More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2817 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2817  ABC transporter related  100 
 
 		 247 aa  504  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1261  ABC transporter, ATP-binding protein  63.8 
 
 		 227 aa  305  4.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1471  ABC transporter related  60.59 
 
 		 242 aa  290  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.51412  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3639  ABC transporter related  62.78 
 
 		 228 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3589  ABC transporter related protein  62.33 
 
 		 228 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1841  ABC transporter related  57.92 
 
 		 224 aa  278  7e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0297689  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0681  ABC transporter related  53.36 
 
 		 232 aa  251  6e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0475  ABC transporter-related protein  55.8 
 
 		 228 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.761135  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0441  ABC transporter, ATPase subunit  54.91 
 
 		 228 aa  244  9e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123309  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0470  ABC transporter related  54.91 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2172  ABC transporter related protein  43.05 
 
 		 222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00192331  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0512  ABC transporter, ATP-binding protein  44.91 
 
 		 215 aa  196  3e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1315  ABC transporter-related protein  40.99 
 
 		 222 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.26423  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0694  ABC transporter related protein  39.27 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  40.89 
 
 		 228 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  43.24 
 
 		 230 aa  176  4e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1881  (3R)-hydroxymyristoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase ((3R)-hydroxymyristoyl ACP dehydrase)  40.09 
 
 		 222 aa  174  8e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.398507  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  39.19 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  41.52 
 
 		 237 aa  172  6.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  39.04 
 
 		 238 aa  171  7.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  41.7 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  39.46 
 
 		 642 aa  169  3e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0701  ABC transporter, ATPase subunit  39.59 
 
 		 241 aa  169  4e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.471185  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  41.26 
 
 		 653 aa  169  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  41.26 
 
 		 253 aa  168  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  40.53 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  40 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  38.77 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  38.33 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  42.08 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  40.09 
 
 		 235 aa  166  4e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  39.01 
 
 		 238 aa  166  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  39.19 
 
 		 254 aa  165  5e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3761  ABC transporter related protein  38.84 
 
 		 265 aa  165  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  37.23 
 
 		 239 aa  165  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  42.23 
 
 		 236 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  39.01 
 
 		 234 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  39.01 
 
 		 234 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1821  ABC transporter-related protein  40.09 
 
 		 223 aa  165  8e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.373636  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  38.57 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  39.01 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  40.71 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1471  ABC transporter related  40.09 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  37.22 
 
 		 230 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  38.01 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  38.12 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  38.01 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  38.67 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2196  ABC transporter related  40.99 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.439888  normal  0.425297 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1841  ABC transporter related  39.01 
 
 		 226 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656554  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0269  ABC-type transport system, ATP-binding component  39.01 
 
 		 227 aa  163  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  35.75 
 
 		 240 aa  162  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  37.67 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  40.18 
 
 		 223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  37.78 
 
 		 228 aa  162  6e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  40.17 
 
 		 228 aa  162  6e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  38.19 
 
 		 240 aa  162  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3881  ABC transporter related  40.36 
 
 		 229 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.770849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  39.29 
 
 		 286 aa  162  7e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  38.01 
 
 		 248 aa  161  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  38.01 
 
 		 248 aa  161  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  38.12 
 
 		 234 aa  161  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  37.27 
 
 		 226 aa  161  8.000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  39.91 
 
 		 229 aa  161  9e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  36.77 
 
 		 652 aa  161  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  38.39 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2345  ABC transporter, ATP-binding protein  40.29 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  38.5 
 
 		 252 aa  161  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  37.78 
 
 		 650 aa  160  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  40.09 
 
 		 224 aa  161  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  39.73 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1473  ABC-transporter ATP binding protein  37.95 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  37.5 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  39.73 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3258  ABC transporter, ATP-binding protein  37.95 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.219344  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3144  ABC transporter, ATP-binding protein  37.95 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1516  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.84 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  40.27 
 
 		 224 aa  160  3e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  38.57 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  37.33 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1252  ABC transporter related  41.07 
 
 		 234 aa  159  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.252759 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0471  ABC transporter related  36.77 
 
 		 236 aa  159  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  38.5 
 
 		 246 aa  159  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  37.61 
 
 		 657 aa  159  4e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  40.09 
 
 		 650 aa  159  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  36.32 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  36.8 
 
 		 248 aa  159  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  39.29 
 
 		 223 aa  159  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  38.39 
 
 		 233 aa  159  6e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  37.22 
 
 		 643 aa  158  6e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  39.29 
 
 		 223 aa  158  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  36.49 
 
 		 231 aa  158  8e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  37.22 
 
 		 642 aa  158  8e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 220 aa  158  8e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  39.65 
 
 		 658 aa  158  9e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>