118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1147 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  100 
 
 
423 aa  857    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  50.42 
 
 
504 aa  338  9e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  58.25 
 
 
440 aa  333  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  48.43 
 
 
508 aa  318  9e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  56.02 
 
 
375 aa  300  2e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  44.29 
 
 
468 aa  301  2e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  51.99 
 
 
425 aa  298  8e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  51.99 
 
 
425 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  51.6 
 
 
442 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  53.88 
 
 
424 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  36.89 
 
 
356 aa  209  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  36.03 
 
 
388 aa  208  1e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15311  putative beta-lactamase  36.62 
 
 
357 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.709796  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0697  putative beta-lactamase  36 
 
 
357 aa  203  4e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08971  putative beta-lactamase  37.39 
 
 
386 aa  203  6e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.712716 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1950  beta-lactamase family protein  42.75 
 
 
381 aa  197  4.0000000000000005e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  30.94 
 
 
353 aa  106  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  26.42 
 
 
576 aa  106  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  29.03 
 
 
803 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  29.15 
 
 
323 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  30.16 
 
 
292 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  25.94 
 
 
286 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  30.26 
 
 
296 aa  88.6  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  31.56 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  27.11 
 
 
349 aa  83.6  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  29.28 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  26.51 
 
 
274 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  29.41 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  28.62 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.08 
 
 
422 aa  73.6  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3212  beta-lactamase  25.94 
 
 
304 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.184009 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2728  Beta-lactamase  35.47 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0079236  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  30.61 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0725  Beta-lactamase class A-like protein  27.59 
 
 
370 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.725916  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4021  Beta-lactamase  28.51 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2552  Beta-lactamase  27.94 
 
 
300 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802917  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  25.67 
 
 
259 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  25.67 
 
 
259 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  25.8 
 
 
383 aa  64.3  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0228  twin-arginine translocation pathway signal  29.66 
 
 
300 aa  63.5  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0351  beta-lactamase  28.04 
 
 
296 aa  61.2  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.154712 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0183  Beta-lactamase  23.69 
 
 
306 aa  61.2  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2352  Beta-lactamase  28.23 
 
 
297 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445844 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6642  putative beta-lactamase precursor protein  29.95 
 
 
287 aa  60.1  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2215  beta-lactamase  27.27 
 
 
290 aa  57.4  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296886  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3023  Beta-lactamase class A-like protein  29.67 
 
 
277 aa  57.4  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0538064  normal  0.499976 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0130  beta-lactamase TEM  29.29 
 
 
286 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1580  beta-lactamase TEM  29.29 
 
 
286 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.262835  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0046  beta-lactamase TEM  29.29 
 
 
286 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00171312  normal  0.356541 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  33.01 
 
 
436 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0594  Beta-lactamase  25.25 
 
 
296 aa  57  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.272363  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2020  beta-lactamase  28.02 
 
 
319 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2749  Beta-lactamase  25.98 
 
 
281 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2827  Beta-lactamase  25.98 
 
 
281 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.940774  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3317  beta-lactamase class A-like protein  39.74 
 
 
429 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.313271  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1080  Beta-lactamase  24.54 
 
 
301 aa  55.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0392714  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  23.41 
 
 
291 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0788  beta-lactamase  27.74 
 
 
418 aa  54.7  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1855  Peptidoglycan-binding LysM  28.77 
 
 
414 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0855  Beta-lactamase  26.29 
 
 
296 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689397  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3299  Beta-lactamase  27.59 
 
 
291 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  27.07 
 
 
293 aa  53.9  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  25.9 
 
 
283 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0978  Beta-lactamase  26.76 
 
 
304 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518614  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2328  Beta-lactamase  27.83 
 
 
296 aa  53.5  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2437  putative beta-lactamase precursor protein  26.36 
 
 
290 aa  53.5  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1529  Beta-lactamase  26.24 
 
 
296 aa  53.5  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33460  hypothetical protein  36.71 
 
 
424 aa  53.5  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0003  beta-lactamase  25 
 
 
281 aa  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000347481  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1458  beta-lactamase  24.72 
 
 
306 aa  52.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1446  beta-lactamase related protein  22.49 
 
 
320 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1476  hypothetical protein  21.91 
 
 
496 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2421  Beta-lactamase  27.03 
 
 
310 aa  51.6  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000915272  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0446  Beta-lactamase  27.4 
 
 
297 aa  51.2  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2102  twin-arginine translocation pathway signal  27.19 
 
 
296 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0733882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2148  Beta-lactamase  27.19 
 
 
296 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748404  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1000  putative beta-lactamase  25.78 
 
 
390 aa  50.4  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4439  putative Beta-lactamase  30.71 
 
 
288 aa  50.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0997  Beta-lactamase  26.18 
 
 
304 aa  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03960  hypothetical protein  34.48 
 
 
453 aa  50.1  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0388079  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4009  Beta-lactamase  27.47 
 
 
315 aa  50.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001392  beta-lactamase  28.31 
 
 
283 aa  50.1  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000730239  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  30.3 
 
 
327 aa  49.7  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2085  Beta-lactamase  26.43 
 
 
296 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.11921 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1419  beta-lactamase  24 
 
 
305 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.533278  hitchhiker  0.0000178355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4752  putative lipoprotein LpqF  33.33 
 
 
443 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4838  putative lipoprotein LpqF  33.33 
 
 
443 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5138  putative lipoprotein LpqF  33.33 
 
 
443 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1435  Beta-lactamase  28.19 
 
 
288 aa  48.9  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3523  Beta-lactamase  28.93 
 
 
338 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2862  beta-lactamase  25.19 
 
 
314 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0320845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1011  beta-lactamase  28 
 
 
290 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0174  Beta-lactamase  26 
 
 
388 aa  47  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.537021  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  31.96 
 
 
452 aa  47  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09313  hypothetical protein  24.13 
 
 
303 aa  47  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.610659  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1460  Beta-lactamase  25.1 
 
 
334 aa  46.6  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829053 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1164  Beta-lactamase  28.95 
 
 
300 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590965  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2580  Beta-lactamase  27.86 
 
 
300 aa  46.6  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000559373  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5353  beta-lactamase  33.33 
 
 
454 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3723  Beta-lactamase class A-like  26.53 
 
 
255 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000939313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>