31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3317 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3317  beta-lactamase class A-like protein  100 
 
 		 429 aa  852    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.313271  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7688  putative beta-lactamase  40.44 
 
 		 458 aa  263  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1000  putative beta-lactamase  40.26 
 
 		 390 aa  158  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03960  hypothetical protein  37.54 
 
 		 453 aa  156  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1090  putative beta-lactamase  34.91 
 
 		 443 aa  142  9e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.9523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33460  hypothetical protein  29.72 
 
 		 424 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1646  beta lactamase-related protein, putative  36.02 
 
 		 399 aa  132  7.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4838  putative lipoprotein LpqF  32.29 
 
 		 443 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4752  putative lipoprotein LpqF  32.29 
 
 		 443 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164946  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5138  putative lipoprotein LpqF  31.97 
 
 		 443 aa  126  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5353  beta-lactamase  31.27 
 
 		 454 aa  123  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  31.4 
 
 		 452 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13626  lipoprotein lpqF  33.45 
 
 		 452 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7641599999999997e-27  normal  0.0255048 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  39.8 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  35.25 
 
 		 425 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  35.25 
 
 		 425 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.63 
 
 		 504 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  39.74 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.28 
 
 		 424 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  37.08 
 
 		 508 aa  54.3  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  34.78 
 
 		 468 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  37.37 
 
 		 440 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  36.73 
 
 		 442 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  40.24 
 
 		 436 aa  47  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08971  putative beta-lactamase  34.38 
 
 		 386 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.712716 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  33.33 
 
 		 274 aa  46.6  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15311  putative beta-lactamase  34.34 
 
 		 357 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.709796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0697  putative beta-lactamase  34.34 
 
 		 357 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  27.35 
 
 		 259 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  27.35 
 
 		 259 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  38.37 
 
 		 293 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>