35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2386 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2386  beta-lactamase  100 
 
 		 302 aa  590  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1458  beta-lactamase  64.67 
 
 		 306 aa  379  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1419  beta-lactamase  62.33 
 
 		 305 aa  365  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.533278  hitchhiker  0.0000178355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3960  hypothetical protein  65.96 
 
 		 295 aa  364  1e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3301  beta-lactamase  44.67 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  36.3 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  31.72 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1446  beta-lactamase related protein  31.69 
 
 		 320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3972  beta-lactamase  28.62 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0506092  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  36.36 
 
 		 576 aa  63.2  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2988  Beta-lactamase class A-like protein  28.18 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1607  Beta-lactamase  24.31 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  23.17 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3334  Beta-lactamase  30.37 
 
 		 349 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  28 
 
 		 424 aa  53.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  26.32 
 
 		 296 aa  53.1  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  21.48 
 
 		 323 aa  52.4  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3441  Beta-lactamase class A-like protein  30.95 
 
 		 347 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000016591  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6176  beta-lactamase  31.82 
 
 		 286 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0566092 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0183  Beta-lactamase  22.86 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3212  beta-lactamase  22.76 
 
 		 304 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184009 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3104  beta-lactamase  30.56 
 
 		 292 aa  50.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0156614  normal  0.401813 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1169  Beta-lactamase class A-like protein  27.14 
 
 		 383 aa  49.7  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1202  beta-lactamase, putative  20.87 
 
 		 259 aa  49.3  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1388  putative beta-lactamase  20.87 
 
 		 259 aa  49.3  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6642  putative beta-lactamase precursor protein  30.23 
 
 		 287 aa  49.3  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  26.78 
 
 		 315 aa  48.9  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0280  Beta-lactamase  25.62 
 
 		 353 aa  47.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  22.54 
 
 		 803 aa  46.6  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2437  putative beta-lactamase precursor protein  30.43 
 
 		 290 aa  46.6  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4151  beta-lactamase  22.58 
 
 		 300 aa  45.8  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  27.97 
 
 		 423 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  25.19 
 
 		 442 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2257  hypothetical protein  29.13 
 
 		 434 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  26.04 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>