More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0681 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0681  ABC transporter related  100 
 
 
232 aa  465  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1841  ABC transporter related  69.51 
 
 
224 aa  334  7.999999999999999e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0297689  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1261  ABC transporter, ATP-binding protein  58.74 
 
 
227 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2817  ABC transporter related  53.36 
 
 
247 aa  258  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3639  ABC transporter related  52.7 
 
 
228 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3589  ABC transporter related protein  52.7 
 
 
228 aa  249  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1471  ABC transporter related  49.15 
 
 
242 aa  237  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.51412  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0441  ABC transporter, ATPase subunit  52.25 
 
 
228 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123309  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0475  ABC transporter-related protein  51.8 
 
 
228 aa  224  7e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.761135  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0470  ABC transporter related  50.9 
 
 
228 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0512  ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 
215 aa  201  6e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0269  ABC-type transport system, ATP-binding component  48.86 
 
 
227 aa  196  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1315  ABC transporter-related protein  42.79 
 
 
222 aa  196  3e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.26423  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  45.41 
 
 
228 aa  190  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  45.85 
 
 
253 aa  188  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  45.85 
 
 
253 aa  187  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  43.05 
 
 
653 aa  187  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.84 
 
 
646 aa  187  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1881  (3R)-hydroxymyristoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase ((3R)-hydroxymyristoyl ACP dehydrase)  40.89 
 
 
222 aa  185  5e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.398507  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  47.64 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  45.5 
 
 
671 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  43.05 
 
 
252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  44.4 
 
 
644 aa  183  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  42.6 
 
 
230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  43.5 
 
 
225 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  46.85 
 
 
715 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  45.74 
 
 
230 aa  180  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  45.74 
 
 
650 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  42.34 
 
 
232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  44.84 
 
 
651 aa  179  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  42.79 
 
 
642 aa  179  4.999999999999999e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  41.89 
 
 
239 aa  178  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  41.52 
 
 
247 aa  178  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.15 
 
 
648 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  41.67 
 
 
234 aa  177  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.15 
 
 
648 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  43.89 
 
 
248 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0894  ABC transporter related  42.66 
 
 
224 aa  177  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.552759  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  43.89 
 
 
248 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  41.67 
 
 
234 aa  177  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.15 
 
 
648 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  40.99 
 
 
240 aa  176  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  43.3 
 
 
228 aa  176  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  43.95 
 
 
666 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 
233 aa  176  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2172  ABC transporter related protein  41.7 
 
 
222 aa  176  3e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00192331  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  43.42 
 
 
230 aa  176  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  41.7 
 
 
225 aa  176  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  41.92 
 
 
642 aa  176  4e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  44.25 
 
 
238 aa  175  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.6 
 
 
648 aa  174  9e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  42.79 
 
 
648 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  42.79 
 
 
648 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  43.91 
 
 
643 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.79 
 
 
648 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.79 
 
 
648 aa  174  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.79 
 
 
648 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.79 
 
 
648 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6611  ABC transporter related  44.29 
 
 
660 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0694  ABC transporter related protein  39.27 
 
 
225 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  40.18 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.7 
 
 
648 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  42.79 
 
 
648 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.7 
 
 
648 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  43.95 
 
 
654 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4838  ABC transporter related  40.99 
 
 
225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  39.21 
 
 
235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  41.18 
 
 
220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  40.54 
 
 
229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  43.5 
 
 
233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  42.49 
 
 
652 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  41.44 
 
 
223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  42.79 
 
 
234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  40.72 
 
 
228 aa  171  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  41.92 
 
 
641 aa  172  5.999999999999999e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  45.05 
 
 
228 aa  171  6.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  41.26 
 
 
654 aa  171  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  41.82 
 
 
256 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  43.38 
 
 
222 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  42.6 
 
 
238 aa  171  7.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  42.61 
 
 
225 aa  170  1e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0748  ABC transporter related  43.75 
 
 
227 aa  171  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  37.99 
 
 
234 aa  170  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  42.31 
 
 
663 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  44.4 
 
 
657 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  42.41 
 
 
226 aa  170  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  42.24 
 
 
230 aa  170  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  43.89 
 
 
238 aa  170  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  38.16 
 
 
234 aa  169  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.44 
 
 
648 aa  169  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  41.82 
 
 
228 aa  169  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  41.52 
 
 
408 aa  169  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0796  ABC transporter related  46.27 
 
 
299 aa  169  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0217  ABC transporter related protein  45.61 
 
 
234 aa  169  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.941766  normal  0.16938 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  40.54 
 
 
266 aa  169  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  41.1 
 
 
222 aa  169  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04891  ABC transporter ATP-binding protein  41.52 
 
 
228 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  40.72 
 
 
242 aa  168  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  39.83 
 
 
253 aa  168  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  46.26 
 
 
246 aa  168  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>