184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4774 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  100 
 
 		 442 aa  885    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  40.69 
 
 		 424 aa  358  9.999999999999999e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  51.6 
 
 		 423 aa  294  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  50.37 
 
 		 440 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  48.81 
 
 		 504 aa  281  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  52.9 
 
 		 508 aa  276  4e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  48.66 
 
 		 468 aa  271  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  48.7 
 
 		 375 aa  267  2.9999999999999995e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  45.85 
 
 		 425 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  45.51 
 
 		 425 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08971  putative beta-lactamase  35.25 
 
 		 386 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.712716 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  36.84 
 
 		 388 aa  177  5e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0697  putative beta-lactamase  35.85 
 
 		 357 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15311  putative beta-lactamase  34.98 
 
 		 357 aa  164  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.709796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1950  beta-lactamase family protein  36.03 
 
 		 381 aa  163  6e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  34.35 
 
 		 356 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1466  cell wall hydrolase/autolysin  50 
 
 		 627 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000100817  normal  0.166489 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4727  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  50.78 
 
 		 619 aa  133  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0152355  normal  0.26499 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1798  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  54.39 
 
 		 623 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0589  cell wall hydrolase/autolysin  48.37 
 
 		 612 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0604  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.37 
 
 		 612 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.594044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1465  cell wall hydrolase/autolysin  46.88 
 
 		 627 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000155726  normal  0.0455493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0339  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.03 
 
 		 706 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0861  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.68 
 
 		 631 aa  122  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000195536  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0862  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.93 
 
 		 619 aa  120  7e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00159133  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3732  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40 
 
 		 338 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000534753  normal  0.117524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3678  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40 
 
 		 338 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  26.38 
 
 		 576 aa  104  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3123  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.46 
 
 		 332 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  26.91 
 
 		 274 aa  99.8  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  27.8 
 
 		 286 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  27.14 
 
 		 349 aa  93.2  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  26.59 
 
 		 353 aa  92.8  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  24.48 
 
 		 323 aa  90.5  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2360  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.46 
 
 		 344 aa  90.1  7e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.26107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  30.22 
 
 		 315 aa  89.7  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  25.81 
 
 		 292 aa  87  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.6 
 
 		 287 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0435442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  28.11 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  23.49 
 
 		 803 aa  81.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  29.68 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2552  Beta-lactamase  30.57 
 
 		 300 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802917  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  26.67 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2728  Beta-lactamase  33.33 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0079236  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2352  Beta-lactamase  24.82 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445844 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  24.55 
 
 		 291 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.81 
 
 		 422 aa  73.2  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3133  beta-lactamase  29.6 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3212  beta-lactamase  23.79 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184009 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  27.41 
 
 		 333 aa  69.7  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4021  Beta-lactamase  26.19 
 
 		 296 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0788  beta-lactamase  26.54 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33460  hypothetical protein  38.1 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0183  Beta-lactamase  23.6 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  27.83 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  33.93 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0174  Beta-lactamase  25.9 
 
 		 388 aa  67  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  26.84 
 
 		 259 aa  67  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  26.84 
 
 		 259 aa  67  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0725  Beta-lactamase class A-like protein  31.71 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.725916  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3361  beta-lactamase  29.72 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282427 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  31.98 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0997  Beta-lactamase  28.81 
 
 		 304 aa  66.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  26.59 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3523  Beta-lactamase  24.71 
 
 		 338 aa  62.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0351  beta-lactamase  29.69 
 
 		 296 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.154712 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1634  hypothetical protein  31.31 
 
 		 236 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  23.98 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2215  beta-lactamase  26.92 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296886  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1390  Beta-lactamase  28.16 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0585114  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4752  putative lipoprotein LpqF  38.14 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4838  putative lipoprotein LpqF  38.14 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0978  Beta-lactamase  26.96 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5138  putative lipoprotein LpqF  38.14 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  31.55 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0855  Beta-lactamase  26.61 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689397  normal  0.580537 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2328  Beta-lactamase  26.47 
 
 		 296 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3023  Beta-lactamase class A-like protein  25 
 
 		 277 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0538064  normal  0.499976 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1529  Beta-lactamase  28.04 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1011  beta-lactamase  27.31 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3972  beta-lactamase  26.41 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0506092  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2437  putative beta-lactamase precursor protein  28.94 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1476  hypothetical protein  23.49 
 
 		 496 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0446  Beta-lactamase  28.77 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1080  Beta-lactamase  28.44 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0392714  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6642  putative beta-lactamase precursor protein  28.39 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2085  Beta-lactamase  24.68 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  24.69 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2102  twin-arginine translocation pathway signal  24.44 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0733882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2148  Beta-lactamase  24.44 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748404  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5353  beta-lactamase  37.11 
 
 		 454 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  24.9 
 
 		 383 aa  55.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1000  putative beta-lactamase  35.65 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06370  beta-lactamase  27.86 
 
 		 283 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1746  hypothetical protein  23.81 
 
 		 337 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.470795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0366  Beta-lactamase  28.12 
 
 		 291 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0385843  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1418  Beta-lactamase  27.65 
 
 		 300 aa  54.3  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732214  hitchhiker  0.0000172267 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4574  Beta-lactamase  29.15 
 
 		 303 aa  54.3  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1041  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.52 
 
 		 258 aa  54.3  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1931  Beta-lactamase  28.28 
 
 		 335 aa  53.9  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>