89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5194 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  100 
 
 		 323 aa  664    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  52.99 
 
 		 803 aa  285  5.999999999999999e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  34.01 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  29.82 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3023  Beta-lactamase class A-like protein  32.91 
 
 		 277 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0538064  normal  0.499976 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  30.31 
 
 		 576 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  29.5 
 
 		 333 aa  113  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  27.84 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3133  beta-lactamase  29.21 
 
 		 283 aa  109  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  26.28 
 
 		 468 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3361  beta-lactamase  28.57 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282427 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.05 
 
 		 422 aa  106  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  26.64 
 
 		 424 aa  105  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  27.66 
 
 		 375 aa  103  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  28.73 
 
 		 296 aa  102  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  29.15 
 
 		 423 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  25.51 
 
 		 259 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  25.51 
 
 		 259 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  27.14 
 
 		 508 aa  97.1  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  25.61 
 
 		 440 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  24.48 
 
 		 442 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  25.58 
 
 		 504 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  27.6 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  26.41 
 
 		 425 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0725  Beta-lactamase class A-like protein  29.09 
 
 		 370 aa  79  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.725916  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  29.43 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  25.97 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  25.16 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03900  beta-lactamase class A  29.95 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3723  Beta-lactamase class A-like  27.16 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000939313  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  25 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  23.89 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  24.56 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3212  beta-lactamase  28.12 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4021  Beta-lactamase  25.66 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  25.7 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2437  putative beta-lactamase precursor protein  26.18 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  24.76 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0003  beta-lactamase  29.82 
 
 		 281 aa  62  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000347481  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2827  Beta-lactamase  30.1 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.940774  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1250  hypothetical protein  23.85 
 
 		 504 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2749  Beta-lactamase  30.1 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1950  beta-lactamase family protein  23.69 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6642  putative beta-lactamase precursor protein  25 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08971  putative beta-lactamase  24.5 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.712716 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  24.08 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2352  Beta-lactamase  25 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445844 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2085  Beta-lactamase  24.57 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11921 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15311  putative beta-lactamase  20.82 
 
 		 357 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.709796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2102  twin-arginine translocation pathway signal  24.91 
 
 		 296 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0733882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2148  Beta-lactamase  24.91 
 
 		 296 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748404  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0697  putative beta-lactamase  20.75 
 
 		 357 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3441  Beta-lactamase class A-like protein  25 
 
 		 347 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2580  Beta-lactamase  25.09 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000559373  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  22.07 
 
 		 327 aa  54.7  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2728  Beta-lactamase  28.32 
 
 		 299 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0079236  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1446  beta-lactamase related protein  21.91 
 
 		 320 aa  53.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2386  beta-lactamase  21.48 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2388  Beta-lactamase  24.79 
 
 		 305 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.327196  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0007  hypothetical protein  30.11 
 
 		 480 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1460  Beta-lactamase  22.63 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  23.89 
 
 		 283 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0195  Beta-lactamase  23.83 
 
 		 288 aa  50.1  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.210334  normal  0.167544 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0228  twin-arginine translocation pathway signal  25.7 
 
 		 300 aa  49.7  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2389  Beta-lactamase  23.41 
 
 		 317 aa  49.3  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0172194  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  29.08 
 
 		 436 aa  49.3  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0183  Beta-lactamase  22.63 
 
 		 306 aa  49.3  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2652  hypothetical protein  29.82 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.511542  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2152  hypothetical protein  23.39 
 
 		 513 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0167915  hitchhiker  0.00298164 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2328  Beta-lactamase  26.96 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1529  Beta-lactamase  26.58 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4360  Beta-lactamase  24.3 
 
 		 297 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000108699  unclonable  0.00000562292 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2215  beta-lactamase  25.56 
 
 		 290 aa  47.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296886  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12104  class A beta-lactamase blaC  25.56 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0108435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  24.63 
 
 		 271 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3395  hypothetical protein  25.25 
 
 		 312 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.561584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1476  hypothetical protein  20.69 
 
 		 496 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1418  Beta-lactamase  24.35 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732214  hitchhiker  0.0000172267 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2862  beta-lactamase  23.55 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0320845 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  20.77 
 
 		 356 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03370  hypothetical protein  27.5 
 
 		 162 aa  44.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09313  hypothetical protein  25 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.610659  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4877  Beta-lactamase  27.78 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00066031  hitchhiker  0.000000000265752 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4929  Beta-lactamase  25.73 
 
 		 312 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432948  normal  0.0487719 
 
 
 
NC_002976  SERP1461  beta-lactamase  26.1 
 
 		 281 aa  44.3  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000606935  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3299  Beta-lactamase  23.72 
 
 		 291 aa  43.9  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1931  Beta-lactamase  25.5 
 
 		 335 aa  43.1  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5358  Beta-lactamase  25.31 
 
 		 312 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000938331  normal  0.124933 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1746  hypothetical protein  20.45 
 
 		 337 aa  42.7  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.470795  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>