More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3639 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3639  ABC transporter related  100 
 
 		 228 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3589  ABC transporter related protein  95.61 
 
 		 228 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2817  ABC transporter related  62.78 
 
 		 247 aa  285  5e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1261  ABC transporter, ATP-binding protein  59.47 
 
 		 227 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1471  ABC transporter related  55.08 
 
 		 242 aa  263  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.51412  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1841  ABC transporter related  56.11 
 
 		 224 aa  259  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0297689  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0681  ABC transporter related  52.7 
 
 		 232 aa  243  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0475  ABC transporter-related protein  54.05 
 
 		 228 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.761135  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0470  ABC transporter related  53.81 
 
 		 228 aa  238  8e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0441  ABC transporter, ATPase subunit  53.81 
 
 		 228 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123309  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1315  ABC transporter-related protein  43.24 
 
 		 222 aa  198  6e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.26423  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0512  ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  42.11 
 
 		 238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  42.99 
 
 		 237 aa  179  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  42.49 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  40.35 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2172  ABC transporter related protein  36.94 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00192331  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  40.62 
 
 		 253 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  40.62 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3761  ABC transporter related protein  43.18 
 
 		 265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  36.4 
 
 		 648 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  37.89 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  36.4 
 
 		 648 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  40.54 
 
 		 230 aa  170  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  39.73 
 
 		 239 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  37.78 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  42.03 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  41.3 
 
 		 408 aa  169  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  40.79 
 
 		 653 aa  169  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  41.44 
 
 		 221 aa  169  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  38.67 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1849  lipoprotein-releasing system (ABC transporter), ATP-binding protein lolD  39.57 
 
 		 234 aa  168  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.115729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  36.16 
 
 		 682 aa  168  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0269  ABC-type transport system, ATP-binding component  42.08 
 
 		 227 aa  168  7e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  40.18 
 
 		 228 aa  168  7e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  41.26 
 
 		 234 aa  167  8e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  36.16 
 
 		 682 aa  168  8e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  39.64 
 
 		 224 aa  167  8e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  36.16 
 
 		 667 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  36.16 
 
 		 667 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1881  (3R)-hydroxymyristoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase ((3R)-hydroxymyristoyl ACP dehydrase)  38.74 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.398507  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.12 
 
 		 648 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  36.44 
 
 		 642 aa  167  2e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  39.29 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  41.36 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  41.78 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  38.77 
 
 		 238 aa  166  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0694  ABC transporter related protein  35.62 
 
 		 225 aa  165  4e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  39.82 
 
 		 220 aa  166  4e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  38.46 
 
 		 248 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  38.46 
 
 		 248 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37 
 
 		 648 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37 
 
 		 648 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37 
 
 		 648 aa  164  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  40.36 
 
 		 223 aa  164  6.9999999999999995e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  39.73 
 
 		 247 aa  164  8e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  35.09 
 
 		 649 aa  164  8e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  35.96 
 
 		 650 aa  164  9e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  35.09 
 
 		 642 aa  164  9e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  37.9 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2115  ABC transporter related  38.6 
 
 		 647 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  38.57 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  38.12 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  40.36 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  36 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  39.47 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  40.54 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  40.62 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  37.28 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  38.67 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  37.44 
 
 		 232 aa  162  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2827  ABC transporter related  40.35 
 
 		 243 aa  162  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  37.78 
 
 		 654 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  39.11 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0495  ABC transporter related  39.57 
 
 		 237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  38.07 
 
 		 240 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  38.43 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1297  ABC transporter related  40.95 
 
 		 652 aa  161  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  39.52 
 
 		 236 aa  161  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  41.48 
 
 		 246 aa  161  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  35.53 
 
 		 656 aa  162  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.56 
 
 		 648 aa  161  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0366  ABC-type transport system, ATPase component PhnL  38.74 
 
 		 245 aa  161  7e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1029  ABC transporter related  40.99 
 
 		 276 aa  161  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0752137 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  36.53 
 
 		 228 aa  161  8.000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1841  ABC transporter related  39.29 
 
 		 226 aa  161  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656554  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.56 
 
 		 648 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  36.73 
 
 		 232 aa  161  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0224  ABC transporter related protein  40.27 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.857812  normal  0.293836 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  40.18 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  40.2 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  39.73 
 
 		 654 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  37.05 
 
 		 266 aa  160  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1516  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.69 
 
 		 230 aa  159  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4048  ABC transporter-related protein  41.07 
 
 		 237 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  39.65 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4081  ABC transporter related  41.07 
 
 		 237 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  39.65 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  42.29 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  39.21 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>