More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1510 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_3029  ABC transporter related  73.82 
 
 
537 aa  761    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.860382 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1510  ATPase  100 
 
 
513 aa  1039    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0106744  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1924  ABC transporter related  69.69 
 
 
524 aa  701    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0164399 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0212  ABC transporter related  62.45 
 
 
496 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.508828  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3233  ABC transporter related  61.38 
 
 
500 aa  590  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.405741  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0139  ATPase  48.18 
 
 
510 aa  435  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1952  ABC transporter related  47.7 
 
 
505 aa  417  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677494 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1416  ABC transporter related  43.98 
 
 
551 aa  395  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.168356  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0995  ABC transporter related protein  45 
 
 
534 aa  385  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  41.9 
 
 
511 aa  385  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1781  ABC transporter related  42.17 
 
 
503 aa  385  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000368661  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2599  ABC transporter-like  42.54 
 
 
491 aa  383  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.766453  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0032  ABC transporter related  43.91 
 
 
512 aa  382  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1949  ABC transporter, ATP-binding protein  41.27 
 
 
507 aa  381  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.740579  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2768  ABC transporter related  42 
 
 
510 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1147  ABC transporter related protein  40.2 
 
 
521 aa  376  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1407  ABC transporter related  39.4 
 
 
509 aa  376  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00366651  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07930  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  44.14 
 
 
534 aa  377  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1786  ABC transporter related protein  40.2 
 
 
505 aa  376  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1791  ABC transporter related protein  44.55 
 
 
501 aa  374  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0245717  normal  0.194339 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0017  ABC transporter related  42.32 
 
 
507 aa  372  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3948  ABC transporter related  44.82 
 
 
504 aa  374  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1153  ABC transporter related  42.91 
 
 
510 aa  373  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3673  ABC transporter related  40.28 
 
 
491 aa  373  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  45.98 
 
 
498 aa  372  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1317  ABC transporter related  42.55 
 
 
525 aa  373  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0504  ABC transporter related protein  39.8 
 
 
506 aa  373  1e-102  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0783  ABC transporter related  44.69 
 
 
558 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2176  ABC transporter related  42.35 
 
 
509 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1679  ABC transporter related  42.17 
 
 
528 aa  370  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0071828  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1607  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  39.72 
 
 
528 aa  370  1e-101  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1634  ABC transporter related  43.5 
 
 
527 aa  369  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487663 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2946  ABC transporter related  45.31 
 
 
527 aa  371  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000498253 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0421  ABC transporter related  39.88 
 
 
510 aa  368  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0207744  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2069  ABC transporter related protein  41.87 
 
 
508 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0821  ABC transporter related  42.09 
 
 
507 aa  367  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0844  ABC transporter related  42.09 
 
 
507 aa  367  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1177  ABC transporter related  41.35 
 
 
509 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08780  ABC transporter related  40.6 
 
 
513 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000334619  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4192  ABC transporter related protein  43.59 
 
 
545 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  43.39 
 
 
516 aa  365  1e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0402  ABC transporter related  39.92 
 
 
509 aa  365  1e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.351513  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3176  ABC transporter related  42.77 
 
 
517 aa  364  2e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128426  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3176  ABC transporter related  43.59 
 
 
517 aa  364  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.111078  normal  0.67189 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0527  ABC transporter related  42.3 
 
 
541 aa  363  5.0000000000000005e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  43.95 
 
 
506 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1313  ABC transporter related  43.39 
 
 
534 aa  362  9e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.765078  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3642  sugar ABC transporter ATP-binding protein  40.16 
 
 
508 aa  362  1e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0749  ABC transporter related protein  40.49 
 
 
502 aa  361  1e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00961204  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3889  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.99 
 
 
510 aa  361  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.228489  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0955  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.13 
 
 
511 aa  359  6e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1446  ABC transporter-related protein  42.44 
 
 
514 aa  359  6e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1410  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.67 
 
 
510 aa  359  7e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0297132  hitchhiker  0.00935726 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.2 
 
 
510 aa  359  8e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40.2 
 
 
510 aa  359  8e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4459  ABC transporter related  41.15 
 
 
503 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  39.88 
 
 
511 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3532  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
510 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3926  sugar ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 
510 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0557636  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0073  ABC-type uncharacterized transport systems, ATPase component  39.76 
 
 
518 aa  357  1.9999999999999998e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25750  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  41.78 
 
 
522 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.342553  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3803  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
510 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201894 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3576  ABC transporter-related protein  44.73 
 
 
550 aa  356  3.9999999999999996e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.993778 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2843  ribose import ATP-binding protein  41.34 
 
 
548 aa  356  5.999999999999999e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132709  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  40.12 
 
 
511 aa  356  5.999999999999999e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4171  ABC transporter related  40.95 
 
 
503 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339269  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0677  ABC transporter-like protein  43.94 
 
 
503 aa  355  1e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.366203 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3550  ABC transporter, ATP-binding protein  39.8 
 
 
510 aa  354  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119888  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0825  ABC transporter related  40.79 
 
 
527 aa  354  2e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.523889  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1374  ABC transporter related  42.44 
 
 
533 aa  354  2e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.534066 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1021  ABC transporter related protein  43.11 
 
 
505 aa  354  2e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.728711 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0860  ABC transporter related  40.2 
 
 
511 aa  353  4e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0483579 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0143  ABC transporter related  39.6 
 
 
509 aa  353  5.9999999999999994e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2210  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  42.55 
 
 
525 aa  352  7e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3337  ABC transporter related  41.3 
 
 
511 aa  352  7e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.700488 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3990  ABC transporter related  42.32 
 
 
530 aa  351  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642016  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0885  ABC transporter related  42.55 
 
 
525 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.317541  normal  0.753629 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2442  ABC transporter-related protein  40.04 
 
 
510 aa  350  3e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142053  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0005  ABC transporter related  41.35 
 
 
521 aa  350  3e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0667369  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0765  ABC transporter related  38.48 
 
 
511 aa  348  9e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000101087  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0726  ABC transporter related  40.27 
 
 
538 aa  348  9e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2283  ABC transporter related  41.62 
 
 
525 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.693336 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6738  ABC transporter related protein  41.72 
 
 
532 aa  348  2e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6253  ABC transporter related  41.9 
 
 
503 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.680335 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21270  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  41.22 
 
 
523 aa  348  2e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0752  ABC transporter related  41.87 
 
 
551 aa  347  3e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.971835  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04900  ATPase component of uncharacterized ABC-type transporter  42.57 
 
 
532 aa  346  5e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05400  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  42.3 
 
 
517 aa  346  6e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2933  ABC transporter related  40.12 
 
 
509 aa  346  7e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0756  ABC transporter related  39.05 
 
 
509 aa  346  7e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3652  ABC transporter related  40.64 
 
 
515 aa  345  8e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0857  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  39.53 
 
 
512 aa  345  1e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1138  ABC transporter related  39.65 
 
 
547 aa  345  1e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1211  ABC transporter related  40.04 
 
 
524 aa  344  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000459128 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0296  ABC transporter related  39.49 
 
 
510 aa  344  2e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000067661  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2089  ABC transporter related protein  41.67 
 
 
514 aa  344  2e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0156  ABC transporter related  41.57 
 
 
518 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5419  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar/ribonucleotide)  44.27 
 
 
531 aa  343  4e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.210593  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3095  ABC transporter related  41.37 
 
 
509 aa  343  4e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4011  ABC transporter related  42.97 
 
 
508 aa  343  4e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>