38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1646 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1646  beta lactamase-related protein, putative  100 
 
 		 399 aa  796    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1000  putative beta-lactamase  62.17 
 
 		 390 aa  461  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1090  putative beta-lactamase  34.75 
 
 		 443 aa  159  7e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.9523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7688  putative beta-lactamase  36.1 
 
 		 458 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3317  beta-lactamase class A-like protein  36.02 
 
 		 429 aa  133  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.313271  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33460  hypothetical protein  29.88 
 
 		 424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03960  hypothetical protein  35.94 
 
 		 453 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5138  putative lipoprotein LpqF  30 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4752  putative lipoprotein LpqF  30 
 
 		 443 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4838  putative lipoprotein LpqF  30 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13626  lipoprotein lpqF  26.33 
 
 		 452 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7641599999999997e-27  normal  0.0255048 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  26.71 
 
 		 452 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5353  beta-lactamase  28.03 
 
 		 454 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08971  putative beta-lactamase  36.63 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.712716 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  32.02 
 
 		 436 aa  57  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  32.29 
 
 		 356 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1950  beta-lactamase family protein  30.84 
 
 		 381 aa  53.5  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  32.58 
 
 		 508 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  34.38 
 
 		 375 aa  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  35.14 
 
 		 315 aa  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  28.85 
 
 		 388 aa  50.4  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  32.14 
 
 		 283 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  29.75 
 
 		 442 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.93 
 
 		 504 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.25 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  30.34 
 
 		 274 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  32.32 
 
 		 425 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  31.25 
 
 		 468 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  28.12 
 
 		 295 aa  47  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  32.32 
 
 		 425 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  28.57 
 
 		 259 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  29.89 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  34.23 
 
 		 349 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  28.57 
 
 		 259 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  26.87 
 
 		 300 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1080  Beta-lactamase  29.32 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0392714  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  27.62 
 
 		 292 aa  43.5  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5574  Beta-lactamase class A-like protein  35.56 
 
 		 266 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>