136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1603 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  100 
 
 		 375 aa  743    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  47.63 
 
 		 504 aa  316  4e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  51.12 
 
 		 423 aa  315  9e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  42.7 
 
 		 508 aa  299  4e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  51.8 
 
 		 440 aa  299  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  41.14 
 
 		 468 aa  298  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  47.56 
 
 		 425 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  47.68 
 
 		 425 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  48.7 
 
 		 442 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  43.14 
 
 		 424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  38.2 
 
 		 388 aa  228  9e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  35.34 
 
 		 356 aa  213  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1950  beta-lactamase family protein  44.88 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0697  putative beta-lactamase  40.21 
 
 		 357 aa  202  6e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15311  putative beta-lactamase  39.86 
 
 		 357 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.709796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08971  putative beta-lactamase  35.19 
 
 		 386 aa  195  9e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.712716 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  32.25 
 
 		 353 aa  112  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.79 
 
 		 422 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  27.66 
 
 		 323 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  26.38 
 
 		 286 aa  99.8  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  30.12 
 
 		 300 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  27.68 
 
 		 274 aa  94.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  24.3 
 
 		 576 aa  93.6  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  26.18 
 
 		 291 aa  88.2  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  27.54 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  24.5 
 
 		 803 aa  86.3  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  26.53 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  25.39 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3212  beta-lactamase  27.68 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184009 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  25.21 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  27.44 
 
 		 383 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  30.67 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0183  Beta-lactamase  24.79 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03960  hypothetical protein  46.91 
 
 		 453 aa  73.2  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4021  Beta-lactamase  27.49 
 
 		 296 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2728  Beta-lactamase  35.47 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0079236  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0855  Beta-lactamase  28.1 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689397  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0228  twin-arginine translocation pathway signal  31.82 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0978  Beta-lactamase  29.3 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2352  Beta-lactamase  25.58 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445844 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0725  Beta-lactamase class A-like protein  28.37 
 
 		 370 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.725916  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3723  Beta-lactamase class A-like  27.75 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000939313  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2552  Beta-lactamase  26.69 
 
 		 300 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802917  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0594  Beta-lactamase  28.34 
 
 		 296 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.272363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  27.36 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  27.36 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4574  Beta-lactamase  28.95 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0997  Beta-lactamase  30.85 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  35.71 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33460  hypothetical protein  43.04 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  34.96 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0788  beta-lactamase  24.81 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2102  twin-arginine translocation pathway signal  27.2 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0733882  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4752  putative lipoprotein LpqF  42.86 
 
 		 443 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164946  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3317  beta-lactamase class A-like protein  39.8 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.313271  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2148  Beta-lactamase  27.2 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748404  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4838  putative lipoprotein LpqF  42.86 
 
 		 443 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5138  putative lipoprotein LpqF  42.86 
 
 		 443 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0174  Beta-lactamase  25.24 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2580  Beta-lactamase  29.32 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000559373  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  27.24 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13626  lipoprotein lpqF  41.67 
 
 		 452 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7641599999999997e-27  normal  0.0255048 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2085  Beta-lactamase  26.15 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11921 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  37.5 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0351  beta-lactamase  28.25 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.154712 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2215  beta-lactamase  25.19 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296886  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5353  beta-lactamase  40.86 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4439  putative Beta-lactamase  29.65 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0195  Beta-lactamase  27.4 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.210334  normal  0.167544 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  26.79 
 
 		 333 aa  57  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0446  Beta-lactamase  27.9 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0003  beta-lactamase  26.18 
 
 		 281 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000347481  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6642  putative beta-lactamase precursor protein  25.73 
 
 		 287 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2388  Beta-lactamase  26.72 
 
 		 305 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.327196  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1446  beta-lactamase related protein  24.5 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001392  beta-lactamase  27.41 
 
 		 283 aa  54.3  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000730239  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  30.22 
 
 		 293 aa  54.7  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2328  Beta-lactamase  28.77 
 
 		 296 aa  54.3  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1529  Beta-lactamase  28.77 
 
 		 296 aa  54.3  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1381  class A beta-lactamase  28.28 
 
 		 314 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0489957  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  24.42 
 
 		 283 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3523  Beta-lactamase  23.66 
 
 		 338 aa  53.9  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1460  Beta-lactamase  27.11 
 
 		 334 aa  53.5  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829053 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2862  beta-lactamase  24.81 
 
 		 314 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0320845 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1684  Beta-lactamase  29.79 
 
 		 312 aa  53.5  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132046  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0130  beta-lactamase TEM  28.35 
 
 		 286 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1580  beta-lactamase TEM  28.35 
 
 		 286 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.262835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0046  beta-lactamase TEM  28.35 
 
 		 286 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00171312  normal  0.356541 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1301  class A beta-lactamase  28.28 
 
 		 314 aa  53.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1011  beta-lactamase  27.04 
 
 		 290 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1646  beta lactamase-related protein, putative  34.74 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12104  class A beta-lactamase blaC  27.04 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0108435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2553  beta-lactamase  27.78 
 
 		 309 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2437  putative beta-lactamase precursor protein  25.87 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2421  Beta-lactamase  24.91 
 
 		 310 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000915272  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0366  Beta-lactamase  26.74 
 
 		 291 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0385843  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1000  putative beta-lactamase  30 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2820  Beta-lactamase  26.2 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.893397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  23.23 
 
 		 292 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0527  class A beta-lactamase  27.78 
 
 		 314 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.29059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>