47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3972 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3972  beta-lactamase  100 
 
 		 305 aa  597  1e-170  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0506092  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  40.07 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  43.46 
 
 		 283 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1446  beta-lactamase related protein  40.48 
 
 		 320 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3960  hypothetical protein  31.49 
 
 		 295 aa  87.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2386  beta-lactamase  28.62 
 
 		 302 aa  86.7  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3301  beta-lactamase  31.86 
 
 		 304 aa  85.9  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1458  beta-lactamase  29.69 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1419  beta-lactamase  29.45 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.533278  hitchhiker  0.0000178355 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  31.25 
 
 		 576 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2988  Beta-lactamase class A-like protein  29.01 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  27.27 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6642  putative beta-lactamase precursor protein  27.49 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  30.08 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3023  Beta-lactamase class A-like protein  29.92 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0538064  normal  0.499976 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  26.92 
 
 		 436 aa  59.3  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  22.58 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  21.34 
 
 		 422 aa  57  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2437  putative beta-lactamase precursor protein  25.32 
 
 		 290 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  35.71 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  22.49 
 
 		 356 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6760  Beta-lactamase class A-like protein  37 
 
 		 271 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0689983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  20.66 
 
 		 259 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  20.66 
 
 		 259 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  23.21 
 
 		 424 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0183  Beta-lactamase  24.24 
 
 		 306 aa  50.1  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  27.94 
 
 		 425 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  27.75 
 
 		 293 aa  50.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3361  beta-lactamase  30.17 
 
 		 282 aa  49.3  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282427 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  27.82 
 
 		 271 aa  49.3  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33460  hypothetical protein  29.41 
 
 		 424 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  27.53 
 
 		 425 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  27.24 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1291  beta-lactamase, putative  26.15 
 
 		 387 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5574  Beta-lactamase class A-like protein  38.3 
 
 		 266 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7688  putative beta-lactamase  32.94 
 
 		 458 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  26.87 
 
 		 333 aa  46.2  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  25 
 
 		 504 aa  45.8  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1559  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.62 
 
 		 386 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4752  putative lipoprotein LpqF  30.69 
 
 		 443 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4838  putative lipoprotein LpqF  30.69 
 
 		 443 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5138  putative lipoprotein LpqF  30.69 
 
 		 443 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  22.48 
 
 		 508 aa  44.3  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  25.31 
 
 		 452 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  21.84 
 
 		 323 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0371  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.17 
 
 		 391 aa  43.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1748  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.86 
 
 		 414 aa  43.1  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>