45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2437 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2437  putative beta-lactamase precursor protein  100 
 
 		 290 aa  601  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6642  putative beta-lactamase precursor protein  83.86 
 
 		 287 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  26.25 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  29.5 
 
 		 576 aa  79.3  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  31.07 
 
 		 315 aa  67  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  22.46 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  26.18 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  28.15 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  24.91 
 
 		 504 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  28.94 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  25.31 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  26.98 
 
 		 468 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3301  beta-lactamase  25.09 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  22.32 
 
 		 803 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  26.36 
 
 		 423 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  25.71 
 
 		 424 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  29.41 
 
 		 293 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  25.87 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3361  beta-lactamase  27.4 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282427 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.21 
 
 		 422 aa  50.8  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3133  beta-lactamase  25.98 
 
 		 283 aa  49.3  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3972  beta-lactamase  24.79 
 
 		 305 aa  49.3  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0506092  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3023  Beta-lactamase class A-like protein  26.73 
 
 		 277 aa  48.9  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0538064  normal  0.499976 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  30.34 
 
 		 452 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  25.25 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  28.19 
 
 		 425 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  30.4 
 
 		 508 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  25.52 
 
 		 356 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2386  beta-lactamase  30.43 
 
 		 302 aa  46.6  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1255  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.63 
 
 		 451 aa  45.8  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.743344  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  27.52 
 
 		 425 aa  45.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5353  beta-lactamase  30.43 
 
 		 454 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2155  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.74 
 
 		 404 aa  45.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3960  hypothetical protein  24.34 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  21.11 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  21.11 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0599  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.32 
 
 		 441 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  27.73 
 
 		 283 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4838  putative lipoprotein LpqF  32.93 
 
 		 443 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4752  putative lipoprotein LpqF  32.93 
 
 		 443 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164946  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5138  putative lipoprotein LpqF  32.93 
 
 		 443 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0176  penicillin-binding protein 6  26.97 
 
 		 381 aa  43.1  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08971  putative beta-lactamase  24.39 
 
 		 386 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.712716 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1419  beta-lactamase  28.23 
 
 		 305 aa  42.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.533278  hitchhiker  0.0000178355 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0105  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.79 
 
 		 392 aa  42.4  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>