More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1084 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1084  ABC transporter related  100 
 
 		 255 aa  499  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2510  ABC transporter related protein  67.84 
 
 		 274 aa  290  2e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2492  ABC transporter related protein  67.41 
 
 		 269 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1954  ABC transporter related protein  70.09 
 
 		 246 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235138  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  47.39 
 
 		 249 aa  217  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0502  ABC transporter related  55.11 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  48.21 
 
 		 225 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  46.61 
 
 		 249 aa  208  6e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3157  ABC transporter related protein  51.9 
 
 		 240 aa  206  3e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  45.21 
 
 		 642 aa  205  5e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  55.7 
 
 		 287 aa  203  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.3 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  49.34 
 
 		 230 aa  202  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27880  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50 
 
 		 235 aa  202  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  0.542219 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2927  ABC transporter, ATP-binding protein  45.85 
 
 		 253 aa  202  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  47.09 
 
 		 225 aa  202  6e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.54 
 
 		 233 aa  201  7e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  44.81 
 
 		 249 aa  201  8e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13620  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.42 
 
 		 238 aa  201  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.770541 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2038  ABC transporter related  52.75 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.376795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  44.81 
 
 		 249 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.26 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  45.85 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1697  ABC transporter related  47.09 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.558012  normal  0.191667 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  46.29 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  49.33 
 
 		 715 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.83 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  48.89 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  52.94 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  50.24 
 
 		 656 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3761  ABC transporter related protein  49.38 
 
 		 265 aa  199  5e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  52.94 
 
 		 253 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  47.49 
 
 		 240 aa  198  6e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.83 
 
 		 253 aa  198  6e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  48.42 
 
 		 234 aa  198  7.999999999999999e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  49.52 
 
 		 248 aa  198  9e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  48.43 
 
 		 656 aa  197  9e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  49.52 
 
 		 248 aa  198  9e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.51 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  48.51 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  45.02 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2391  ABC transporter related  45.96 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1667  ABC transporter related  43.95 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  48 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04961  ABC transporter ATP-binding protein  46.7 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1663  ABC transporter, ATP-binding protein  50.48 
 
 		 219 aa  197  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.557172 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.41 
 
 		 233 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  45.25 
 
 		 226 aa  197  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  51.5 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2708  ABC transporter related  45.83 
 
 		 246 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  42.29 
 
 		 640 aa  196  2.0000000000000003e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.04 
 
 		 231 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.55 
 
 		 236 aa  196  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1679  ABC transporter related  46.12 
 
 		 242 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0801167 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  45.81 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2784  ABC transporter related  46.12 
 
 		 242 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.652474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  45.99 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  47.09 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2687  ABC transporter related  46.12 
 
 		 242 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  52.85 
 
 		 233 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  41.85 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  49.03 
 
 		 652 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  46.88 
 
 		 224 aa  195  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  48.26 
 
 		 234 aa  195  7e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  49.78 
 
 		 288 aa  195  7e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  45.05 
 
 		 246 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  47.51 
 
 		 225 aa  194  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  47.26 
 
 		 277 aa  195  8.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.09 
 
 		 258 aa  194  8.000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2971  hypothetical protein  54.9 
 
 		 236 aa  194  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.948797  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  45.37 
 
 		 247 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  45.58 
 
 		 236 aa  194  9e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0544  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  49.34 
 
 		 228 aa  194  9e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00446  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  49.34 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3115  ABC transporter related protein  49.34 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0599  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  49.34 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.962067 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0573  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  49.34 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  49.34 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  45.74 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0430  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  49.34 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.811195  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00451  hypothetical protein  49.34 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3121  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  49.34 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114112 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1955  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.01 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00212141  normal  0.0513198 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.01 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.214498  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2990  hypothetical protein  48.42 
 
 		 229 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2850  hypothetical protein  48.42 
 
 		 229 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  43.98 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  47.26 
 
 		 653 aa  193  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2392  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.01 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000179176  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2403  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.01 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.017802  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  43.16 
 
 		 236 aa  193  3e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0183  ABC transporter related  43.87 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.337585  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  45.74 
 
 		 260 aa  192  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0188  ABC transporter related  43.87 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  44.29 
 
 		 641 aa  192  4e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0560  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  51.94 
 
 		 228 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  47.75 
 
 		 228 aa  192  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 249 aa  192  5e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04770  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.24 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0553  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  51.94 
 
 		 228 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>