127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4574 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4574  Beta-lactamase  100 
 
 		 303 aa  602  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2552  Beta-lactamase  56.9 
 
 		 300 aa  299  4e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802917  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2328  Beta-lactamase  57 
 
 		 296 aa  286  4e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1529  Beta-lactamase  57 
 
 		 296 aa  285  5e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0088  Beta-lactamase  50.17 
 
 		 291 aa  271  9e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.748085 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0366  Beta-lactamase  58.91 
 
 		 291 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0385843  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0446  Beta-lactamase  53.26 
 
 		 297 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0351  beta-lactamase  52.65 
 
 		 296 aa  268  7e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.154712 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1164  Beta-lactamase  56.55 
 
 		 300 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0594  Beta-lactamase  50.17 
 
 		 296 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.272363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0855  Beta-lactamase  49.65 
 
 		 296 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689397  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0978  Beta-lactamase  51.53 
 
 		 304 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1381  class A beta-lactamase  47.28 
 
 		 314 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0489957  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2553  beta-lactamase  47.28 
 
 		 309 aa  248  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2728  Beta-lactamase  51.15 
 
 		 299 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0079236  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1301  class A beta-lactamase  47.28 
 
 		 314 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1283  class A beta-lactamase  46.94 
 
 		 295 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.162345  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0257  class A beta-lactamase  46.94 
 
 		 314 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0527  class A beta-lactamase  46.94 
 
 		 314 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.29059  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1040  class A beta-lactamase  46.94 
 
 		 314 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.257126  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4009  Beta-lactamase  48.24 
 
 		 315 aa  246  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4439  putative Beta-lactamase  50.4 
 
 		 288 aa  245  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2580  Beta-lactamase  42.9 
 
 		 300 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000559373  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0997  Beta-lactamase  52.34 
 
 		 304 aa  241  7.999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0228  twin-arginine translocation pathway signal  44.75 
 
 		 300 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0762  Beta-lactamase  49.6 
 
 		 315 aa  239  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0608621  hitchhiker  0.000417556 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1450  class A beta-lactamase precursor  47.87 
 
 		 322 aa  239  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2215  beta-lactamase  52.55 
 
 		 290 aa  238  9e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296886  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4929  Beta-lactamase  49.8 
 
 		 312 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432948  normal  0.0487719 
 
 
 
NC_010552  BamMC406_4877  Beta-lactamase  47.7 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00066031  hitchhiker  0.000000000265752 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5358  Beta-lactamase  49.41 
 
 		 312 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000938331  normal  0.124933 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3231  Beta-lactamase  47.37 
 
 		 299 aa  235  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3689  Beta-lactamase  49.43 
 
 		 302 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248785  normal  0.574937 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4360  Beta-lactamase  50.2 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000108699  unclonable  0.00000562292 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2820  Beta-lactamase  46.15 
 
 		 289 aa  225  9e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.893397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1435  Beta-lactamase  45.83 
 
 		 288 aa  221  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3438  Beta-lactamase  49.41 
 
 		 312 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000252783  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1011  beta-lactamase  47.66 
 
 		 290 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1080  Beta-lactamase  44.62 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0392714  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1390  Beta-lactamase  50 
 
 		 289 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585114  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1684  Beta-lactamase  46.88 
 
 		 312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132046  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2229  Beta-lactamase  46.15 
 
 		 281 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0753416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0130  beta-lactamase TEM  44.09 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3136  Beta-lactamase  43.52 
 
 		 303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570574  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1580  beta-lactamase TEM  44.09 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.262835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0046  beta-lactamase TEM  44.09 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00171312  normal  0.356541 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5163  Beta-lactamase  43.7 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0157119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5706  Beta-lactamase  41 
 
 		 327 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4082  Beta-lactamase  52.56 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0136649 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12104  class A beta-lactamase blaC  41.16 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0108435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0195  Beta-lactamase  41.76 
 
 		 288 aa  188  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.210334  normal  0.167544 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2522  beta-lactamase Bla1  39.83 
 
 		 306 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102568 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2291  beta-lactamase  39.83 
 
 		 312 aa  186  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000475261  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2328  beta-lactamase  39.83 
 
 		 301 aa  185  8e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.641353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2507  beta-lactamase  39.83 
 
 		 309 aa  185  9e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2247  beta-lactamase  40 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1931  Beta-lactamase  46.32 
 
 		 335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2020  beta-lactamase  39.76 
 
 		 319 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2862  beta-lactamase  38.35 
 
 		 314 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0320845 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2421  Beta-lactamase  37.5 
 
 		 310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000915272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2595  beta-lactamase Bla1  38.98 
 
 		 276 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4048  Beta-lactamase  42.96 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.94661 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2503  beta-lactamase  36.12 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2085  Beta-lactamase  43.7 
 
 		 296 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11921 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2331  Beta-lactamase  38.4 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000573292  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001392  beta-lactamase  35.77 
 
 		 283 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000730239  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2102  twin-arginine translocation pathway signal  43.7 
 
 		 296 aa  178  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0733882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2148  Beta-lactamase  43.7 
 
 		 296 aa  178  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748404  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2388  Beta-lactamase  42.68 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.327196  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2539  beta-lactamase  39.15 
 
 		 301 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000363771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2820  beta-lactamase Bla1  38.14 
 
 		 312 aa  176  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128525 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1245  Beta-lactamase  41.85 
 
 		 332 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2389  Beta-lactamase  39.84 
 
 		 317 aa  175  9e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0172194  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2178  Beta-lactamase  45.38 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.198919  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06370  beta-lactamase  36.86 
 
 		 283 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0809  Beta-lactamase  36.7 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4021  Beta-lactamase  46.41 
 
 		 296 aa  172  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1418  Beta-lactamase  39.44 
 
 		 300 aa  172  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732214  hitchhiker  0.0000172267 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3769  Beta-lactamase  43.6 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4599  Beta-lactamase  43.6 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1457  Beta-lactamase  39.44 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2352  Beta-lactamase  40.15 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445844 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5706  Beta-lactamase  43.2 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0394955 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1245  beta-lactamase  36 
 
 		 287 aa  166  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4029  Beta-lactamase  43.04 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3962  Beta-lactamase  41.76 
 
 		 315 aa  155  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3299  Beta-lactamase  37.36 
 
 		 291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4487  Beta-lactamase  43.04 
 
 		 299 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.745574 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2749  Beta-lactamase  29.34 
 
 		 281 aa  136  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2827  Beta-lactamase  29.34 
 
 		 281 aa  136  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.940774  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1461  beta-lactamase  29.8 
 
 		 281 aa  132  7.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000606935  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0003  beta-lactamase  28.57 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000347481  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  30.2 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  26.2 
 
 		 295 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  31.69 
 
 		 353 aa  95.5  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  27.83 
 
 		 349 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3523  Beta-lactamase  29 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0788  beta-lactamase  29.46 
 
 		 418 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0174  Beta-lactamase  27.16 
 
 		 388 aa  79.7  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0183  Beta-lactamase  29.36 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>