145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_11351 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  100 
 
 		 356 aa  715    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08971  putative beta-lactamase  50.58 
 
 		 386 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.712716 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  45.16 
 
 		 388 aa  320  1.9999999999999998e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1950  beta-lactamase family protein  52.05 
 
 		 381 aa  319  5e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0697  putative beta-lactamase  42.82 
 
 		 357 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15311  putative beta-lactamase  42.24 
 
 		 357 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.709796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  39.2 
 
 		 504 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  37.54 
 
 		 508 aa  218  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  36.89 
 
 		 423 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  37.82 
 
 		 375 aa  195  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  39.19 
 
 		 440 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  30.68 
 
 		 468 aa  175  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  34.64 
 
 		 425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  34.64 
 
 		 425 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.57 
 
 		 424 aa  166  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  34.35 
 
 		 442 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  31.16 
 
 		 576 aa  83.6  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  33.16 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1041  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.89 
 
 		 258 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  28.84 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2728  Beta-lactamase  29.93 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0079236  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  26.25 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  22.57 
 
 		 274 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  26.77 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.25 
 
 		 422 aa  60.1  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  24.68 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4752  putative lipoprotein LpqF  35.96 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4838  putative lipoprotein LpqF  35.96 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5138  putative lipoprotein LpqF  35.96 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  24.48 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  24.48 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03960  hypothetical protein  30.84 
 
 		 453 aa  56.2  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33460  hypothetical protein  23.14 
 
 		 424 aa  56.2  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  30.48 
 
 		 327 aa  55.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  34.74 
 
 		 452 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0371  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.8 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6642  putative beta-lactamase precursor protein  26.47 
 
 		 287 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1285  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.9 
 
 		 403 aa  54.3  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1000  putative beta-lactamase  29.31 
 
 		 390 aa  54.3  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0272  penicillin-binding protein 6  31.58 
 
 		 384 aa  53.9  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0746018  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1646  beta lactamase-related protein, putative  32.29 
 
 		 399 aa  53.9  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1291  beta-lactamase, putative  37.17 
 
 		 387 aa  53.5  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1748  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.57 
 
 		 414 aa  52.8  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  23.21 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2229  Beta-lactamase  24.71 
 
 		 281 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0753416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  21.52 
 
 		 803 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2253  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.13 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2063  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.23 
 
 		 392 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0436268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1305  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.45 
 
 		 422 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00907014  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0599  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  22.6 
 
 		 441 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2552  Beta-lactamase  24.37 
 
 		 300 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802917  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  23.14 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2749  Beta-lactamase  26.6 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2827  Beta-lactamase  26.6 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.940774  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5353  beta-lactamase  33.71 
 
 		 454 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1556  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.25 
 
 		 381 aa  50.8  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0195  Beta-lactamase  23.81 
 
 		 288 aa  51.2  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.210334  normal  0.167544 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  21.26 
 
 		 353 aa  50.8  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  25.36 
 
 		 286 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0003  beta-lactamase  27.09 
 
 		 281 aa  50.4  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000347481  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2774  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.21 
 
 		 392 aa  50.4  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.627135  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0596  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.1 
 
 		 427 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.108606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  21.67 
 
 		 295 aa  49.7  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0636  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.36 
 
 		 427 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.317162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7688  putative beta-lactamase  31.71 
 
 		 458 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  31.67 
 
 		 293 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3212  beta-lactamase  24.73 
 
 		 304 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184009 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0594  Beta-lactamase  27.69 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.272363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0750  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.5 
 
 		 614 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000802893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  22.18 
 
 		 291 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0189  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.77 
 
 		 400 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0133986  normal  0.43472 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0855  Beta-lactamase  24.65 
 
 		 296 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689397  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03900  beta-lactamase class A  26.47 
 
 		 273 aa  47.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2061  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.19 
 
 		 402 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.884136  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1080  Beta-lactamase  24.15 
 
 		 301 aa  47.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0392714  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3723  Beta-lactamase class A-like  26.67 
 
 		 255 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000939313  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0183  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.77 
 
 		 400 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1267  Beta-lactamase  25.33 
 
 		 425 aa  47.4  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00143172  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2389  Beta-lactamase  26.84 
 
 		 317 aa  47  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0172194  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1466  hypothetical protein  26.85 
 
 		 430 aa  46.6  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2437  putative beta-lactamase precursor protein  25.52 
 
 		 290 aa  46.6  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2155  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.85 
 
 		 404 aa  46.6  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3906  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  22.01 
 
 		 396 aa  47  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0725  Beta-lactamase class A-like protein  28.85 
 
 		 370 aa  47  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.725916  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1517  hypothetical protein  26.85 
 
 		 430 aa  46.6  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3839  Beta-lactamase class A-like  31.4 
 
 		 402 aa  46.6  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000233386  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2595  beta-lactamase Bla1  26.43 
 
 		 276 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4145  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  22.01 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1855  Peptidoglycan-binding LysM  25.98 
 
 		 414 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2328  Beta-lactamase  23.19 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3972  beta-lactamase  21.76 
 
 		 305 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0506092  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0183  Beta-lactamase  20.63 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2190  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.83 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.212258  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4208  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase DacF  22.01 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4185  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase DacF  22.01 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1053  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase DacF  22.01 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00768142 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3986  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.4 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.997885  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3832  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.4 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4097  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase DacF  25.4 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2769e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4297  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.4 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.715052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>