114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0182 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  100 
 
 		 327 aa  671    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  32.82 
 
 		 436 aa  161  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0174  Beta-lactamase  28.87 
 
 		 388 aa  89.4  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3523  Beta-lactamase  29.5 
 
 		 338 aa  86.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  38.98 
 
 		 576 aa  82.8  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  36.19 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.83 
 
 		 422 aa  72.8  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  30.51 
 
 		 259 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  30.51 
 
 		 259 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0788  beta-lactamase  27.65 
 
 		 418 aa  72  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  32.52 
 
 		 508 aa  69.7  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.55 
 
 		 504 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  33.93 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  36.28 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  33.33 
 
 		 468 aa  65.9  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  35.25 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  35.71 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  24.82 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  31.62 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  29.31 
 
 		 383 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  34.51 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  23.3 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2328  Beta-lactamase  27.11 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1950  beta-lactamase family protein  34.51 
 
 		 381 aa  59.3  0.00000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4021  Beta-lactamase  38.6 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  24.24 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2085  Beta-lactamase  33.33 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11921 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1529  Beta-lactamase  26.76 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2102  twin-arginine translocation pathway signal  34.82 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0733882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2148  Beta-lactamase  34.82 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748404  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0997  Beta-lactamase  34.19 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2352  Beta-lactamase  34.15 
 
 		 297 aa  57  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445844 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2552  Beta-lactamase  26.74 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802917  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  30.1 
 
 		 425 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  28.79 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  27.13 
 
 		 803 aa  56.2  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1164  Beta-lactamase  32.23 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  30.1 
 
 		 425 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0725  Beta-lactamase class A-like protein  27 
 
 		 370 aa  55.8  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.725916  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4752  putative lipoprotein LpqF  35.24 
 
 		 443 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4838  putative lipoprotein LpqF  35.24 
 
 		 443 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5138  putative lipoprotein LpqF  35.24 
 
 		 443 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  30.48 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  22.07 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0195  Beta-lactamase  30.77 
 
 		 288 aa  54.7  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.210334  normal  0.167544 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26600  hypothetical protein  30.36 
 
 		 380 aa  53.9  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.61546  normal  0.94722 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  29.36 
 
 		 293 aa  53.5  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0013  hypothetical protein  31.25 
 
 		 428 aa  53.1  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3960  hypothetical protein  34.93 
 
 		 295 aa  53.1  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12104  class A beta-lactamase blaC  25 
 
 		 307 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0108435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2728  Beta-lactamase  26.2 
 
 		 299 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0079236  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1080  Beta-lactamase  28.46 
 
 		 301 aa  52.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0392714  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2580  Beta-lactamase  27.91 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000559373  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3023  Beta-lactamase class A-like protein  30.09 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0538064  normal  0.499976 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  30.28 
 
 		 353 aa  50.8  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08971  putative beta-lactamase  30.09 
 
 		 386 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.712716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1457  Beta-lactamase  30.16 
 
 		 305 aa  51.2  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0183  Beta-lactamase  28.21 
 
 		 306 aa  50.4  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1418  Beta-lactamase  29.37 
 
 		 300 aa  49.7  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732214  hitchhiker  0.0000172267 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  29.79 
 
 		 286 aa  50.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  30.3 
 
 		 423 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0446  Beta-lactamase  30.97 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1283  class A beta-lactamase  32.52 
 
 		 295 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.162345  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001392  beta-lactamase  28.32 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000730239  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7688  putative beta-lactamase  33.96 
 
 		 458 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0257  class A beta-lactamase  32.52 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0527  class A beta-lactamase  32.52 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.29059  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1040  class A beta-lactamase  32.52 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.257126  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06370  beta-lactamase  25.86 
 
 		 283 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0697  putative beta-lactamase  32.14 
 
 		 357 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2749  Beta-lactamase  24.32 
 
 		 281 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2827  Beta-lactamase  24.32 
 
 		 281 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.940774  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1461  beta-lactamase  25.23 
 
 		 281 aa  47  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000606935  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0003  beta-lactamase  24.32 
 
 		 281 aa  46.6  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000347481  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2632  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  36.9 
 
 		 382 aa  47  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1324  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.32 
 
 		 492 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.378775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1931  Beta-lactamase  31.71 
 
 		 335 aa  46.6  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  28.95 
 
 		 271 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15311  putative beta-lactamase  32.14 
 
 		 357 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.709796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0953  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  32.32 
 
 		 480 aa  46.2  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1301  class A beta-lactamase  31.71 
 
 		 314 aa  45.8  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4439  putative Beta-lactamase  30.25 
 
 		 288 aa  45.8  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0351  beta-lactamase  29.27 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.154712 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3735  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.33 
 
 		 455 aa  45.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4574  Beta-lactamase  30.36 
 
 		 303 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2421  Beta-lactamase  27.87 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000915272  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3136  Beta-lactamase  28.7 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570574  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1245  beta-lactamase  25.58 
 
 		 287 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2020  beta-lactamase  24.37 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03960  hypothetical protein  38.96 
 
 		 453 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1684  Beta-lactamase  27.34 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132046  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2553  beta-lactamase  30.89 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1450  class A beta-lactamase precursor  30.89 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1381  class A beta-lactamase  31.71 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0489957  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1460  Beta-lactamase  26.39 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829053 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5358  Beta-lactamase  31.4 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000938331  normal  0.124933 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2247  beta-lactamase  26.72 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3438  Beta-lactamase  31.4 
 
 		 312 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000252783  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4929  Beta-lactamase  31.4 
 
 		 312 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432948  normal  0.0487719 
 
 
 
NC_012850  Rleg_0978  Beta-lactamase  24.21 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518614  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>