61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3361 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3361  beta-lactamase  100 
 
 		 282 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3133  beta-lactamase  80.57 
 
 		 283 aa  427  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3023  Beta-lactamase class A-like protein  49.64 
 
 		 277 aa  245  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0538064  normal  0.499976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  28.57 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  32.6 
 
 		 803 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03900  beta-lactamase class A  37.5 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  29.72 
 
 		 442 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  29.02 
 
 		 576 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.28 
 
 		 504 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  26.88 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  26.48 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3723  Beta-lactamase class A-like  30.41 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000939313  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  31.53 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  22.61 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  22.61 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  26.86 
 
 		 508 aa  60.1  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  29.26 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2437  putative beta-lactamase precursor protein  28.77 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  26.86 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1476  hypothetical protein  34.41 
 
 		 496 aa  56.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  22.22 
 
 		 468 aa  55.8  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  30 
 
 		 315 aa  55.5  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  22.26 
 
 		 422 aa  54.3  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  24.17 
 
 		 383 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3299  Beta-lactamase  28.57 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  24.9 
 
 		 333 aa  53.1  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6642  putative beta-lactamase precursor protein  26.8 
 
 		 287 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  26.34 
 
 		 375 aa  52.8  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3972  beta-lactamase  30.17 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0506092  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  24.46 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1250  hypothetical protein  36.26 
 
 		 504 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  27 
 
 		 440 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1529  Beta-lactamase  31.95 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2328  Beta-lactamase  31.95 
 
 		 296 aa  50.4  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  27.31 
 
 		 296 aa  49.7  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2820  beta-lactamase Bla1  25.34 
 
 		 312 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128525 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2152  hypothetical protein  38 
 
 		 513 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0167915  hitchhiker  0.00298164 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3689  Beta-lactamase  30.82 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248785  normal  0.574937 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3023  hypothetical protein  40.43 
 
 		 516 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1040  class A beta-lactamase  35.12 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.257126  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0527  class A beta-lactamase  35.12 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.29059  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0257  class A beta-lactamase  35.12 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2553  beta-lactamase  33.51 
 
 		 309 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1283  class A beta-lactamase  33.51 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.162345  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5358  Beta-lactamase  30.39 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000938331  normal  0.124933 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1301  class A beta-lactamase  35.12 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4929  Beta-lactamase  30.39 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432948  normal  0.0487719 
 
 
 
NC_009075  BURPS668_A1381  class A beta-lactamase  34.52 
 
 		 314 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0489957  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3839  Beta-lactamase class A-like  35.24 
 
 		 402 aa  46.2  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000233386  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1450  class A beta-lactamase precursor  35.06 
 
 		 322 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03370  hypothetical protein  38.26 
 
 		 162 aa  45.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1855  Peptidoglycan-binding LysM  37.07 
 
 		 414 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0978  Beta-lactamase  32.21 
 
 		 304 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0809  Beta-lactamase  27.22 
 
 		 315 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0228  twin-arginine translocation pathway signal  31.33 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  31 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4360  Beta-lactamase  29.76 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000108699  unclonable  0.00000562292 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2552  Beta-lactamase  27.62 
 
 		 300 aa  43.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802917  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2862  beta-lactamase  27.22 
 
 		 314 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0320845 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2389  Beta-lactamase  29.63 
 
 		 317 aa  43.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0172194  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3438  Beta-lactamase  29.83 
 
 		 312 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000252783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>