14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2257 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2257  hypothetical protein  100 
 
 		 434 aa  887    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4936  protein-arginine deiminase  31.25 
 
 		 760 aa  67.4  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.370657 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  34.84 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  27.85 
 
 		 424 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1458  beta-lactamase  27.59 
 
 		 306 aa  51.6  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0183  beta-lactamase  28.8 
 
 		 436 aa  47.4  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1746  hypothetical protein  29.2 
 
 		 337 aa  46.6  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.470795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  25.22 
 
 		 425 aa  46.6  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  25.22 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  26.29 
 
 		 440 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  28.18 
 
 		 442 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  27.4 
 
 		 468 aa  43.9  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4394  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.04 
 
 		 804 aa  43.9  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2386  beta-lactamase  29.13 
 
 		 302 aa  43.9  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.721784 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>