62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3104 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  100 
 
 		 292 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  74.22 
 
 		 286 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3212  beta-lactamase  53.45 
 
 		 304 aa  310  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184009 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  32.06 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  31.85 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  28.87 
 
 		 576 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  27.11 
 
 		 468 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  25.27 
 
 		 424 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  26.42 
 
 		 423 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  25.81 
 
 		 442 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  25.4 
 
 		 508 aa  84.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  27.55 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  25.49 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  26.39 
 
 		 440 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  25.73 
 
 		 349 aa  79.7  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  24.21 
 
 		 504 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  26.58 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  26.67 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  26.67 
 
 		 425 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  21.96 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1746  hypothetical protein  29.17 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.470795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  24.56 
 
 		 323 aa  68.9  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  24 
 
 		 353 aa  65.9  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  24.47 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  24.47 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  24.47 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  23.6 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  26.42 
 
 		 383 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.11 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1250  hypothetical protein  23.37 
 
 		 504 aa  59.3  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2152  hypothetical protein  22.05 
 
 		 513 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0167915  hitchhiker  0.00298164 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  24.12 
 
 		 388 aa  55.8  0.0000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15311  putative beta-lactamase  24.01 
 
 		 357 aa  55.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.709796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  22.52 
 
 		 803 aa  55.8  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5341  hypothetical protein  27.5 
 
 		 350 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0697  putative beta-lactamase  25.73 
 
 		 357 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1950  beta-lactamase family protein  23.35 
 
 		 381 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3023  hypothetical protein  20.97 
 
 		 516 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  28.26 
 
 		 293 aa  52.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2552  Beta-lactamase  25 
 
 		 300 aa  52.4  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802917  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1080  Beta-lactamase  23.65 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0392714  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08971  putative beta-lactamase  28.03 
 
 		 386 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.712716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2386  beta-lactamase  30.56 
 
 		 302 aa  50.1  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  24.79 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1458  beta-lactamase  29.89 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  28.26 
 
 		 436 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2827  Beta-lactamase  27.92 
 
 		 281 aa  47  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.940774  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2749  Beta-lactamase  27.92 
 
 		 281 aa  47  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1446  beta-lactamase related protein  21.12 
 
 		 320 aa  46.2  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  28.03 
 
 		 452 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5947  hypothetical protein  22.89 
 
 		 341 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0855  Beta-lactamase  21.86 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689397  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1419  beta-lactamase  32.26 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.533278  hitchhiker  0.0000178355 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0183  Beta-lactamase  21.08 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  23.43 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0997  Beta-lactamase  23.04 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3960  hypothetical protein  25.36 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1646  beta lactamase-related protein, putative  27.62 
 
 		 399 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2257  hypothetical protein  30.6 
 
 		 434 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  26.85 
 
 		 327 aa  43.1  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0003  beta-lactamase  26.8 
 
 		 281 aa  42.7  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000347481  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2553  beta-lactamase  21.43 
 
 		 309 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>