17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_03900 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_03900  beta-lactamase class A  100 
 
 		 273 aa  530  1e-150  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03370  hypothetical protein  44.19 
 
 		 162 aa  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3023  Beta-lactamase class A-like protein  36.05 
 
 		 277 aa  92.8  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0538064  normal  0.499976 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03380  hypothetical protein  51.19 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3133  beta-lactamase  37.55 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  29.95 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3361  beta-lactamase  36.65 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282427 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  32.39 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  24.05 
 
 		 803 aa  59.7  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1950  beta-lactamase family protein  32.02 
 
 		 381 aa  55.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  32.6 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  32.77 
 
 		 436 aa  53.5  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  23.29 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  23.29 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  29.18 
 
 		 388 aa  48.5  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  26.47 
 
 		 356 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  33.59 
 
 		 375 aa  44.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>