69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_08971 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_08971  putative beta-lactamase  100 
 
 		 386 aa  775    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.712716 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  62.6 
 
 		 388 aa  478  1e-134  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1950  beta-lactamase family protein  63.33 
 
 		 381 aa  429  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  49.04 
 
 		 356 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0697  putative beta-lactamase  43.41 
 
 		 357 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15311  putative beta-lactamase  43.82 
 
 		 357 aa  312  5.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.709796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  38.37 
 
 		 504 aa  233  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  36.99 
 
 		 508 aa  225  9e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  38.62 
 
 		 423 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  40 
 
 		 440 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  35.71 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  37.68 
 
 		 425 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  39.7 
 
 		 375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  34.92 
 
 		 442 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.01 
 
 		 424 aa  179  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  30.25 
 
 		 468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  26.86 
 
 		 576 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  26.51 
 
 		 323 aa  67  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  29.22 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  25.58 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  24.66 
 
 		 286 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  25.27 
 
 		 353 aa  62  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  30.92 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03960  hypothetical protein  38.64 
 
 		 453 aa  61.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  31.09 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  29.41 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1646  beta lactamase-related protein, putative  36.63 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7688  putative beta-lactamase  37.08 
 
 		 458 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33460  hypothetical protein  29.84 
 
 		 424 aa  57  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  27.78 
 
 		 296 aa  57  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  23.58 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  23.6 
 
 		 295 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2728  Beta-lactamase  31.21 
 
 		 299 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0079236  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2085  Beta-lactamase  23.31 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11921 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4838  putative lipoprotein LpqF  34.83 
 
 		 443 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.55 
 
 		 422 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2352  Beta-lactamase  23.7 
 
 		 297 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445844 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4752  putative lipoprotein LpqF  34.83 
 
 		 443 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164946  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5138  putative lipoprotein LpqF  34.83 
 
 		 443 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2148  Beta-lactamase  23.31 
 
 		 296 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748404  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2102  twin-arginine translocation pathway signal  23.31 
 
 		 296 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0733882  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1041  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.59 
 
 		 258 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3212  beta-lactamase  26.22 
 
 		 304 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184009 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  21.72 
 
 		 803 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  28.03 
 
 		 292 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1000  putative beta-lactamase  34.83 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5353  beta-lactamase  29.06 
 
 		 454 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  30.09 
 
 		 327 aa  50.8  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0046  beta-lactamase TEM  25.79 
 
 		 286 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00171312  normal  0.356541 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1580  beta-lactamase TEM  25.79 
 
 		 286 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.262835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  25.45 
 
 		 383 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0130  beta-lactamase TEM  25.79 
 
 		 286 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2215  beta-lactamase  31.13 
 
 		 290 aa  47.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296886  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  27.54 
 
 		 333 aa  47  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3317  beta-lactamase class A-like protein  34.38 
 
 		 429 aa  47  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.313271  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1291  beta-lactamase, putative  33.96 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0596  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.89 
 
 		 427 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.108606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  27.42 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1499  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.46 
 
 		 412 aa  45.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1748  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.66 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0636  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.89 
 
 		 427 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.317162 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3723  Beta-lactamase class A-like  23.66 
 
 		 255 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000939313  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  29.63 
 
 		 436 aa  44.3  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0183  Beta-lactamase  23.44 
 
 		 306 aa  44.3  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2580  Beta-lactamase  25.48 
 
 		 300 aa  43.9  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000559373  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1080  Beta-lactamase  21.79 
 
 		 301 aa  43.5  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0392714  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3299  Beta-lactamase  38.46 
 
 		 291 aa  43.1  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5706  Beta-lactamase  37.5 
 
 		 327 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13626  lipoprotein lpqF  30.1 
 
 		 452 aa  43.1  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7641599999999997e-27  normal  0.0255048 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>