More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2535 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2535  ABC transporter related  100 
 
 		 230 aa  461  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.14801  normal  0.635881 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3747  ABC transporter related  61.16 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4039  lipoprotein-releasing system ABC transporter ATP-binding protein  60.71 
 
 		 234 aa  251  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592839 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  53.77 
 
 		 240 aa  238  8e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0425  ABC transporter related  54.37 
 
 		 234 aa  236  3e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2979  ABC transporter related  56.05 
 
 		 226 aa  232  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.758866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0264  ATPase  50.47 
 
 		 246 aa  231  8.000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0473  ABC transporter related  50.23 
 
 		 238 aa  231  9e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0481  ABC transporter related  50.94 
 
 		 241 aa  228  5e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2018  ABC transporter related  51.64 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0461  ABC transporter-related protein  51.72 
 
 		 227 aa  223  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.880159  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0880  hypothetical protein  57.27 
 
 		 225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1838  ABC transporter related protein  47.51 
 
 		 230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617058  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0911  hypothetical protein  57.08 
 
 		 225 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  46.46 
 
 		 256 aa  208  5e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0833  ABC transporter related  48.79 
 
 		 224 aa  205  4e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  49.34 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3559  ABC transporter related  49.55 
 
 		 239 aa  201  6e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3410  ABC transporter, ATPase subunit  53.5 
 
 		 239 aa  201  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.072759  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  48.64 
 
 		 388 aa  201  7e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  43.89 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  49.34 
 
 		 228 aa  199  3.9999999999999996e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  50.72 
 
 		 230 aa  198  6e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  47.27 
 
 		 388 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.47 
 
 		 227 aa  195  6e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  45.95 
 
 		 224 aa  195  6e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  47.72 
 
 		 235 aa  194  8.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  49.03 
 
 		 228 aa  194  8.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  47.11 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  46.32 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  45.98 
 
 		 238 aa  192  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  42.48 
 
 		 238 aa  191  6e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  47.49 
 
 		 246 aa  191  8e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  45.81 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 		 246 aa  189  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  47.51 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  46.43 
 
 		 715 aa  189  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  48.91 
 
 		 668 aa  189  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  48.91 
 
 		 668 aa  189  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  46.93 
 
 		 248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  50.24 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  46.19 
 
 		 242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  50.24 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  44 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  44 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  47.57 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1024  ABC transporter related  47.09 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.306992 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  44 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  47.26 
 
 		 277 aa  188  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  43.56 
 
 		 224 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  49.52 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 		 319 aa  188  7e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2771  ABC transporter, ATP-binding protein  45.25 
 
 		 223 aa  188  8e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  43.56 
 
 		 224 aa  187  8e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  43.11 
 
 		 224 aa  187  9e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  43.56 
 
 		 224 aa  187  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  43.56 
 
 		 224 aa  187  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  43.56 
 
 		 224 aa  187  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_002950  PG1692  ABC transporter, ATP-binding protein  40.99 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.623229 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  46.63 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2811  ABC transporter, ATP-binding protein  45.25 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179867  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  45.61 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1649  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.91 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  43.11 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  47.12 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2202  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.12 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.15426 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  46.19 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5400  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.39 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2403  ABC transporter related  46.31 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155422  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6611  ABC transporter related  48.64 
 
 		 660 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2837  ABC transporter ATP-binding protein  45.25 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000357321  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  45.45 
 
 		 640 aa  186  3e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3052  ABC transporter ATP-binding protein  45.25 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3064  ABC transporter, ATP-binding protein  45.25 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.22 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  44 
 
 		 225 aa  185  4e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  44 
 
 		 227 aa  186  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.26 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.26 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.26 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.26 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  45.95 
 
 		 230 aa  185  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.26 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3973  ABC transporter related protein  45.77 
 
 		 275 aa  185  6e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  42.48 
 
 		 239 aa  185  6e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  44.25 
 
 		 237 aa  185  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  44.39 
 
 		 240 aa  185  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  47.55 
 
 		 238 aa  185  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.26 
 
 		 233 aa  184  7e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  46.86 
 
 		 236 aa  184  7e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0824  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  46.31 
 
 		 227 aa  184  7e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.617096  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4228  ABC transporter related  45.67 
 
 		 229 aa  184  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.619304 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  44.98 
 
 		 644 aa  184  7e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.26 
 
 		 233 aa  184  8e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  47.34 
 
 		 226 aa  184  8e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0229  ABC transporter related  44.69 
 
 		 264 aa  184  8e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.772392  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  41.26 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2397  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.69 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  47.78 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>