38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3023 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3023  Beta-lactamase class A-like protein  100 
 
 		 277 aa  562  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0538064  normal  0.499976 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3361  beta-lactamase  47.48 
 
 		 282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3133  beta-lactamase  44.8 
 
 		 283 aa  216  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  33.33 
 
 		 803 aa  134  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  32.91 
 
 		 323 aa  126  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03900  beta-lactamase class A  36.91 
 
 		 273 aa  96.7  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  31.12 
 
 		 576 aa  95.5  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  24.69 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  28.52 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  25 
 
 		 504 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  25 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  29.67 
 
 		 423 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  24.24 
 
 		 508 aa  59.3  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  22.92 
 
 		 424 aa  55.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  28.71 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  26.84 
 
 		 440 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  20.09 
 
 		 468 aa  55.8  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  28.65 
 
 		 375 aa  55.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  23.2 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  23.2 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3972  beta-lactamase  27.65 
 
 		 305 aa  52.4  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0506092  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  30.14 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  22.4 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  25.56 
 
 		 425 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  29.23 
 
 		 327 aa  51.6  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6642  putative beta-lactamase precursor protein  26.15 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1987  hypothetical protein  27.32 
 
 		 297 aa  50.8  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.128578  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  25.56 
 
 		 425 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2437  putative beta-lactamase precursor protein  26.73 
 
 		 290 aa  50.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23411  hypothetical protein  27.12 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  22.84 
 
 		 422 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  25.22 
 
 		 383 aa  47  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0869  hypothetical protein  28.8 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  25.22 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3723  Beta-lactamase class A-like  27.78 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000939313  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1476  hypothetical protein  42 
 
 		 496 aa  42.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33460  hypothetical protein  28.83 
 
 		 424 aa  42.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3023  hypothetical protein  35.19 
 
 		 516 aa  42  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698448  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>