More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0775 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0775  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 243 aa  500  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  61.4 
 
 		 235 aa  302  4.0000000000000003e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  61.4 
 
 		 235 aa  301  8.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0308  ABC transporter ATP-binding protein  62.22 
 
 		 237 aa  292  3e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0332817 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2119  ABC transporter, ATP-binding protein  67.26 
 
 		 241 aa  291  5e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  58.74 
 
 		 240 aa  282  4.0000000000000003e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  57.89 
 
 		 234 aa  274  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4416  ABC transporter, ATP-binding protein  53.78 
 
 		 244 aa  259  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  53.91 
 
 		 229 aa  257  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4838  ABC transporter related  54.87 
 
 		 225 aa  255  5e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  53.1 
 
 		 225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  53.88 
 
 		 219 aa  244  6.999999999999999e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3506  ABC transporter, ATP-binding protein  52.23 
 
 		 238 aa  244  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1330  ABC transporter related  51.77 
 
 		 235 aa  244  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.514657  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  53.92 
 
 		 220 aa  238  5e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  48.47 
 
 		 230 aa  234  8e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  51.61 
 
 		 220 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  50.44 
 
 		 239 aa  232  5e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0471  ABC transporter related  49.12 
 
 		 236 aa  231  9e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  50 
 
 		 232 aa  231  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  50.9 
 
 		 225 aa  230  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0863  ABC transporter related  49.77 
 
 		 246 aa  228  8e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3159  ABC transporter related  49.77 
 
 		 246 aa  228  8e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3260  ABC transporter related  49.77 
 
 		 246 aa  228  8e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  50.23 
 
 		 263 aa  227  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  48.21 
 
 		 226 aa  226  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  49.77 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0433  ATPase  50.23 
 
 		 228 aa  225  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.526748  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  48.09 
 
 		 260 aa  225  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04891  ABC transporter ATP-binding protein  49.33 
 
 		 228 aa  225  4e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0898  ABC transporter related  49.32 
 
 		 232 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2850  ABC transporter related  48.88 
 
 		 240 aa  224  8e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  48.71 
 
 		 238 aa  224  9e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2991  ABC transporter related  48.86 
 
 		 246 aa  223  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  48.28 
 
 		 234 aa  223  1e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  46.72 
 
 		 237 aa  224  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  46.12 
 
 		 241 aa  224  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  48.29 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1019  ABC transporter related  48.4 
 
 		 247 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3341  ABC transporter related  48.4 
 
 		 247 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0998  ABC transporter related  48.4 
 
 		 247 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  48.23 
 
 		 642 aa  223  2e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1031  ABC transporter related  48.4 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 		 246 aa  222  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  50.45 
 
 		 230 aa  223  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  48.88 
 
 		 247 aa  222  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  51.35 
 
 		 225 aa  222  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.58 
 
 		 647 aa  222  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  47.64 
 
 		 642 aa  222  4.9999999999999996e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  46.22 
 
 		 657 aa  221  6e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  48.88 
 
 		 233 aa  221  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04581  ABC transporter ATP-binding protein  48.88 
 
 		 228 aa  221  7e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  48.65 
 
 		 246 aa  221  8e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  45.78 
 
 		 653 aa  221  8e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4175  ABC transporter related  45.91 
 
 		 237 aa  221  9e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  48.86 
 
 		 253 aa  221  9e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  48.25 
 
 		 228 aa  220  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2576  ABC transporter related  50.68 
 
 		 222 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3004  ABC transporter ATP-binding protein  50.68 
 
 		 222 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000190264  hitchhiker  0.00000432285 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2478  ABC transporter ATP-binding protein  50.68 
 
 		 222 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.866087  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.75 
 
 		 258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2864  ABC transporter related  48.64 
 
 		 230 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0282  ABC transporter, ATP-binding protein  50.92 
 
 		 223 aa  219  3e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  48.4 
 
 		 715 aa  219  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2600  ABC transporter related  49.55 
 
 		 227 aa  219  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  46.46 
 
 		 253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  46.22 
 
 		 640 aa  219  3.9999999999999997e-56  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  45.58 
 
 		 230 aa  218  5e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  45.06 
 
 		 235 aa  218  5e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  46.67 
 
 		 242 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3364  ABC transporter related  47.95 
 
 		 243 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  44.89 
 
 		 654 aa  218  8.999999999999998e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  48.65 
 
 		 233 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  47.49 
 
 		 228 aa  218  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  49.31 
 
 		 228 aa  217  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  47.96 
 
 		 232 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  46.64 
 
 		 241 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  46.64 
 
 		 241 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  48.02 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4308  ABC transporter related  46.64 
 
 		 241 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  49.55 
 
 		 238 aa  216  2e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2239  ABC transporter related  48.15 
 
 		 233 aa  216  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  45.95 
 
 		 237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  48.46 
 
 		 240 aa  216  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  45.58 
 
 		 228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  46.85 
 
 		 252 aa  215  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  44.74 
 
 		 238 aa  214  7e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  46.52 
 
 		 229 aa  214  7e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04881  ABC transporter ATP-binding protein  47.32 
 
 		 235 aa  214  8e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0573  ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  49.78 
 
 		 226 aa  214  9.999999999999999e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  45.42 
 
 		 653 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1766  ATPase  47.32 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104306  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  44.98 
 
 		 671 aa  214  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  46.67 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  47.09 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  46.02 
 
 		 277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  46.49 
 
 		 236 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2850  hypothetical protein  47.98 
 
 		 229 aa  212  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  46.4 
 
 		 248 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>