69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0715 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  100 
 
 		 388 aa  775    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1950  beta-lactamase family protein  75.54 
 
 		 381 aa  528  1e-149  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08971  putative beta-lactamase  62.6 
 
 		 386 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.712716 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  45.26 
 
 		 356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0697  putative beta-lactamase  41.67 
 
 		 357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15311  putative beta-lactamase  42.31 
 
 		 357 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.709796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.78 
 
 		 504 aa  229  5e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  42.61 
 
 		 375 aa  219  7e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  35.34 
 
 		 440 aa  212  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  35.47 
 
 		 423 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  34.08 
 
 		 508 aa  209  8e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  36.05 
 
 		 425 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  36.26 
 
 		 425 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  31.58 
 
 		 468 aa  179  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  36.84 
 
 		 442 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.52 
 
 		 424 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  30.51 
 
 		 576 aa  85.9  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  26.64 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  25 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  25.7 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  31.75 
 
 		 436 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  34.21 
 
 		 452 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3212  beta-lactamase  24.31 
 
 		 304 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184009 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33460  hypothetical protein  33.33 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  27.08 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  34.51 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2352  Beta-lactamase  25 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  25.68 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7688  putative beta-lactamase  34.95 
 
 		 458 aa  60.1  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  27.2 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  27.52 
 
 		 271 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  29.92 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  26.46 
 
 		 292 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  24.12 
 
 		 292 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  36.7 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03960  hypothetical protein  35.44 
 
 		 453 aa  55.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4838  putative lipoprotein LpqF  34.83 
 
 		 443 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  22.1 
 
 		 803 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  24.84 
 
 		 349 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4752  putative lipoprotein LpqF  34.83 
 
 		 443 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164946  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5138  putative lipoprotein LpqF  34.83 
 
 		 443 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  25.31 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2085  Beta-lactamase  23.05 
 
 		 296 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11921 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5353  beta-lactamase  30.7 
 
 		 454 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0183  Beta-lactamase  25.42 
 
 		 306 aa  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.52 
 
 		 422 aa  50.8  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2102  twin-arginine translocation pathway signal  23.05 
 
 		 296 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0733882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2148  Beta-lactamase  23.05 
 
 		 296 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748404  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1646  beta lactamase-related protein, putative  28.85 
 
 		 399 aa  50.1  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  22.46 
 
 		 259 aa  50.1  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  22.46 
 
 		 259 aa  50.1  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  27.95 
 
 		 296 aa  50.1  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  24.51 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2728  Beta-lactamase  30.5 
 
 		 299 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0079236  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1000  putative beta-lactamase  31.76 
 
 		 390 aa  48.9  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03900  beta-lactamase class A  29.18 
 
 		 273 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  21.53 
 
 		 291 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13626  lipoprotein lpqF  34.02 
 
 		 452 aa  47  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7641599999999997e-27  normal  0.0255048 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4021  Beta-lactamase  22.63 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0725  Beta-lactamase class A-like protein  29.07 
 
 		 370 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.725916  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1080  Beta-lactamase  20.9 
 
 		 301 aa  44.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0392714  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2552  Beta-lactamase  24.11 
 
 		 300 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802917  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0997  Beta-lactamase  25.11 
 
 		 304 aa  43.5  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2988  Beta-lactamase class A-like protein  25.45 
 
 		 286 aa  43.5  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1041  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.57 
 
 		 258 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2388  Beta-lactamase  29.55 
 
 		 305 aa  43.1  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.327196  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0046  beta-lactamase TEM  25.17 
 
 		 286 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00171312  normal  0.356541 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1580  beta-lactamase TEM  25.17 
 
 		 286 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.262835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0130  beta-lactamase TEM  25.17 
 
 		 286 aa  42.7  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>