123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4151 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  100 
 
 		 300 aa  622  1e-177  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  32.82 
 
 		 315 aa  122  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  32.05 
 
 		 274 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  27.84 
 
 		 323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  29.44 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  27.56 
 
 		 576 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  30.61 
 
 		 383 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  27.78 
 
 		 803 aa  102  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  30.12 
 
 		 375 aa  99  9e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  26.84 
 
 		 508 aa  89.4  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  26.39 
 
 		 468 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  28.11 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  24.91 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  29.28 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  26.75 
 
 		 504 aa  82.4  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  32.84 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  27.13 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  26.45 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0228  twin-arginine translocation pathway signal  27.97 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  27.31 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  26.58 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  27.73 
 
 		 440 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  26.72 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  26.45 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  26.67 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  23.67 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  23.67 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  26.89 
 
 		 425 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0725  Beta-lactamase class A-like protein  26.01 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.725916  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3212  beta-lactamase  25.48 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  29.57 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  26.47 
 
 		 425 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.62 
 
 		 422 aa  69.7  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3023  Beta-lactamase class A-like protein  24.69 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0538064  normal  0.499976 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2552  Beta-lactamase  26.85 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802917  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3723  Beta-lactamase class A-like  26.29 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000939313  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1446  beta-lactamase related protein  25.76 
 
 		 320 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08971  putative beta-lactamase  28.77 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.712716 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  25.78 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0594  Beta-lactamase  25.78 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.272363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2352  Beta-lactamase  26.34 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445844 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2328  Beta-lactamase  25.62 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2247  beta-lactamase  25.84 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3361  beta-lactamase  26.52 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282427 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1529  Beta-lactamase  25.62 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1381  class A beta-lactamase  26.39 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0489957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2522  beta-lactamase Bla1  25.73 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102568 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2595  beta-lactamase Bla1  25.6 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06370  beta-lactamase  22.76 
 
 		 283 aa  57  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001392  beta-lactamase  25.28 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000730239  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1283  class A beta-lactamase  27.16 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.162345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2328  beta-lactamase  25.31 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.641353  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4021  Beta-lactamase  24.9 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2291  beta-lactamase  25.31 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000475261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2507  beta-lactamase  25.31 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1684  Beta-lactamase  25.78 
 
 		 312 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132046  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  25.31 
 
 		 388 aa  55.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2728  Beta-lactamase  23.63 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0079236  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0257  class A beta-lactamase  27.16 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0527  class A beta-lactamase  27.16 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.29059  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1301  class A beta-lactamase  27.16 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1040  class A beta-lactamase  27.16 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.257126  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2553  beta-lactamase  26.72 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2331  Beta-lactamase  25.41 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000573292  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2388  Beta-lactamase  27.35 
 
 		 305 aa  53.5  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.327196  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1011  beta-lactamase  26.42 
 
 		 290 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2085  Beta-lactamase  23.89 
 
 		 296 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11921 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3133  beta-lactamase  27.31 
 
 		 283 aa  53.1  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2820  beta-lactamase Bla1  25.3 
 
 		 312 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128525 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5574  Beta-lactamase class A-like protein  26.12 
 
 		 266 aa  52.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1450  class A beta-lactamase precursor  25.75 
 
 		 322 aa  52.4  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  23.21 
 
 		 356 aa  52.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1164  Beta-lactamase  24.31 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2102  twin-arginine translocation pathway signal  23.89 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0733882  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1067  Beta-lactamase class A  24.19 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.771599  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2148  Beta-lactamase  23.89 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748404  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1457  Beta-lactamase  25.79 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3441  Beta-lactamase class A-like protein  23.25 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0130  beta-lactamase TEM  27.66 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1580  beta-lactamase TEM  27.66 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.262835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0046  beta-lactamase TEM  27.66 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00171312  normal  0.356541 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1950  beta-lactamase family protein  25.31 
 
 		 381 aa  50.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1390  Beta-lactamase  25.9 
 
 		 289 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585114  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0183  Beta-lactamase  24.22 
 
 		 306 aa  50.1  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2862  beta-lactamase  23.11 
 
 		 314 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0320845 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0978  Beta-lactamase  24.27 
 
 		 304 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2820  Beta-lactamase  26.18 
 
 		 289 aa  50.1  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.893397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  32.14 
 
 		 436 aa  49.7  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2503  beta-lactamase  24.5 
 
 		 312 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3299  Beta-lactamase  25.21 
 
 		 291 aa  49.7  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4574  Beta-lactamase  22.79 
 
 		 303 aa  49.3  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2539  beta-lactamase  25.6 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000363771  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0446  Beta-lactamase  21.77 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3689  Beta-lactamase  25.42 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248785  normal  0.574937 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3523  Beta-lactamase  22.56 
 
 		 338 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  22.89 
 
 		 291 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33460  hypothetical protein  32.69 
 
 		 424 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1418  Beta-lactamase  24.48 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732214  hitchhiker  0.0000172267 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2020  beta-lactamase  25.19 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1250  hypothetical protein  20.95 
 
 		 504 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>