More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4175 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_4175  ABC transporter related  100 
 
 		 237 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  46.85 
 
 		 235 aa  236  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  47.3 
 
 		 235 aa  236  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0308  ABC transporter ATP-binding protein  45.11 
 
 		 237 aa  229  4e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0332817 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  45.18 
 
 		 240 aa  215  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 236 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.64 
 
 		 648 aa  211  7e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  44.64 
 
 		 648 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  44.64 
 
 		 648 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.64 
 
 		 648 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.64 
 
 		 648 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  44.64 
 
 		 648 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.64 
 
 		 648 aa  211  7.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.64 
 
 		 648 aa  210  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2850  hypothetical protein  46.05 
 
 		 229 aa  210  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2990  hypothetical protein  46.02 
 
 		 229 aa  209  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3064  ABC transporter, ATP-binding protein  44.25 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  43.89 
 
 		 657 aa  209  4e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  44.29 
 
 		 242 aa  207  8e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  44.89 
 
 		 237 aa  207  9e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3521  ABC transporter related protein  46.58 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.185776 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  43.11 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  44.84 
 
 		 230 aa  205  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0775  ABC transporter, ATP-binding protein  45.91 
 
 		 243 aa  206  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2837  ABC transporter ATP-binding protein  44.09 
 
 		 223 aa  205  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000357321  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1667  ABC transporter related  46.58 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3052  ABC transporter ATP-binding protein  44.09 
 
 		 223 aa  205  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  41.7 
 
 		 246 aa  205  6e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  42.24 
 
 		 646 aa  204  7e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  41.96 
 
 		 238 aa  204  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  43.48 
 
 		 247 aa  204  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.69 
 
 		 647 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  42.62 
 
 		 277 aa  203  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.74 
 
 		 648 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  46.82 
 
 		 228 aa  203  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  42.92 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  43.64 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2199  ABC transporter, ATP-binding protein  43.89 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517578  hitchhiker  0.0000000011345 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  44.55 
 
 		 236 aa  202  5e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 233 aa  201  6e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.3 
 
 		 648 aa  201  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.3 
 
 		 648 aa  201  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  43.44 
 
 		 642 aa  201  7e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2811  ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 		 223 aa  201  7e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179867  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2771  ABC transporter, ATP-binding protein  43.05 
 
 		 223 aa  201  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.74 
 
 		 648 aa  201  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1792  ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 		 233 aa  201  8e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4308  ABC transporter related  42.11 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4155  ABC transporter, ATPase subunit  42.11 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  42.6 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4286  ABC transporter-related protein  42.11 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2239  ABC transporter related  44.44 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  43.5 
 
 		 646 aa  200  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  41.59 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  42.99 
 
 		 258 aa  200  9.999999999999999e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3083  ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 		 223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.760416  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  46.8 
 
 		 230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0998  ABC transporter related  44.29 
 
 		 247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0199  ABC transporter related  44.39 
 
 		 291 aa  199  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.500002  normal  0.26855 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1019  ABC transporter related  44.29 
 
 		 247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1031  ABC transporter related  44.29 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.3 
 
 		 648 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3341  ABC transporter related  44.29 
 
 		 247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  42.54 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  44.05 
 
 		 648 aa  200  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  43.3 
 
 		 238 aa  199  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  44.75 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4416  ABC transporter, ATP-binding protein  42.36 
 
 		 244 aa  199  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  44.29 
 
 		 246 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  42.92 
 
 		 240 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3081  ABC transporter, ATP-binding protein  42.99 
 
 		 223 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.501337  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0863  ABC transporter related  44.29 
 
 		 246 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3159  ABC transporter related  44.29 
 
 		 246 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3260  ABC transporter related  44.29 
 
 		 246 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  40.71 
 
 		 678 aa  198  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  40.71 
 
 		 678 aa  199  5e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0756  ABC transporter related  43.89 
 
 		 226 aa  198  5e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.688421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  43.38 
 
 		 263 aa  198  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.71 
 
 		 678 aa  198  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  42.6 
 
 		 234 aa  198  6e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3506  ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 238 aa  198  7e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  41.33 
 
 		 648 aa  198  7e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  40.62 
 
 		 654 aa  198  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  46.82 
 
 		 225 aa  198  7e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4104  ABC transporter related  40.44 
 
 		 235 aa  198  7e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0242374 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  41.33 
 
 		 648 aa  198  7e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2119  ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 		 241 aa  197  7.999999999999999e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0898  ABC transporter related  43.38 
 
 		 232 aa  197  9e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2864  ABC transporter related  42.47 
 
 		 230 aa  197  9e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  43.1 
 
 		 241 aa  197  9e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  42.34 
 
 		 653 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0321  ABC transporter related  40.62 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2991  ABC transporter related  43.84 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  44.8 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1979  transporter  44.55 
 
 		 227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  43.38 
 
 		 644 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  42.47 
 
 		 657 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0572  macrolide ABC transporter ATPase/inner membrane protein  42.41 
 
 		 665 aa  196  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.412698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  43.38 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0384  ABC transporter related protein  41.41 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>