34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1419 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1419  beta-lactamase  100 
 
 		 305 aa  590  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.533278  hitchhiker  0.0000178355 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1458  beta-lactamase  93.46 
 
 		 306 aa  550  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2386  beta-lactamase  62.33 
 
 		 302 aa  365  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3960  hypothetical protein  66.67 
 
 		 295 aa  352  2.9999999999999997e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3301  beta-lactamase  47.59 
 
 		 304 aa  230  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  34.98 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1446  beta-lactamase related protein  31.58 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  28.82 
 
 		 292 aa  99.8  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0183  Beta-lactamase  35.07 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3972  beta-lactamase  29.45 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0506092  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  26.06 
 
 		 349 aa  58.9  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2988  Beta-lactamase class A-like protein  27.17 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  27.41 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  27.87 
 
 		 383 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  32.32 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  28.1 
 
 		 333 aa  52.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  23.19 
 
 		 274 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  23.9 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  24 
 
 		 423 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  25.38 
 
 		 442 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  23.72 
 
 		 508 aa  47.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  30.53 
 
 		 271 aa  47  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  18.52 
 
 		 424 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  29.6 
 
 		 425 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  27.41 
 
 		 296 aa  46.2  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  32.93 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6642  putative beta-lactamase precursor protein  27.82 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  29.6 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  32.26 
 
 		 292 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3212  beta-lactamase  26.14 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184009 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  20.8 
 
 		 468 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2257  hypothetical protein  32.05 
 
 		 434 aa  42.7  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2437  putative beta-lactamase precursor protein  28.23 
 
 		 290 aa  42.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2352  Beta-lactamase  33.93 
 
 		 297 aa  42.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445844 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>