More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2172 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2172  ABC transporter related protein  100 
 
 		 222 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00192331  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1315  ABC transporter-related protein  56.76 
 
 		 222 aa  248  7e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.26423  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0694  ABC transporter related protein  48.4 
 
 		 225 aa  198  7e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2817  ABC transporter related  43.05 
 
 		 247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0512  ABC transporter, ATP-binding protein  46.54 
 
 		 215 aa  193  2e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1471  ABC transporter related  42.68 
 
 		 242 aa  191  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.51412  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1261  ABC transporter, ATP-binding protein  44.29 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1881  (3R)-hydroxymyristoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase ((3R)-hydroxymyristoyl ACP dehydrase)  45.95 
 
 		 222 aa  187  1e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.398507  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1841  ABC transporter related  40.99 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0297689  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0441  ABC transporter, ATPase subunit  41.26 
 
 		 228 aa  181  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123309  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  40.99 
 
 		 642 aa  179  2.9999999999999997e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  40.81 
 
 		 248 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  40.81 
 
 		 248 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  42.79 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0475  ABC transporter-related protein  40.36 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.761135  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3212  cyclic nucleotide-binding protein  43.75 
 
 		 388 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3589  ABC transporter related protein  37.39 
 
 		 228 aa  175  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  38.46 
 
 		 252 aa  174  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  40.54 
 
 		 233 aa  174  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  41.63 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3639  ABC transporter related  36.94 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  40.99 
 
 		 642 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  43.44 
 
 		 240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  41.89 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  43.44 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1370  ABC transporter related  40.91 
 
 		 232 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000531133  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0863  ABC transporter related  42.99 
 
 		 246 aa  171  9e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3159  ABC transporter related  42.99 
 
 		 246 aa  171  9e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3260  ABC transporter related  42.99 
 
 		 246 aa  171  9e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2437  ABC transporter related  41.89 
 
 		 231 aa  170  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2710  cyclic nucleotide-binding protein  42.41 
 
 		 388 aa  170  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2991  ABC transporter related  42.99 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.01 
 
 		 233 aa  169  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1835  ABC transporter, ATP-binding protein  42.27 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.131138  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0470  ABC transporter related  39.19 
 
 		 228 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2023  ABC transporter, ATP-binding protein  42.27 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0214049  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  42.08 
 
 		 228 aa  169  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1654  ABC transporter, ATP-binding protein  42.27 
 
 		 216 aa  170  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0681  ABC transporter related  40.99 
 
 		 232 aa  169  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  42.53 
 
 		 246 aa  169  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  39.01 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.01 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  39.01 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  41.63 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.01 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.01 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0898  ABC transporter related  42.53 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.01 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.01 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.01 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  42.53 
 
 		 253 aa  168  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  43.89 
 
 		 230 aa  168  7e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.01 
 
 		 233 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.01 
 
 		 233 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.01 
 
 		 233 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.01 
 
 		 233 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.01 
 
 		 233 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1330  ABC transporter related  40.99 
 
 		 235 aa  168  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.514657  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1100  ABC transporter related  41.82 
 
 		 236 aa  167  9e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  40.54 
 
 		 641 aa  167  1e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  38.46 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  42.59 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  37.84 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0998  ABC transporter related  41.63 
 
 		 247 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  42.08 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4064  Type II (General) Secretory Pathway (IISP) Family protein  40.99 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1031  ABC transporter related  41.63 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3341  ABC transporter related  41.63 
 
 		 247 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1019  ABC transporter related  41.63 
 
 		 247 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  40.72 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  38.74 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3364  ABC transporter related  42.53 
 
 		 243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  36.94 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  40.54 
 
 		 641 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  42.08 
 
 		 228 aa  166  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  42.13 
 
 		 229 aa  165  4e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  41.52 
 
 		 408 aa  165  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  37.84 
 
 		 222 aa  165  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1649  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  38.01 
 
 		 235 aa  165  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  40.09 
 
 		 229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  40.09 
 
 		 641 aa  165  5.9999999999999996e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  36.94 
 
 		 241 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0573  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 		 253 aa  164  8e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3158  ABC transporter ATP-binding protein  39.45 
 
 		 253 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  42.22 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1165  ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  38.91 
 
 		 277 aa  163  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3406  ABC transporter ATP-binding protein  39.45 
 
 		 253 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0509815  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  37.33 
 
 		 648 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0335  ABC transporter related  40.09 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000938347 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  37.33 
 
 		 648 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2850  ABC transporter related  40.45 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  38.18 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1801  cell division ATP-binding protein FtsE  40.72 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000021053  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3142  ABC transporter, ATP-binding protein  39.45 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00969837  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  42.15 
 
 		 231 aa  162  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  40.45 
 
 		 233 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  40.54 
 
 		 242 aa  162  3e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>