 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  43.95 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.19 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  45.58 
 
 		 319 aa  185  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29510  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.35 
 
 		 250 aa  185  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.14 
 
 		 233 aa  185  6e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  42.79 
 
 		 228 aa  185  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  43.3 
 
 		 229 aa  185  6e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0573  ABC transporter, ATP-binding protein  43.24 
 
 		 253 aa  184  7e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.64 
 
 		 239 aa  185  7e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  43.61 
 
 		 252 aa  184  8e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1760  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.76 
 
 		 226 aa  184  9e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  46.88 
 
 		 653 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  44.93 
 
 		 388 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  43.04 
 
 		 241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.71 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1739  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.75 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  45.81 
 
 		 647 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2039  ABC transporter related  47.06 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  45.33 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  43.56 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  44.93 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  47.83 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  47.83 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2439  ABC transporter related  44.93 
 
 		 280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2403  ABC transporter related  44.88 
 
 		 227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155422  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  43.61 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0824  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  48.26 
 
 		 227 aa  181  6e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.617096  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2863  ABC transporter related  46.48 
 
 		 232 aa  181  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.479401  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0782  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit, LolD  44.14 
 
 		 226 aa  181  7e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000690329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2835  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.18 
 
 		 225 aa  181  7e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.21843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.64 
 
 		 225 aa  181  8.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711904  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1657  ABC transporter related  43.98 
 
 		 258 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  43.33 
 
 		 228 aa  180  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3231  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.64 
 
 		 258 aa  180  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15277  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  43.11 
 
 		 228 aa  180  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  44.54 
 
 		 656 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  44.87 
 
 		 644 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  39.57 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1619  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.92 
 
 		 235 aa  179  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.281163  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3410  ABC transporter, ATPase subunit  46.26 
 
 		 239 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.072759  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  41.23 
 
 		 277 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  40.43 
 
 		 246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  43.67 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.51 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0437  ABC transporter related protein  43.56 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1564  ABC transporter related protein  40 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4410  ABC transporter related  47.03 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2361  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.23 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0014315  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1377  ABC transporter related  48.83 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0531793  normal  0.0760119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>