More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2343 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  100 
 
 		 803 aa  1652    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  39.46 
 
 		 519 aa  372  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  39.29 
 
 		 529 aa  369  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  39.69 
 
 		 513 aa  362  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  35.04 
 
 		 523 aa  344  4e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  38.34 
 
 		 526 aa  343  5.999999999999999e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  35.12 
 
 		 526 aa  295  3e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  36.31 
 
 		 547 aa  289  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  32.48 
 
 		 544 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  52.99 
 
 		 323 aa  285  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  34.14 
 
 		 520 aa  279  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  30.14 
 
 		 517 aa  239  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  32.88 
 
 		 517 aa  229  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  32.97 
 
 		 566 aa  226  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  32.7 
 
 		 497 aa  225  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  30.95 
 
 		 533 aa  207  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  28.35 
 
 		 485 aa  204  8e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  31.15 
 
 		 485 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  31.08 
 
 		 531 aa  197  5.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  31.93 
 
 		 567 aa  197  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  29.03 
 
 		 499 aa  194  6e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  26.24 
 
 		 485 aa  194  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  31.44 
 
 		 533 aa  188  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  27.24 
 
 		 485 aa  188  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  26.94 
 
 		 485 aa  187  9e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  28.42 
 
 		 591 aa  186  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  27.39 
 
 		 485 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  27.39 
 
 		 485 aa  185  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4990  beta-lactamase  30.09 
 
 		 531 aa  185  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  27.84 
 
 		 485 aa  183  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  26.62 
 
 		 485 aa  183  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  26.62 
 
 		 485 aa  183  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  29.16 
 
 		 531 aa  183  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  26.73 
 
 		 485 aa  182  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  26.02 
 
 		 485 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  27.64 
 
 		 536 aa  181  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  28.36 
 
 		 530 aa  180  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  32.1 
 
 		 466 aa  179  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0735  beta-lactamase  28.1 
 
 		 551 aa  177  7e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  28.16 
 
 		 519 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  32.03 
 
 		 447 aa  175  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  28.27 
 
 		 503 aa  171  6e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  28.16 
 
 		 519 aa  170  9e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  28.63 
 
 		 533 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  28.63 
 
 		 533 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  30.44 
 
 		 455 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  28.88 
 
 		 533 aa  169  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  31.51 
 
 		 566 aa  167  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10925  hypothetical protein  30 
 
 		 562 aa  167  9e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  27.98 
 
 		 519 aa  165  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  27.01 
 
 		 603 aa  160  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8154  beta-lactamase  31.41 
 
 		 550 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1064  beta-lactamase  29.22 
 
 		 544 aa  159  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  28.94 
 
 		 455 aa  158  4e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  28.94 
 
 		 455 aa  158  4e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  28.16 
 
 		 620 aa  151  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  32.4 
 
 		 274 aa  141  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  25.8 
 
 		 426 aa  136  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  26.76 
 
 		 389 aa  135  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3023  Beta-lactamase class A-like protein  33.33 
 
 		 277 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0538064  normal  0.499976 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  27.03 
 
 		 539 aa  125  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  27.95 
 
 		 477 aa  124  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  26.5 
 
 		 385 aa  124  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  25.9 
 
 		 385 aa  124  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  27.32 
 
 		 498 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  27.6 
 
 		 822 aa  121  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  24.93 
 
 		 380 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  26.55 
 
 		 399 aa  119  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  27.46 
 
 		 655 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  28.07 
 
 		 507 aa  119  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  28.49 
 
 		 525 aa  118  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  27.08 
 
 		 1032 aa  116  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  26.56 
 
 		 669 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.62 
 
 		 480 aa  114  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4706  beta-lactamase  28.07 
 
 		 444 aa  114  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  30.43 
 
 		 576 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  25.48 
 
 		 377 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  26.84 
 
 		 386 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  28.89 
 
 		 356 aa  112  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  26.92 
 
 		 486 aa  112  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  26.57 
 
 		 461 aa  112  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  28.24 
 
 		 445 aa  112  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.35 
 
 		 442 aa  109  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  26.1 
 
 		 424 aa  109  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  27.92 
 
 		 483 aa  108  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  26.68 
 
 		 662 aa  108  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  27.54 
 
 		 505 aa  108  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.35 
 
 		 493 aa  108  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  26.11 
 
 		 543 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  25.99 
 
 		 470 aa  107  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  24.6 
 
 		 533 aa  106  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  27.08 
 
 		 483 aa  106  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  26.07 
 
 		 481 aa  105  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6467  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  22.53 
 
 		 551 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341842  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  29.05 
 
 		 1055 aa  104  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  25.14 
 
 		 367 aa  104  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  27.48 
 
 		 681 aa  104  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  29.06 
 
 		 445 aa  103  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  26 
 
 		 519 aa  103  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  26.69 
 
 		 490 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>