More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1843 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1591  ABC transporter related  76.99 
 
 		 478 aa  737    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.243746 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0475  ABC transporter related  74.74 
 
 		 479 aa  715    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000128955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1645  ABC transporter related  73.85 
 
 		 478 aa  714    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.467673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1843  ABC transporter related  100 
 
 		 477 aa  944    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.468577 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1153  ABC transporter related  43.41 
 
 		 510 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0825  ABC transporter related  41.63 
 
 		 527 aa  363  5.0000000000000005e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.523889  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  45.14 
 
 		 525 aa  362  6e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21270  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  42.28 
 
 		 523 aa  358  9.999999999999999e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  40.76 
 
 		 507 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  40.76 
 
 		 507 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4192  ABC transporter related protein  43.27 
 
 		 545 aa  355  1e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  44.04 
 
 		 527 aa  355  1e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0995  ABC transporter related protein  44.12 
 
 		 534 aa  354  2e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1211  ABC transporter related  41.87 
 
 		 524 aa  353  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000459128 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  43.72 
 
 		 517 aa  352  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  42.77 
 
 		 511 aa  351  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0749  ABC transporter related protein  39.16 
 
 		 502 aa  350  4e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00961204  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 		 510 aa  350  5e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  38.96 
 
 		 508 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3948  ABC transporter related  43.71 
 
 		 504 aa  348  1e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  38.8 
 
 		 510 aa  348  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  38.8 
 
 		 510 aa  348  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.8 
 
 		 510 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2089  ABC transporter related protein  43.36 
 
 		 514 aa  347  3e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.8 
 
 		 510 aa  346  5e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.8 
 
 		 510 aa  346  5e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  38.8 
 
 		 510 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1668  ABC transporter-like protein  42.45 
 
 		 529 aa  345  1e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0834819  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  38.6 
 
 		 510 aa  345  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2599  ABC transporter-like  40.57 
 
 		 491 aa  345  1e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.766453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.6 
 
 		 510 aa  344  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4459  ABC transporter related  41.25 
 
 		 503 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1138  ABC transporter related  41 
 
 		 547 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0783  ABC transporter related  42.63 
 
 		 558 aa  342  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4171  ABC transporter related  41.37 
 
 		 503 aa  342  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0752  ABC transporter related  43.23 
 
 		 551 aa  342  1e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.971835  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  40.6 
 
 		 503 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1679  ABC transporter related  38.92 
 
 		 528 aa  340  2.9999999999999998e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0071828  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3176  ABC transporter related  41.57 
 
 		 517 aa  339  7e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128426  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25750  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  42.4 
 
 		 522 aa  338  9.999999999999999e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342553  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  41.09 
 
 		 505 aa  338  9.999999999999999e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0504  ABC transporter related protein  37.7 
 
 		 506 aa  337  2.9999999999999997e-91  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1147  ABC transporter related protein  38.48 
 
 		 521 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1786  ABC transporter related protein  38.48 
 
 		 505 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  43.75 
 
 		 501 aa  334  2e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  39.92 
 
 		 513 aa  334  2e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0005  ABC transporter related  40.2 
 
 		 521 aa  334  2e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0667369  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  39.36 
 
 		 510 aa  335  2e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1416  ABC transporter related  40.68 
 
 		 551 aa  333  3e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3337  ABC transporter related  41.55 
 
 		 511 aa  333  4e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0959  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 511 aa  333  5e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0296  ABC transporter related  39.52 
 
 		 510 aa  332  6e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000067661  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2946  ABC transporter related  41.39 
 
 		 527 aa  333  6e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000498253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0808  ABC transporter related  41.6 
 
 		 604 aa  332  8e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1510  ATPase  41.73 
 
 		 513 aa  331  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0106744  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  39.8 
 
 		 509 aa  331  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  42.68 
 
 		 512 aa  330  4e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 516 aa  329  8e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  39.32 
 
 		 507 aa  328  9e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  38.82 
 
 		 509 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3652  ABC transporter related  40.86 
 
 		 515 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  39.13 
 
 		 508 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1374  ABC transporter related  43.48 
 
 		 533 aa  328  2.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.534066 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1021  ABC transporter related protein  41.43 
 
 		 505 aa  327  3e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.728711 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0561  ABC transporter related protein  41.75 
 
 		 506 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04900  ATPase component of uncharacterized ABC-type transporter  42 
 
 		 532 aa  325  9e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0258  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  41.39 
 
 		 477 aa  325  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  38.1 
 
 		 511 aa  325  1e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3561  ABC transporter related  38 
 
 		 510 aa  325  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00305644  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05400  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  40.8 
 
 		 517 aa  324  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2210  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  40.32 
 
 		 525 aa  323  3e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2283  ABC transporter related  41.91 
 
 		 525 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.693336 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  38.07 
 
 		 511 aa  322  9.000000000000001e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3029  ABC transporter related  42.63 
 
 		 537 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.860382 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  42.34 
 
 		 498 aa  321  1.9999999999999998e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0677  ABC transporter-like protein  42.12 
 
 		 503 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.366203 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07930  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  39.92 
 
 		 534 aa  321  1.9999999999999998e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4402  ABC transporter related protein  40.84 
 
 		 524 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3673  ABC transporter related  36.65 
 
 		 491 aa  321  1.9999999999999998e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  40.69 
 
 		 506 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1076  ABC transporter related  37.52 
 
 		 515 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0403178  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3233  ABC transporter related  40.24 
 
 		 500 aa  320  3e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.405741  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0885  ABC transporter related  40.12 
 
 		 525 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317541  normal  0.753629 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3095  ABC transporter related  38.12 
 
 		 509 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0143  ABC transporter related  40.31 
 
 		 509 aa  320  3.9999999999999996e-86  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.58 
 
 		 511 aa  320  5e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6453  ABC transporter related  41.65 
 
 		 514 aa  320  5e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3238  ABC transporter related protein  40 
 
 		 532 aa  318  1e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.083946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1924  ABC transporter related  42.14 
 
 		 524 aa  317  3e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0164399 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1452  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37 
 
 		 506 aa  315  9.999999999999999e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00705254  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2176  ABC transporter related  39.64 
 
 		 509 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  37.1 
 
 		 514 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0527  ABC transporter related  39.8 
 
 		 541 aa  314  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0916  ABC transporter related  35.43 
 
 		 504 aa  314  2.9999999999999996e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1579  ABC transporter related protein  39.92 
 
 		 520 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  38.32 
 
 		 518 aa  313  5.999999999999999e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6253  ABC transporter related  40.08 
 
 		 503 aa  312  9e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.680335 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2768  ABC transporter related  37.68 
 
 		 510 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1607  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.02 
 
 		 528 aa  311  2e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0857  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.68 
 
 		 512 aa  311  2e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>