80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1443 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  100 
 
 		 283 aa  563  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1446  beta-lactamase related protein  52 
 
 		 320 aa  258  9e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  50.18 
 
 		 292 aa  248  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3972  beta-lactamase  43.46 
 
 		 305 aa  165  5.9999999999999996e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0506092  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2386  beta-lactamase  36.3 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1458  beta-lactamase  35.56 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3960  hypothetical protein  36.13 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1419  beta-lactamase  34.98 
 
 		 305 aa  116  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.533278  hitchhiker  0.0000178355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2988  Beta-lactamase class A-like protein  34.59 
 
 		 286 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3301  beta-lactamase  33.1 
 
 		 304 aa  105  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  26.32 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  31.23 
 
 		 576 aa  83.2  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  32.78 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  30.08 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  32.71 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  26.97 
 
 		 504 aa  76.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  24.18 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  28.36 
 
 		 425 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  27.99 
 
 		 425 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  29.57 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  27.69 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  27.41 
 
 		 440 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  25.09 
 
 		 508 aa  67.4  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  24.7 
 
 		 803 aa  66.2  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0183  Beta-lactamase  27.61 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2552  Beta-lactamase  29.78 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802917  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  24.69 
 
 		 442 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  24.05 
 
 		 468 aa  58.9  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3212  beta-lactamase  26.22 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184009 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  25.9 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1460  Beta-lactamase  30.49 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00829053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  23.89 
 
 		 323 aa  55.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  24.42 
 
 		 375 aa  55.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7688  putative beta-lactamase  33.9 
 
 		 458 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  31.25 
 
 		 436 aa  54.3  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0351  beta-lactamase  28.25 
 
 		 296 aa  53.1  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.154712 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  28.37 
 
 		 452 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0174  Beta-lactamase  28.91 
 
 		 388 aa  50.4  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  23.97 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1646  beta lactamase-related protein, putative  33.63 
 
 		 399 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1291  beta-lactamase, putative  36.89 
 
 		 387 aa  49.7  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6642  putative beta-lactamase precursor protein  25.62 
 
 		 287 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5353  beta-lactamase  31.78 
 
 		 454 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1000  putative beta-lactamase  31.91 
 
 		 390 aa  49.3  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2437  putative beta-lactamase precursor protein  25.3 
 
 		 290 aa  48.9  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5138  putative lipoprotein LpqF  32.35 
 
 		 443 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4574  Beta-lactamase  29.13 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  23.46 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4752  putative lipoprotein LpqF  32.35 
 
 		 443 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4838  putative lipoprotein LpqF  32.35 
 
 		 443 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  23.6 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2352  Beta-lactamase  26.18 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445844 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1931  Beta-lactamase  38.61 
 
 		 335 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3627  hypothetical protein  31.76 
 
 		 332 aa  47  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5574  Beta-lactamase class A-like protein  30.3 
 
 		 266 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  30.53 
 
 		 293 aa  46.6  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3523  Beta-lactamase  27.84 
 
 		 338 aa  46.6  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33460  hypothetical protein  35.23 
 
 		 424 aa  46.6  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  22.73 
 
 		 259 aa  46.2  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6760  Beta-lactamase class A-like protein  38.14 
 
 		 271 aa  46.2  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0689983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  22.73 
 
 		 259 aa  46.2  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0788  beta-lactamase  28.57 
 
 		 418 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2102  twin-arginine translocation pathway signal  29.69 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0733882  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0228  twin-arginine translocation pathway signal  26.42 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2148  Beta-lactamase  29.69 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748404  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3361  beta-lactamase  29.13 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282427 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4021  Beta-lactamase  26.74 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3136  Beta-lactamase  33.86 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570574  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1080  Beta-lactamase  29.9 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0392714  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1090  putative beta-lactamase  32.2 
 
 		 443 aa  43.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.9523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13626  lipoprotein lpqF  31.58 
 
 		 452 aa  43.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7641599999999997e-27  normal  0.0255048 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2085  Beta-lactamase  29.69 
 
 		 296 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11921 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  24.18 
 
 		 271 aa  43.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0978  Beta-lactamase  26.36 
 
 		 304 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  22.43 
 
 		 383 aa  42.7  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2215  beta-lactamase  26.05 
 
 		 290 aa  42.7  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296886  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3689  Beta-lactamase  29.07 
 
 		 302 aa  42.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248785  normal  0.574937 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3839  Beta-lactamase class A-like  25.3 
 
 		 402 aa  42.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000233386  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3231  Beta-lactamase  28.03 
 
 		 299 aa  42  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3023  Beta-lactamase class A-like protein  26.47 
 
 		 277 aa  42  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0538064  normal  0.499976 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>