202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3876 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  100 
 
 		 468 aa  942    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  50.31 
 
 		 504 aa  332  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  47.06 
 
 		 508 aa  317  3e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  44.29 
 
 		 423 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  45.74 
 
 		 440 aa  296  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  43.98 
 
 		 425 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  43.67 
 
 		 425 aa  283  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  47.96 
 
 		 375 aa  276  8e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  48.66 
 
 		 442 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  46.6 
 
 		 424 aa  268  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  31.3 
 
 		 388 aa  176  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  30.68 
 
 		 356 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1950  beta-lactamase family protein  35.53 
 
 		 381 aa  171  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0697  putative beta-lactamase  30.81 
 
 		 357 aa  170  7e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15311  putative beta-lactamase  30.81 
 
 		 357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.709796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08971  putative beta-lactamase  30.59 
 
 		 386 aa  154  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.712716 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  28.06 
 
 		 576 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  26.28 
 
 		 323 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  28.94 
 
 		 286 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  27.84 
 
 		 274 aa  101  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  28.57 
 
 		 353 aa  100  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  27.11 
 
 		 292 aa  94.4  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.47 
 
 		 422 aa  87.4  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  25.41 
 
 		 349 aa  87  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  26.39 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  29.06 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  25.37 
 
 		 803 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  29.12 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  29.11 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0725  Beta-lactamase class A-like protein  26.37 
 
 		 370 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.725916  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  28.78 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  28.78 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  22.82 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3212  beta-lactamase  25.69 
 
 		 304 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184009 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  25.09 
 
 		 383 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  34.34 
 
 		 436 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0183  Beta-lactamase  23.36 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  33.33 
 
 		 327 aa  65.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  26.45 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2552  Beta-lactamase  27.84 
 
 		 300 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802917  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1529  Beta-lactamase  25 
 
 		 296 aa  62  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2328  Beta-lactamase  25 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4021  Beta-lactamase  27.31 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  30.1 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  37.37 
 
 		 452 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  23.45 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2437  putative beta-lactamase precursor protein  26.98 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3133  beta-lactamase  24.45 
 
 		 283 aa  57  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6642  putative beta-lactamase precursor protein  24.71 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0105  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.53 
 
 		 392 aa  56.2  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2102  twin-arginine translocation pathway signal  25.43 
 
 		 296 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0733882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2148  Beta-lactamase  25.43 
 
 		 296 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748404  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3906  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.08 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  24.05 
 
 		 283 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4752  putative lipoprotein LpqF  36.9 
 
 		 443 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164946  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2215  beta-lactamase  25.68 
 
 		 290 aa  55.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4838  putative lipoprotein LpqF  36.9 
 
 		 443 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5353  beta-lactamase  36.36 
 
 		 454 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5138  putative lipoprotein LpqF  36.9 
 
 		 443 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3441  Beta-lactamase class A-like protein  23.32 
 
 		 347 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1000  putative beta-lactamase  25.85 
 
 		 390 aa  54.7  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2352  Beta-lactamase  25.54 
 
 		 297 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445844 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1080  Beta-lactamase  26.94 
 
 		 301 aa  55.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0392714  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4574  Beta-lactamase  26.76 
 
 		 303 aa  55.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1517  hypothetical protein  30.67 
 
 		 430 aa  54.7  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1466  hypothetical protein  30.06 
 
 		 430 aa  53.9  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1537  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.65 
 
 		 394 aa  54.3  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.532115 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2085  Beta-lactamase  24.78 
 
 		 296 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11921 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4185  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase DacF  29.27 
 
 		 396 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4145  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.27 
 
 		 396 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2421  Beta-lactamase  28.27 
 
 		 310 aa  52.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000915272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3986  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.27 
 
 		 396 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.997885  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3816  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.27 
 
 		 396 aa  53.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3832  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.27 
 
 		 396 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0351  beta-lactamase  27.98 
 
 		 296 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.154712 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4297  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.27 
 
 		 396 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.715052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4097  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase DacF  29.27 
 
 		 396 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2769e-26 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1053  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase DacF  29.27 
 
 		 396 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00768142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3317  beta-lactamase class A-like protein  34.48 
 
 		 429 aa  53.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.313271  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4208  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase DacF  29.27 
 
 		 396 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2020  beta-lactamase  27.78 
 
 		 319 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1855  Peptidoglycan-binding LysM  25 
 
 		 414 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001392  beta-lactamase  25.11 
 
 		 283 aa  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000730239  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0855  Beta-lactamase  24.88 
 
 		 296 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689397  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2728  Beta-lactamase  26.94 
 
 		 299 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0079236  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1460  Beta-lactamase  23.49 
 
 		 334 aa  52  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829053 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2774  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.07 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.627135  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0978  Beta-lactamase  26.21 
 
 		 304 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2190  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.84 
 
 		 292 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.212258  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0371  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.53 
 
 		 391 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0953  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.33 
 
 		 480 aa  51.2  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0483  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.22 
 
 		 392 aa  51.2  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.540939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3735  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.47 
 
 		 455 aa  50.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2061  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.8 
 
 		 402 aa  50.4  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.884136  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1775  penicillin-binding protein dacf precursor  28.8 
 
 		 402 aa  50.4  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1305  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.11 
 
 		 422 aa  50.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00907014  normal  0.179482 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33460  hypothetical protein  28.46 
 
 		 424 aa  50.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0544  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.33 
 
 		 407 aa  50.4  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0788  beta-lactamase  21.67 
 
 		 418 aa  50.4  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2827  Beta-lactamase  24.77 
 
 		 281 aa  50.4  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.940774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>