More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0502 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0502  ABC transporter related  100 
 
 		 230 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1084  ABC transporter related  55.11 
 
 		 255 aa  229  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  54.11 
 
 		 657 aa  215  5e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2510  ABC transporter related protein  54.05 
 
 		 274 aa  210  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  49.11 
 
 		 646 aa  206  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2492  ABC transporter related protein  54.26 
 
 		 269 aa  202  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  49.77 
 
 		 277 aa  202  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  43.69 
 
 		 234 aa  202  5e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  49.28 
 
 		 239 aa  201  7e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  45.29 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  49.28 
 
 		 232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  47.32 
 
 		 648 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  47.32 
 
 		 648 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  43.75 
 
 		 224 aa  198  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0269  ABC-type transport system, ATP-binding component  49.34 
 
 		 227 aa  198  6e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  44.44 
 
 		 230 aa  198  6e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  44 
 
 		 235 aa  198  7e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  47.53 
 
 		 657 aa  197  9e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0321  ABC transporter related  49.12 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  46.19 
 
 		 653 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2038  ABC transporter related  48.42 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.376795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0038  ABC transporter ATP-binding protein  45.98 
 
 		 221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  49.76 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.77 
 
 		 648 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3794  ABC transporter related protein  57.07 
 
 		 239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0794563 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.77 
 
 		 648 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.77 
 
 		 648 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.77 
 
 		 648 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.77 
 
 		 648 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  52.17 
 
 		 715 aa  195  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  50 
 
 		 657 aa  194  7e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0584  ABC transporter related protein  49.78 
 
 		 227 aa  194  8.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.378842  normal  0.517504 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2850  hypothetical protein  48.82 
 
 		 229 aa  194  9e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2990  hypothetical protein  48.82 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  45.21 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  44.64 
 
 		 238 aa  193  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  48.88 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  49.01 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  48.88 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  43.69 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  47.32 
 
 		 288 aa  193  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  46.27 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  44.13 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2208  ABC transporter related  43.95 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.556988 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  48.29 
 
 		 648 aa  192  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3983  ABC transporter related  52.45 
 
 		 233 aa  192  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  48.28 
 
 		 649 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  49.78 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  46.67 
 
 		 227 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  49.34 
 
 		 226 aa  192  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  56.25 
 
 		 287 aa  192  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2955  ABC transporter related  55.68 
 
 		 250 aa  191  6e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.176786 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  49.02 
 
 		 230 aa  191  6e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  39.91 
 
 		 642 aa  191  7e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  48.2 
 
 		 238 aa  191  7e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4028  ABC transporter related  51.49 
 
 		 228 aa  191  8e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0097  macrolide-specific ABC-type efflux carrier MacB  45.33 
 
 		 668 aa  191  9e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2837  ABC transporter ATP-binding protein  43.78 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000357321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2811  ABC transporter, ATP-binding protein  43.78 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179867  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.78 
 
 		 649 aa  190  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  48.29 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3052  ABC transporter ATP-binding protein  43.78 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  49.78 
 
 		 236 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2517  ABC transporter related protein  48.08 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  45.32 
 
 		 641 aa  190  2e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  48.25 
 
 		 228 aa  190  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  48.51 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.810917 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  41.78 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2771  ABC transporter, ATP-binding protein  43.78 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  43.05 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  48.02 
 
 		 656 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  42.22 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  45.98 
 
 		 653 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3064  ABC transporter, ATP-binding protein  43.78 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  48.1 
 
 		 663 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1920  ABC transporter related  50 
 
 		 227 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0842487  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  45.19 
 
 		 652 aa  189  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  45.69 
 
 		 663 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60790  ABC transporter ATP-binding protein  52.4 
 
 		 228 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  43.3 
 
 		 237 aa  188  5e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  44.83 
 
 		 641 aa  188  5e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3521  ABC transporter related protein  45.95 
 
 		 254 aa  188  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.185776 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1479  ABC transporter related  43.5 
 
 		 249 aa  188  5e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  49.02 
 
 		 648 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  49.02 
 
 		 648 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  47.5 
 
 		 230 aa  188  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  49.26 
 
 		 227 aa  188  5.999999999999999e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4175  ABC transporter related  44.66 
 
 		 237 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  45.78 
 
 		 228 aa  188  5.999999999999999e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1544  ABC transporter related  43.69 
 
 		 249 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0894147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1538  ABC transporter related  43.5 
 
 		 249 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136068 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  48.29 
 
 		 656 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  46.67 
 
 		 228 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1667  ABC transporter related  45.41 
 
 		 233 aa  188  7e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  43.56 
 
 		 237 aa  188  7e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50 
 
 		 236 aa  187  8e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2109  Sigma 54 interacting domain protein  49.76 
 
 		 226 aa  188  8e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  48.43 
 
 		 650 aa  187  9e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  48.53 
 
 		 648 aa  187  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>