152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0280 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  100 
 
 		 353 aa  709    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  37.06 
 
 		 349 aa  162  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  33.57 
 
 		 295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  32.98 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  32.25 
 
 		 375 aa  112  7.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0183  Beta-lactamase  32.47 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2552  Beta-lactamase  34.6 
 
 		 300 aa  109  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802917  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  30.82 
 
 		 423 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  29.1 
 
 		 440 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0978  Beta-lactamase  32.81 
 
 		 304 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  29.53 
 
 		 508 aa  102  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  31.31 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1460  Beta-lactamase  30.71 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829053 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2580  Beta-lactamase  28.08 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000559373  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  32.66 
 
 		 425 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2352  Beta-lactamase  31.84 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  28.57 
 
 		 468 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0855  Beta-lactamase  31.75 
 
 		 296 aa  99.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689397  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3523  Beta-lactamase  27.6 
 
 		 338 aa  97.1  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0366  Beta-lactamase  33.61 
 
 		 291 aa  97.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0385843  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4021  Beta-lactamase  33.05 
 
 		 296 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2328  Beta-lactamase  32.07 
 
 		 296 aa  95.9  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0351  beta-lactamase  32.26 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.154712 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.08 
 
 		 504 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1529  Beta-lactamase  32.07 
 
 		 296 aa  95.9  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0174  Beta-lactamase  28.03 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4574  Beta-lactamase  32.64 
 
 		 303 aa  95.9  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0997  Beta-lactamase  31.56 
 
 		 304 aa  94  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  26.59 
 
 		 442 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0446  Beta-lactamase  31.23 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1011  beta-lactamase  30.35 
 
 		 290 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1164  Beta-lactamase  33.2 
 
 		 300 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0594  Beta-lactamase  30.32 
 
 		 296 aa  89.7  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.272363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0762  Beta-lactamase  31.25 
 
 		 315 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0608621  hitchhiker  0.000417556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1390  Beta-lactamase  32.21 
 
 		 289 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585114  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  24.56 
 
 		 424 aa  87.8  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2728  Beta-lactamase  32.58 
 
 		 299 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0079236  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1435  Beta-lactamase  30.83 
 
 		 288 aa  87.8  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0788  beta-lactamase  32.09 
 
 		 418 aa  87  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2820  Beta-lactamase  31.25 
 
 		 289 aa  86.7  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.893397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1450  class A beta-lactamase precursor  30.97 
 
 		 322 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2215  beta-lactamase  29.03 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296886  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  29.81 
 
 		 803 aa  85.1  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  31.44 
 
 		 436 aa  83.2  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3689  Beta-lactamase  30.77 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248785  normal  0.574937 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  27.56 
 
 		 274 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1080  Beta-lactamase  29.03 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0392714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2020  beta-lactamase  26.62 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4877  Beta-lactamase  29.47 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00066031  hitchhiker  0.000000000265752 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2102  twin-arginine translocation pathway signal  33.6 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0733882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2148  Beta-lactamase  33.6 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748404  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2229  Beta-lactamase  28.88 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0753416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2085  Beta-lactamase  33.2 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11921 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2421  Beta-lactamase  26.57 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000915272  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4360  Beta-lactamase  30.12 
 
 		 297 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000108699  unclonable  0.00000562292 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4439  putative Beta-lactamase  31.69 
 
 		 288 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0228  twin-arginine translocation pathway signal  31.03 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2862  beta-lactamase  24.61 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0320845 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0809  Beta-lactamase  26.43 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4929  Beta-lactamase  31.75 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432948  normal  0.0487719 
 
 
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  32.23 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5358  Beta-lactamase  31.35 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000938331  normal  0.124933 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4009  Beta-lactamase  30.72 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3231  Beta-lactamase  29.84 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4082  Beta-lactamase  34.32 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0136649 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06370  beta-lactamase  26.01 
 
 		 283 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1283  class A beta-lactamase  28.33 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.162345  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0257  class A beta-lactamase  28.62 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0527  class A beta-lactamase  28.62 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.29059  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1040  class A beta-lactamase  28.62 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.257126  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2291  beta-lactamase  26.41 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000475261  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1301  class A beta-lactamase  28.62 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  26.45 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001392  beta-lactamase  26.15 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000730239  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  34.01 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0088  Beta-lactamase  27.89 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.748085 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2553  beta-lactamase  28.29 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2749  Beta-lactamase  26.27 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2827  Beta-lactamase  26.27 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.940774  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2328  beta-lactamase  26.83 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.641353  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2507  beta-lactamase  26.83 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0003  beta-lactamase  26.27 
 
 		 281 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000347481  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1684  Beta-lactamase  30.08 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1381  class A beta-lactamase  29.2 
 
 		 314 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0489957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2522  beta-lactamase Bla1  26.41 
 
 		 306 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102568 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3136  Beta-lactamase  31.32 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570574  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  24.6 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1931  Beta-lactamase  31.2 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2503  beta-lactamase  26.57 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1446  beta-lactamase related protein  32.08 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5706  Beta-lactamase  28.02 
 
 		 327 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338924  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2388  Beta-lactamase  28.63 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.327196  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2247  beta-lactamase  26.01 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  30.54 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2331  Beta-lactamase  25.96 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000573292  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5163  Beta-lactamase  29.39 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0157119 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1461  beta-lactamase  25.81 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000606935  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2595  beta-lactamase Bla1  25.37 
 
 		 276 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3438  Beta-lactamase  30.56 
 
 		 312 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000252783  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2820  beta-lactamase Bla1  25.8 
 
 		 312 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128525 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>