70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1434 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_5138  putative lipoprotein LpqF  70.62 
 
 		 443 aa  648    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  100 
 
 		 452 aa  918    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5353  beta-lactamase  86.53 
 
 		 454 aa  785    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4838  putative lipoprotein LpqF  70.84 
 
 		 443 aa  649    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4752  putative lipoprotein LpqF  70.84 
 
 		 443 aa  649    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164946  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13626  lipoprotein lpqF  64.05 
 
 		 452 aa  546  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7641599999999997e-27  normal  0.0255048 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03960  hypothetical protein  41 
 
 		 453 aa  216  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33460  hypothetical protein  33.75 
 
 		 424 aa  182  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7688  putative beta-lactamase  30.49 
 
 		 458 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3317  beta-lactamase class A-like protein  31.4 
 
 		 429 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.313271  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1090  putative beta-lactamase  29.27 
 
 		 443 aa  99.4  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.9523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1000  putative beta-lactamase  31.05 
 
 		 390 aa  87  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1646  beta lactamase-related protein, putative  26.71 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  34.21 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  33.6 
 
 		 425 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08971  putative beta-lactamase  31.09 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.712716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.15 
 
 		 504 aa  61.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1950  beta-lactamase family protein  34.45 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  32.8 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  31.55 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  37.5 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  37.37 
 
 		 468 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3839  Beta-lactamase class A-like  31.2 
 
 		 402 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000233386  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1291  beta-lactamase, putative  29.22 
 
 		 387 aa  55.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  34.74 
 
 		 356 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  35 
 
 		 292 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  24.29 
 
 		 274 aa  54.3  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1748  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  38.55 
 
 		 414 aa  54.7  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  37.5 
 
 		 315 aa  53.5  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  32.29 
 
 		 508 aa  53.1  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  28.37 
 
 		 283 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  31.9 
 
 		 333 aa  51.6  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  37.23 
 
 		 576 aa  51.6  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0697  putative beta-lactamase  28.44 
 
 		 357 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.13 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15311  putative beta-lactamase  28.44 
 
 		 357 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.709796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2437  putative beta-lactamase precursor protein  30.34 
 
 		 290 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1030  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin binding protein)  34.09 
 
 		 442 aa  47.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  32 
 
 		 423 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  24.42 
 
 		 296 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6642  putative beta-lactamase precursor protein  32.56 
 
 		 287 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6760  Beta-lactamase class A-like protein  35.11 
 
 		 271 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0689983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1618  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  21.4 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1402  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  21.48 
 
 		 362 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.761987  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0075  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  33.96 
 
 		 511 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  28.03 
 
 		 292 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1748  peptidase  33.96 
 
 		 333 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429918  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1517  hypothetical protein  26.11 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1466  hypothetical protein  26.11 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1081  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  33.96 
 
 		 333 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.40772  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0344  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  33.96 
 
 		 333 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1242  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  33.96 
 
 		 333 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0745772  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1931  Beta-lactamase  36.84 
 
 		 335 aa  45.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  28 
 
 		 440 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  23.42 
 
 		 803 aa  44.3  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1617  hypothetical protein  22.7 
 
 		 363 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.482442  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3972  beta-lactamase  25.31 
 
 		 305 aa  44.3  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0506092  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1660  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase family protein  33.96 
 
 		 333 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0238  peptidase  33.96 
 
 		 333 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1743  hypothetical protein  22.7 
 
 		 363 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  34.62 
 
 		 293 aa  43.9  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2063  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.82 
 
 		 392 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0436268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3253  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.17 
 
 		 369 aa  43.9  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.309405  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1569  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  22.7 
 
 		 363 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  33 
 
 		 300 aa  43.9  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  30.7 
 
 		 436 aa  43.5  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2988  Beta-lactamase class A-like protein  24.6 
 
 		 286 aa  43.5  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0327  penicillin-binding transmembrane protein  34.78 
 
 		 397 aa  43.5  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5182  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.88 
 
 		 423 aa  43.1  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0679  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  36.84 
 
 		 404 aa  43.1  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.877856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>