40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1446 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1446  beta-lactamase related protein  100 
 
 		 320 aa  627  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  52 
 
 		 283 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  42.07 
 
 		 292 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3972  beta-lactamase  40.78 
 
 		 305 aa  148  9e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0506092  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2386  beta-lactamase  31.69 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3960  hypothetical protein  30.56 
 
 		 295 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1419  beta-lactamase  31.58 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.533278  hitchhiker  0.0000178355 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1458  beta-lactamase  31.82 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2988  Beta-lactamase class A-like protein  31.6 
 
 		 286 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3301  beta-lactamase  28.82 
 
 		 304 aa  90.1  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  23.64 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  32.08 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  28.75 
 
 		 576 aa  70.1  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  27.39 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  25.76 
 
 		 300 aa  67  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  24.9 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  24.9 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  24.54 
 
 		 504 aa  62.4  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  26.57 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  27.1 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  21.89 
 
 		 440 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  19.41 
 
 		 803 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  24.5 
 
 		 375 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  21.91 
 
 		 323 aa  53.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  20.4 
 
 		 508 aa  52.8  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  23.08 
 
 		 442 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  22.49 
 
 		 423 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5574  Beta-lactamase class A-like protein  36.7 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3212  beta-lactamase  24.23 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184009 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  19.31 
 
 		 424 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  20.18 
 
 		 422 aa  50.4  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  20 
 
 		 468 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  31.69 
 
 		 436 aa  47  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  21.12 
 
 		 292 aa  46.2  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1931  Beta-lactamase  34.52 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  26.24 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6760  Beta-lactamase class A-like protein  31.9 
 
 		 271 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0689983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2152  hypothetical protein  27.03 
 
 		 513 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0167915  hitchhiker  0.00298164 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4021  Beta-lactamase  26.59 
 
 		 296 aa  43.5  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  26.09 
 
 		 452 aa  42.7  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.685838 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>