111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1202 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  100 
 
 		 259 aa  531  1e-150  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  100 
 
 		 259 aa  531  1e-150  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  26.14 
 
 		 315 aa  113  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  31.84 
 
 		 274 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  25.64 
 
 		 803 aa  99.8  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  25.51 
 
 		 323 aa  98.6  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  24.8 
 
 		 576 aa  96.7  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  23.83 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  24.02 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  24.46 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.15 
 
 		 424 aa  75.9  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  26.26 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  29.27 
 
 		 440 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  23.67 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  30.51 
 
 		 327 aa  72.4  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  28.78 
 
 		 468 aa  71.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  27.46 
 
 		 425 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.51 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  28.79 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1856  Beta-lactamase class A  29.41 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000412045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  26.84 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15311  putative beta-lactamase  30.6 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.709796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  26.98 
 
 		 504 aa  65.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  25.67 
 
 		 423 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  27.36 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  24.47 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5574  Beta-lactamase class A-like protein  19.91 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  26.24 
 
 		 508 aa  64.7  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0697  putative beta-lactamase  28.76 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  25.51 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3723  Beta-lactamase class A-like  22.88 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000939313  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1067  Beta-lactamase class A  27.54 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.771599  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0725  Beta-lactamase class A-like protein  33.59 
 
 		 370 aa  62.4  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.725916  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1080  Beta-lactamase  27.75 
 
 		 301 aa  62  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0392714  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4021  Beta-lactamase  26.9 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  22.17 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0003  beta-lactamase  28.38 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000347481  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  24.48 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  28.14 
 
 		 436 aa  55.5  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1746  hypothetical protein  26.67 
 
 		 337 aa  55.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.470795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2749  Beta-lactamase  27.95 
 
 		 281 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2827  Beta-lactamase  27.95 
 
 		 281 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.940774  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0567  hypothetical protein  28.86 
 
 		 309 aa  53.5  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.633626  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3212  beta-lactamase  22.13 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184009 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0228  twin-arginine translocation pathway signal  24.31 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  24.22 
 
 		 291 aa  52.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1632  Beta-lactamase class A  29.76 
 
 		 314 aa  52.4  0.000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.140001 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3972  beta-lactamase  26.04 
 
 		 305 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0506092  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2352  Beta-lactamase  23.5 
 
 		 297 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445844 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03900  beta-lactamase class A  23.29 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  21.4 
 
 		 349 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5947  hypothetical protein  23.4 
 
 		 341 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4574  Beta-lactamase  23.53 
 
 		 303 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3960  hypothetical protein  24.35 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2988  Beta-lactamase class A-like protein  27.43 
 
 		 286 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3441  Beta-lactamase class A-like protein  20.17 
 
 		 347 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3523  Beta-lactamase  31.07 
 
 		 338 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  22.46 
 
 		 388 aa  50.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3023  Beta-lactamase class A-like protein  23.2 
 
 		 277 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0538064  normal  0.499976 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2774  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.89 
 
 		 392 aa  49.3  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.627135  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2386  beta-lactamase  20.87 
 
 		 302 aa  49.3  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4145  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.71 
 
 		 396 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3986  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.71 
 
 		 396 aa  48.9  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.997885  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3816  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.71 
 
 		 396 aa  48.9  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3832  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.71 
 
 		 396 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4297  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.71 
 
 		 396 aa  48.9  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.715052  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4208  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase DacF  26.71 
 
 		 396 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4097  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase DacF  26.71 
 
 		 396 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2769e-26 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1991  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.14 
 
 		 404 aa  48.1  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4439  putative Beta-lactamase  24.4 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2580  Beta-lactamase  26.5 
 
 		 300 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000559373  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4185  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase DacF  26.03 
 
 		 396 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1053  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase DacF  26.03 
 
 		 396 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00768142 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1950  beta-lactamase family protein  22.61 
 
 		 381 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3361  beta-lactamase  22.17 
 
 		 282 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282427 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3906  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.71 
 
 		 396 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2728  Beta-lactamase  25.98 
 
 		 299 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0079236  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3317  beta-lactamase class A-like protein  27.35 
 
 		 429 aa  45.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.313271  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  22.73 
 
 		 283 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1461  beta-lactamase  30.97 
 
 		 281 aa  45.8  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000606935  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1646  beta lactamase-related protein, putative  28.57 
 
 		 399 aa  45.8  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3299  Beta-lactamase  24.72 
 
 		 291 aa  45.8  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06980  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.37 
 
 		 397 aa  45.8  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1012  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.27 
 
 		 392 aa  45.8  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.56176  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0130  beta-lactamase TEM  23.83 
 
 		 286 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1580  beta-lactamase TEM  23.83 
 
 		 286 aa  45.4  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.262835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0046  beta-lactamase TEM  23.83 
 
 		 286 aa  45.4  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00171312  normal  0.356541 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26600  hypothetical protein  29.51 
 
 		 380 aa  45.4  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.61546  normal  0.94722 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  24.14 
 
 		 353 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2552  Beta-lactamase  21.82 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802917  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0594  Beta-lactamase  24.89 
 
 		 296 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.272363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2437  putative beta-lactamase precursor protein  21.11 
 
 		 290 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2061  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.46 
 
 		 402 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.884136  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0612  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.53 
 
 		 381 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2410  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.66 
 
 		 391 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3136  Beta-lactamase  23.46 
 
 		 303 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570574  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0371  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.53 
 
 		 391 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  22.33 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2389  Beta-lactamase  22.69 
 
 		 317 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0172194  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0997  Beta-lactamase  26.87 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.940845 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>