42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3301 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3301  beta-lactamase  100 
 
 		 304 aa  596  1e-169  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1419  beta-lactamase  47.59 
 
 		 305 aa  247  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.533278  hitchhiker  0.0000178355 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1458  beta-lactamase  47.28 
 
 		 306 aa  246  4e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2386  beta-lactamase  44.67 
 
 		 302 aa  223  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3960  hypothetical protein  45.49 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  32.73 
 
 		 283 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1446  beta-lactamase related protein  29.64 
 
 		 320 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  29.97 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3972  beta-lactamase  31.29 
 
 		 305 aa  92.4  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0506092  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2437  putative beta-lactamase precursor protein  25.78 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2988  Beta-lactamase class A-like protein  29.54 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6642  putative beta-lactamase precursor protein  26.07 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  33.33 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  29.55 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3523  Beta-lactamase  38.89 
 
 		 338 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  30.95 
 
 		 349 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2552  Beta-lactamase  35.56 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0802917  normal  0.0118018 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0183  Beta-lactamase  26.51 
 
 		 306 aa  54.3  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  30.77 
 
 		 286 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  33.6 
 
 		 315 aa  53.5  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  28.57 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  22.99 
 
 		 274 aa  50.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  30.63 
 
 		 383 aa  49.7  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  26.45 
 
 		 333 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0446  Beta-lactamase  29.41 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  26.26 
 
 		 292 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3212  beta-lactamase  28.32 
 
 		 304 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184009 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0174  Beta-lactamase  36 
 
 		 388 aa  47  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.537021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  23.02 
 
 		 259 aa  46.6  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  23.02 
 
 		 259 aa  46.6  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1435  Beta-lactamase  24.35 
 
 		 295 aa  46.2  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  30 
 
 		 353 aa  45.8  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01220  penicillin-binding protein 7 precursor  37.11 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0351  beta-lactamase  27.62 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.154712 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  21.71 
 
 		 803 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0195  Beta-lactamase  31.86 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.210334  normal  0.167544 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  25.71 
 
 		 442 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1080  Beta-lactamase  30.19 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0392714  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5341  hypothetical protein  30.61 
 
 		 350 aa  42.7  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1011  beta-lactamase  35.14 
 
 		 290 aa  42.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6762  peptidase S11 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase 1  35.8 
 
 		 410 aa  42.4  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.128863  normal  0.321139 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  32.31 
 
 		 576 aa  42.4  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>