More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3029 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1510  ATPase  73.82 
 
 		 513 aa  761    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0106744  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3029  ABC transporter related  100 
 
 		 537 aa  1078    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.860382 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1924  ABC transporter related  71.35 
 
 		 524 aa  705    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0164399 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3233  ABC transporter related  60.93 
 
 		 500 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.405741  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0212  ABC transporter related  60.94 
 
 		 496 aa  588  1e-167  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.508828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0139  ATPase  49.29 
 
 		 510 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1416  ABC transporter related  45.44 
 
 		 551 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3176  ABC transporter related  45.78 
 
 		 517 aa  390  1e-107  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128426  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  46.31 
 
 		 505 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  41.55 
 
 		 503 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  40.59 
 
 		 513 aa  388  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  44.12 
 
 		 511 aa  382  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  40.08 
 
 		 509 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  41.95 
 
 		 507 aa  379  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1153  ABC transporter related  42.46 
 
 		 510 aa  376  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  44.42 
 
 		 512 aa  376  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0825  ABC transporter related  43.92 
 
 		 527 aa  375  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.523889  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  40.88 
 
 		 510 aa  372  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0005  ABC transporter related  43.22 
 
 		 521 aa  373  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0667369  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2176  ABC transporter related  42.03 
 
 		 509 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2599  ABC transporter-like  41.41 
 
 		 491 aa  371  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.766453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  42.04 
 
 		 525 aa  369  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  41.34 
 
 		 509 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0504  ABC transporter related protein  38.93 
 
 		 506 aa  370  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.76 
 
 		 510 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  41.2 
 
 		 508 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  40.76 
 
 		 510 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  40.76 
 
 		 510 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.37 
 
 		 510 aa  368  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.76 
 
 		 510 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.37 
 
 		 510 aa  365  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  41.98 
 
 		 511 aa  368  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  41.35 
 
 		 511 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  40.4 
 
 		 518 aa  367  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  42.19 
 
 		 508 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.76 
 
 		 510 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2283  ABC transporter related  43.85 
 
 		 525 aa  365  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.693336 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07930  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  43.03 
 
 		 534 aa  365  1e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  40.96 
 
 		 510 aa  365  1e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  43.06 
 
 		 517 aa  364  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  40.56 
 
 		 510 aa  363  3e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  44.53 
 
 		 501 aa  363  4e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0783  ABC transporter related  44.69 
 
 		 558 aa  362  6e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  41.27 
 
 		 509 aa  363  6e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2210  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  44.16 
 
 		 525 aa  362  8e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1374  ABC transporter related  43.49 
 
 		 533 aa  362  8e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.534066 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0995  ABC transporter related protein  43.9 
 
 		 534 aa  362  8e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0860  ABC transporter related  41.67 
 
 		 511 aa  362  9e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483579 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 		 507 aa  362  1e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1786  ABC transporter related protein  38.61 
 
 		 505 aa  362  1e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1147  ABC transporter related protein  38.61 
 
 		 521 aa  362  1e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0885  ABC transporter related  44.36 
 
 		 525 aa  362  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317541  normal  0.753629 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2258  ABC transporter related  40.78 
 
 		 514 aa  361  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334051  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1407  ABC transporter related  38 
 
 		 509 aa  361  2e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00366651  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2946  ABC transporter related  45.21 
 
 		 527 aa  361  2e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000498253 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  43.26 
 
 		 527 aa  360  2e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2933  ABC transporter related  42.74 
 
 		 509 aa  361  2e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2768  ABC transporter related  40.32 
 
 		 510 aa  360  5e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4459  ABC transporter related  43.45 
 
 		 503 aa  359  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1607  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  39.6 
 
 		 528 aa  359  9e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0527  ABC transporter related  42.72 
 
 		 541 aa  358  1.9999999999999998e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4171  ABC transporter related  43.23 
 
 		 503 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3990  ABC transporter related  45.64 
 
 		 530 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642016  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25750  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  43.79 
 
 		 522 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342553  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3652  ABC transporter related  42.89 
 
 		 515 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3337  ABC transporter related  42.71 
 
 		 511 aa  356  6.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 		 511 aa  355  1e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2089  ABC transporter related protein  43.45 
 
 		 514 aa  355  1e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4192  ABC transporter related protein  44.61 
 
 		 545 aa  355  1e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0344  putative ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  44.4 
 
 		 506 aa  354  2e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  42.89 
 
 		 518 aa  355  2e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  41.5 
 
 		 507 aa  354  2e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  41.5 
 
 		 507 aa  354  2e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  45.42 
 
 		 498 aa  355  2e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1988  ABC transporter related  44.4 
 
 		 506 aa  354  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.460194 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1679  ABC transporter related  39.76 
 
 		 528 aa  353  2.9999999999999997e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0071828  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0726  ABC transporter related  40.73 
 
 		 538 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0952  ABC transporter related  43.98 
 
 		 506 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.111594  normal  0.315399 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3238  ABC transporter related protein  41.92 
 
 		 532 aa  353  5e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.083946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2843  ribose import ATP-binding protein  40.74 
 
 		 548 aa  352  7e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  42.63 
 
 		 506 aa  352  8e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0143  ABC transporter related  39.72 
 
 		 509 aa  352  8e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3561  ABC transporter related  40.76 
 
 		 510 aa  352  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00305644  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  40.16 
 
 		 520 aa  351  2e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0749  ABC transporter related protein  39.92 
 
 		 502 aa  351  2e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00961204  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3948  ABC transporter related  45.63 
 
 		 504 aa  351  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  42.52 
 
 		 534 aa  351  2e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1668  ABC transporter-like protein  43.88 
 
 		 529 aa  350  3e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0834819  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21270  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  42.25 
 
 		 523 aa  350  5e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0765  ABC transporter related  39.52 
 
 		 511 aa  349  6e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000101087  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0857  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  40.12 
 
 		 512 aa  349  7e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3673  ABC transporter related  39.16 
 
 		 491 aa  348  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3095  ABC transporter related  42.18 
 
 		 509 aa  347  4e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4011  ABC transporter related  43.42 
 
 		 508 aa  346  5e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3308  ABC transporter related  41.85 
 
 		 509 aa  346  6e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1947  ribose import ATP-binding protein  42.57 
 
 		 514 aa  345  1e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632394  hitchhiker  0.000243405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1270  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.45 
 
 		 507 aa  345  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6738  ABC transporter related protein  41.07 
 
 		 532 aa  343  4e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1138  ABC transporter related  41.26 
 
 		 547 aa  342  8e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1579  ABC transporter related protein  40.58 
 
 		 520 aa  342  9e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>