More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2979 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2979  ABC transporter related  100 
 
 		 226 aa  441  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.758866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2535  ABC transporter related  56.05 
 
 		 230 aa  232  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.14801  normal  0.635881 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3747  ABC transporter related  56.76 
 
 		 226 aa  232  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0461  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 227 aa  218  6e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.880159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0473  ABC transporter related  50.97 
 
 		 238 aa  218  6e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2018  ABC transporter related  52.43 
 
 		 238 aa  218  7.999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0425  ABC transporter related  50.49 
 
 		 234 aa  212  2.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4039  lipoprotein-releasing system ABC transporter ATP-binding protein  53.81 
 
 		 234 aa  208  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592839 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0264  ATPase  48.78 
 
 		 246 aa  207  7e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1838  ABC transporter related protein  45.78 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617058  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0481  ABC transporter related  48.78 
 
 		 241 aa  206  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0833  ABC transporter related  43.56 
 
 		 224 aa  201  6e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  48.78 
 
 		 240 aa  201  8e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.87 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0880  hypothetical protein  52.05 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0911  hypothetical protein  52.05 
 
 		 225 aa  191  7e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.57 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.57 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.57 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.57 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.57 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  44.14 
 
 		 256 aa  186  2e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.27 
 
 		 227 aa  185  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.61 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  44.61 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.61 
 
 		 233 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.61 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.61 
 
 		 233 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.61 
 
 		 233 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  44.61 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.61 
 
 		 233 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4228  ABC transporter related  45.74 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.279165  normal  0.619304 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.61 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0920  ABC transporter related  44.55 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.76 
 
 		 233 aa  181  7e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  45.33 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.99 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  49.01 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.75 
 
 		 236 aa  178  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2345  ABC transporter related  45.74 
 
 		 223 aa  178  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.144574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2735  ABC transporter related  46.19 
 
 		 223 aa  178  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.31749  normal  0.728727 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  44.39 
 
 		 240 aa  178  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3410  ABC transporter, ATPase subunit  47.37 
 
 		 239 aa  178  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.072759  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.95 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  49.5 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0941  ABC transporter related  44.64 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4416  ABC transporter, ATP-binding protein  45.96 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1647  ABC transporter related  45.29 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.204823  hitchhiker  0.000330012 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0349  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.12 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1042  ABC transporter related  45.1 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208873  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2453  ABC transporter related  49.11 
 
 		 676 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  46.88 
 
 		 248 aa  175  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1795  ABC transporter related  45.63 
 
 		 229 aa  175  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.219829  normal  0.943815 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  47.3 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2827  ABC transporter related  47.87 
 
 		 243 aa  175  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  49.76 
 
 		 655 aa  174  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.81 
 
 		 233 aa  174  9e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2170  ABC transporter related  48.06 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1173  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.74 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.659944  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0385  ABC transporter ATP-binding protein  45.66 
 
 		 240 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0756  ABC transporter related  43.24 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.688421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  45.13 
 
 		 653 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3253  ABC transporter-related protein  47.09 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12235  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  48.48 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  44.39 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.08 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.08 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1373  ABC transporter related  44.61 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2039  ABC transporter related  49.75 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  43.48 
 
 		 250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.08 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3012  ABC transporter related  40.45 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.134737 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3559  ABC transporter related  50.99 
 
 		 239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3826  ABC transporter related  46.94 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0425  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.62 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  40.27 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0218  ABC transporter related  43.75 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.489811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  44.44 
 
 		 238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  41.52 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2403  ABC transporter related  43.6 
 
 		 227 aa  171  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155422  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1821  ABC transporter-related protein  45.5 
 
 		 223 aa  171  5.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.373636  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.14 
 
 		 236 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3478  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  40.62 
 
 		 258 aa  171  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.741929  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0308  ABC transporter ATP-binding protein  40.27 
 
 		 237 aa  171  6.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0332817 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4410  ABC transporter related  48.48 
 
 		 234 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  41.59 
 
 		 238 aa  171  6.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  42.65 
 
 		 226 aa  171  7.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  45.78 
 
 		 649 aa  171  7.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  42.53 
 
 		 241 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0824  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  44.55 
 
 		 227 aa  171  9e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.617096  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0086  ABC transporter related  47.98 
 
 		 231 aa  171  9e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0522946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1841  ABC transporter related  47.47 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656554  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0347  ABC transporter related protein  49.26 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  46.22 
 
 		 650 aa  171  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19670  ABC transporter related  44.09 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  40.99 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0982  ABC transporter related protein  45.45 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.452379 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  45.19 
 
 		 221 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1281  ABC transporter related  44.06 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0118107  normal  0.276429 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>