93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4436 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  100 
 
 		 293 aa  571  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  36.16 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  32.84 
 
 		 300 aa  96.7  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  31.66 
 
 		 274 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  29.43 
 
 		 323 aa  87  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1067  Beta-lactamase class A  28.51 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.771599  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  26.26 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  26.26 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  31.33 
 
 		 576 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  34.01 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  34.52 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  31.98 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3723  Beta-lactamase class A-like  28.45 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000939313  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  30.29 
 
 		 425 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  30.29 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3361  beta-lactamase  31.53 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282427 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03900  beta-lactamase class A  32.6 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3023  Beta-lactamase class A-like protein  28.71 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0538064  normal  0.499976 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  29.95 
 
 		 468 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.36 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  23.91 
 
 		 803 aa  63.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1769  Beta-lactamase class A  27.01 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000145715  hitchhiker  0.000508947 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  27.27 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3133  beta-lactamase  32.2 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1856  Beta-lactamase class A  26.27 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000412045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  29.05 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  30.97 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  30 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  27.07 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5574  Beta-lactamase class A-like protein  29.41 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.94 
 
 		 504 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  30.22 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  28.57 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2437  putative beta-lactamase precursor protein  29.61 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  37.14 
 
 		 388 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  29.36 
 
 		 327 aa  53.5  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  26.32 
 
 		 333 aa  53.5  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  29.81 
 
 		 356 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  34.04 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6642  putative beta-lactamase precursor protein  28.02 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1950  beta-lactamase family protein  33.96 
 
 		 381 aa  50.4  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3212  beta-lactamase  27.39 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184009 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0567  hypothetical protein  26.24 
 
 		 309 aa  50.1  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.633626  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0105  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30 
 
 		 392 aa  50.1  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6760  Beta-lactamase class A-like protein  31.53 
 
 		 271 aa  49.3  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0689983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  22.61 
 
 		 422 aa  48.9  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  33.01 
 
 		 508 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  34.57 
 
 		 436 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0762  Beta-lactamase  28.52 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0608621  hitchhiker  0.000417556 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5138  putative lipoprotein LpqF  31.25 
 
 		 443 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4838  putative lipoprotein LpqF  31.25 
 
 		 443 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4752  putative lipoprotein LpqF  31.25 
 
 		 443 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164946  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08971  putative beta-lactamase  26.75 
 
 		 386 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.712716 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0026  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.4 
 
 		 413 aa  47.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.763858  normal  0.0451598 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33460  hypothetical protein  29.91 
 
 		 424 aa  47  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0978  Beta-lactamase  25 
 
 		 304 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0855  Beta-lactamase  25.55 
 
 		 296 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689397  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  30.53 
 
 		 283 aa  45.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  26.23 
 
 		 291 aa  46.2  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2257  hypothetical protein  26.92 
 
 		 434 aa  45.8  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3317  beta-lactamase class A-like protein  37.97 
 
 		 429 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.313271  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3972  beta-lactamase  27.35 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0506092  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1419  beta-lactamase  32.93 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.533278  hitchhiker  0.0000178355 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1122  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.68 
 
 		 481 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1291  beta-lactamase, putative  32.5 
 
 		 387 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2774  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.08 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.627135  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  26.32 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2148  Beta-lactamase  26.89 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748404  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7688  putative beta-lactamase  27.66 
 
 		 458 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2102  twin-arginine translocation pathway signal  26.89 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0733882  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  34.62 
 
 		 452 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3441  Beta-lactamase class A-like protein  24.46 
 
 		 347 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1985  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.41 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.798646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0228  twin-arginine translocation pathway signal  29.95 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2350  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase, putative  32.41 
 
 		 323 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0725  Beta-lactamase class A-like protein  23.04 
 
 		 370 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.725916  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3906  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.7 
 
 		 396 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1446  beta-lactamase related protein  24.51 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5358  Beta-lactamase  28.91 
 
 		 312 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000938331  normal  0.124933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2085  Beta-lactamase  26.89 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11921 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1278  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.11 
 
 		 398 aa  43.9  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.684132  normal  0.468226 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0011  hypothetical protein  24 
 
 		 430 aa  43.9  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4145  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.7 
 
 		 396 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1053  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase DacF  26.7 
 
 		 396 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00768142 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4929  Beta-lactamase  28.52 
 
 		 312 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432948  normal  0.0487719 
 
 
 
NC_011658  BCAH187_A4208  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase DacF  26.7 
 
 		 396 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4185  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase DacF  26.7 
 
 		 396 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5353  beta-lactamase  33.33 
 
 		 454 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2061  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  23.49 
 
 		 402 aa  43.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.884136  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15311  putative beta-lactamase  28.57 
 
 		 357 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.709796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0697  putative beta-lactamase  29.32 
 
 		 357 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1748  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.38 
 
 		 414 aa  42.7  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1080  Beta-lactamase  27.14 
 
 		 301 aa  42.4  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0392714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>