28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2988 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2988  Beta-lactamase class A-like protein  100 
 
 		 286 aa  563  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  38.2 
 
 		 292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  34.59 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1446  beta-lactamase related protein  31.6 
 
 		 320 aa  92.4  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2386  beta-lactamase  28.18 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  28.15 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1458  beta-lactamase  26.77 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1419  beta-lactamase  27.17 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.533278  hitchhiker  0.0000178355 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3972  beta-lactamase  28.93 
 
 		 305 aa  57  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0506092  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3301  beta-lactamase  29.54 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5574  Beta-lactamase class A-like protein  34.65 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3960  hypothetical protein  28.68 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  27.43 
 
 		 259 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  27.43 
 
 		 259 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  20.26 
 
 		 383 aa  49.7  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2085  Beta-lactamase  25.48 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11921 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2102  twin-arginine translocation pathway signal  25.2 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0733882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2148  Beta-lactamase  25.2 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.748404  normal  0.133415 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  25.27 
 
 		 291 aa  47  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  26.51 
 
 		 353 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  25.17 
 
 		 425 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  28.32 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  18.91 
 
 		 422 aa  44.3  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  25.17 
 
 		 425 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  24.6 
 
 		 452 aa  43.5  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1291  beta-lactamase, putative  31.58 
 
 		 387 aa  43.5  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  25.45 
 
 		 388 aa  43.5  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  25.81 
 
 		 286 aa  42.4  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0566092 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>